More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2975 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2975  putative cytochrome P450  100 
 
 		 452 aa  907    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1747  putative cytochrome P450  37.41 
 
 		 454 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0264528  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4334  putative cytochrome P450  40.1 
 
 		 484 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4583  putative cytochrome P450  38.93 
 
 		 471 aa  246  9e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2751  putative cytochrome P450-family protein  37.91 
 
 		 426 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.581871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1142  putative cytochrome P450  39.69 
 
 		 421 aa  239  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2803  putative cytochrome P450-family protein  37.05 
 
 		 414 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348302  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4812  cytochrome P450-family protein  35.38 
 
 		 446 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5491  putative cytochrome P450  36.98 
 
 		 488 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767325  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2597  Cytochrome P450  35.6 
 
 		 500 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  0.048774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4420  putative cytochrome P450  35.51 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5490  putative cytochrome P450  32.43 
 
 		 437 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0347822  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4556  putative cytochrome P450  34.01 
 
 		 442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33530  cytochrome P450  34.68 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.101916  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1433  Cytochrome P450-like protein  31.95 
 
 		 424 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.667112  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3959  Cytochrome P450-like protein  33.56 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4184  cytochrome P450 monooxygenase  31.17 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1685  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  32.27 
 
 		 412 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  30.03 
 
 		 409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  28.06 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  33.63 
 
 		 417 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  28.83 
 
 		 416 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  31.14 
 
 		 426 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3059  cytochrome P450  28.61 
 
 		 417 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  28.31 
 
 		 419 aa  133  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  32.21 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  31.41 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  28.93 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  29.22 
 
 		 405 aa  132  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  31.03 
 
 		 400 aa  131  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  30.21 
 
 		 418 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  28.89 
 
 		 411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  26.56 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  27.73 
 
 		 401 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  25.56 
 
 		 420 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  28.27 
 
 		 402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  27.63 
 
 		 416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  29.66 
 
 		 402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  31.56 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2740  cytochrome P450  29.36 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  28.11 
 
 		 421 aa  117  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  30.43 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  27.9 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  27.54 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  29.89 
 
 		 400 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  29.07 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  28.04 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  29.28 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  28.8 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  25 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  28.15 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  29.28 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1836  cytochrome P450  28.04 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  24.92 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  30.72 
 
 		 407 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1245  cytochrome P450  27.98 
 
 		 397 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0231454  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  28.84 
 
 		 401 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  27.78 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  24.92 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  24.92 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4902  cytochrome P450  32.24 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  27.2 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  29.75 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  24.68 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  24.61 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  31.23 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  29.69 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  28.79 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  27.44 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  31.06 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  27.72 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  29.12 
 
 		 436 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3631  cytochrome P450  27.99 
 
 		 399 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  25 
 
 		 411 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  26.33 
 
 		 406 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  24.3 
 
 		 411 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  26.42 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  27.9 
 
 		 399 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  30.21 
 
 		 409 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  24.3 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  28.16 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  28.35 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  27.6 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  24.3 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  30.96 
 
 		 436 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  28.77 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2693  cytochrome P450  27.48 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198649  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  27.45 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  30 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  27.39 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  27.85 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  27.85 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  30.09 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  29.26 
 
 		 408 aa  104  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  29.87 
 
 		 400 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3696  cytochrome P450  23.48 
 
 		 380 aa  104  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  29.1 
 
 		 407 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0288  cytochrome P450  27.78 
 
 		 444 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0000866708  normal  0.107645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4585  cytochrome P450  26.49 
 
 		 399 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  27.33 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>