More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2353 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2353  serine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 423 aa  855    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0383526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13350  serine hydroxymethyltransferase  80.86 
 
 		 423 aa  670    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  80.91 
 
 		 420 aa  689    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0424  Glycine hydroxymethyltransferase  88.36 
 
 		 422 aa  752    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0767  serine hydroxymethyltransferase  73.46 
 
 		 445 aa  634    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0535  Glycine hydroxymethyltransferase  73.57 
 
 		 434 aa  625  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1663  Glycine hydroxymethyltransferase  72.3 
 
 		 435 aa  626  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3596  Glycine hydroxymethyltransferase  77.59 
 
 		 447 aa  620  1e-176  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2884  Glycine hydroxymethyltransferase  73.99 
 
 		 442 aa  614  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5659  Glycine hydroxymethyltransferase  78.33 
 
 		 421 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18800  serine hydroxymethyltransferase  75.43 
 
 		 412 aa  608  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.984145 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3705  serine hydroxymethyltransferase  74.83 
 
 		 453 aa  609  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27940  serine hydroxymethyltransferase  70.26 
 
 		 430 aa  606  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.958283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0754  Glycine hydroxymethyltransferase  70.82 
 
 		 428 aa  606  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128225  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3130  Glycine hydroxymethyltransferase  73.05 
 
 		 432 aa  606  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04680  serine hydroxymethyltransferase  70.45 
 
 		 426 aa  604  9.999999999999999e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1189  serine hydroxymethyltransferase  72.29 
 
 		 432 aa  604  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000045975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11114  serine hydroxymethyltransferase  71.53 
 
 		 426 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000666035  normal  0.472146 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0694  serine hydroxymethyltransferase  70.42 
 
 		 429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21370  serine hydroxymethyltransferase  73.08 
 
 		 422 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.100651  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10070  serine hydroxymethyltransferase  71.02 
 
 		 425 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.9411  normal  0.116151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3981  Glycine hydroxymethyltransferase  75 
 
 		 434 aa  602  1.0000000000000001e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.638114 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2501  Glycine hydroxymethyltransferase  71.36 
 
 		 427 aa  600  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4629  Glycine hydroxymethyltransferase  71.05 
 
 		 430 aa  591  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0657  Glycine hydroxymethyltransferase  73.11 
 
 		 452 aa  593  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1115  serine hydroxymethyltransferase  71.12 
 
 		 435 aa  592  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2989  Glycine hydroxymethyltransferase  72.34 
 
 		 440 aa  578  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  69.23 
 
 		 474 aa  580  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  62.56 
 
 		 413 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  63.46 
 
 		 415 aa  529  1e-149  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40970  serine hydroxymethyltransferase  61.69 
 
 		 417 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  59.85 
 
 		 412 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 412 aa  513  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  62.68 
 
 		 417 aa  513  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  61.17 
 
 		 415 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  61.56 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  62.14 
 
 		 411 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  59.67 
 
 		 418 aa  507  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6283  glycine hydroxymethyltransferase  60.66 
 
 		 419 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.461604 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  59.66 
 
 		 412 aa  501  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0759  serine hydroxymethyltransferase  61.45 
 
 		 417 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  60.19 
 
 		 420 aa  501  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  59.28 
 
 		 413 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  58.71 
 
 		 414 aa  500  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  58.71 
 
 		 414 aa  499  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0290  serine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 		 418 aa  501  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6203  serine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 		 417 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0377267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  57.04 
 
 		 416 aa  499  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2908  serine hydroxymethyltransferase  59.29 
 
 		 438 aa  498  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000280655  hitchhiker  0.00545149 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  59.28 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  60.39 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 415 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 413 aa  498  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0318  serine hydroxymethyltransferase  58.94 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  59.81 
 
 		 412 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  57.55 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  59.28 
 
 		 413 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60890  serine hydroxymethyltransferase  60.24 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 413 aa  497  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2477  serine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 		 417 aa  494  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2083  serine hydroxymethyltransferase  57.97 
 
 		 418 aa  494  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.112354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  60.68 
 
 		 412 aa  495  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  58.47 
 
 		 414 aa  498  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4270  serine hydroxymethyltransferase  59.52 
 
 		 417 aa  494  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5243  serine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 417 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71460  serine hydroxymethyltransferase  61.95 
 
 		 417 aa  498  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0197843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  59.47 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0671  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.557812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  61.54 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0702  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0603318  normal  0.0336909 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4031  serine hydroxymethyltransferase  59.42 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4632  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 431 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0703  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4877  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.402887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  57.73 
 
 		 412 aa  492  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1827  serine hydroxymethyltransferase  58.33 
 
 		 430 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.752619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4132  serine hydroxymethyltransferase  61.22 
 
 		 417 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000588766  normal  0.517769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1579  serine hydroxymethyltransferase  59.39 
 
 		 431 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4513  serine hydroxymethyltransferase  58.8 
 
 		 417 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0695784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4712  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0603  serine hydroxymethyltransferase  56.59 
 
 		 416 aa  490  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0841  glycine hydroxymethyltransferase  60.14 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33053  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  58.08 
 
 		 431 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  58.31 
 
 		 413 aa  491  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  59.19 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0004  serine hydroxymethyltransferase  56.8 
 
 		 416 aa  490  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0902  serine hydroxymethyltransferase  57.76 
 
 		 416 aa  488  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4885  serine hydroxymethyltransferase  60.49 
 
 		 417 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.994809  normal  0.551008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3094  glycine hydroxymethyltransferase  60.34 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1438  glycine hydroxymethyltransferase  58.95 
 
 		 421 aa  488  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0573  serine hydroxymethyltransferase  59.04 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0806  serine hydroxymethyltransferase  57.72 
 
 		 415 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>