More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1903 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6729  Acetyl-CoA C-acyltransferase  80.95 
 
 		 399 aa  663    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal  0.313674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1903  thiolase  100 
 
 		 400 aa  808    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0201769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1760  acetyl-CoA acetyltransferase  86.4 
 
 		 398 aa  705    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  80 
 
 		 407 aa  662    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1544  acetyl-CoA acetyltransferase  81.06 
 
 		 406 aa  660    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2267  acetyl-CoA acetyltransferase  83.72 
 
 		 394 aa  664    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0453724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1527  acetyl-CoA acetyltransferase  77.75 
 
 		 398 aa  637    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340504  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  89.17 
 
 		 399 aa  731    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2853  acetyl-CoA acetyltransferases  80.66 
 
 		 441 aa  654    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1469  acetyl-CoA acetyltransferase  77.83 
 
 		 398 aa  634  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336544  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6777  acetyl-CoA acetyltransferase  75.69 
 
 		 404 aa  628  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3548  acetyl-CoA acetyltransferase  76.13 
 
 		 435 aa  625  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000428807  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3017  acetyl-CoA acetyltransferase  78.92 
 
 		 400 aa  611  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2379  acetyl-CoA acetyltransferase  74.94 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259099 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1648  acetyl-CoA acetyltransferase  74.68 
 
 		 431 aa  607  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1330  Acetyl-CoA C-acyltransferase  78.55 
 
 		 402 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175377  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5179  acetyl-CoA acetyltransferase  79.23 
 
 		 405 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.974685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  76.03 
 
 		 416 aa  599  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0190156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1655  acetyl-CoA acetyltransferases  75.83 
 
 		 443 aa  600  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00972339  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16370  acetyl-CoA acetyltransferase  72.82 
 
 		 414 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  73.54 
 
 		 413 aa  580  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3502  acetyl-CoA acetyltransferase  71.79 
 
 		 403 aa  557  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1961  acetyl-CoA acetyltransferase  68.46 
 
 		 405 aa  544  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141974  hitchhiker  0.000049161 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  66.33 
 
 		 407 aa  530  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.908715  normal  0.564099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1403  acetyl-CoA acetyltransferases  59.24 
 
 		 397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485333  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.89 
 
 		 401 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.89 
 
 		 401 aa  298  8e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.64 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.64 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  41.75 
 
 		 400 aa  295  7e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.39 
 
 		 402 aa  290  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.24 
 
 		 387 aa  288  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.95 
 
 		 387 aa  288  9e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.36 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.09 
 
 		 387 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.93 
 
 		 387 aa  286  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.75 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.98 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.41 
 
 		 387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.14 
 
 		 401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  42.62 
 
 		 411 aa  282  8.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.56 
 
 		 387 aa  280  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03737  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.21 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.46 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.95 
 
 		 387 aa  279  5e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.95 
 
 		 404 aa  279  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  38.02 
 
 		 404 aa  279  7e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.57 
 
 		 387 aa  279  7e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  41.46 
 
 		 398 aa  278  8e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.21 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.41 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.31 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.31 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.46 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.31 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0377447 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  40.31 
 
 		 387 aa  277  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.21 
 
 		 387 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4364  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.31 
 
 		 387 aa  276  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.367821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.9 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.75 
 
 		 401 aa  277  3e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03736  acetyl-CoA acetyltransferase  40.31 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03685  hypothetical protein  40.31 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4226  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.31 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.032199  hitchhiker  0.00446338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.95 
 
 		 387 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.29 
 
 		 402 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  41.04 
 
 		 399 aa  276  5e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.21 
 
 		 387 aa  276  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2226  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.79 
 
 		 390 aa  276  6e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.857113  normal  0.149332 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.69 
 
 		 387 aa  275  8e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  42.93 
 
 		 399 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.21 
 
 		 387 aa  275  9e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.21 
 
 		 387 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.21 
 
 		 387 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.79 
 
 		 387 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.21 
 
 		 387 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.79 
 
 		 387 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.79 
 
 		 387 aa  275  9e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1933  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.02 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132677  normal  0.226024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.67 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.68 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.53 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.65 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.69 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.53 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.53 
 
 		 387 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.58 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.95 
 
 		 387 aa  273  3e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.53 
 
 		 387 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  42.43 
 
 		 401 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001989  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.19 
 
 		 391 aa  272  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.52 
 
 		 400 aa  272  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3950  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.9 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0475823 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.28 
 
 		 387 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.58 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.42 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.65 
 
 		 401 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  40.25 
 
 		 398 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.71 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.34 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>