77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1767 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1767  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  260  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1505  protein of unknown function DUF397  76.85 
 
 		 139 aa  173  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  hitchhiker  0.00205006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  53.97 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  52.63 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6018  protein of unknown function DUF397  42.22 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.260789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  51.72 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  48.48 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  49.23 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0787  hypothetical protein  46.15 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.679584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  50.77 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3856  hypothetical protein  50.77 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  38.96 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3476  hypothetical protein  50.77 
 
 		 72 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  48.28 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  45.31 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  50 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  41.54 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  48.48 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  46.97 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  41.79 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  41.54 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3763  protein of unknown function DUF397  33.7 
 
 		 83 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1969  protein of unknown function DUF397  45 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00185784  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37900  protein of unknown function (DUF397)  43.55 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20610  protein of unknown function (DUF397)  40.68 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.069741  normal  0.682793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3941  protein of unknown function DUF397  41.07 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272319  normal  0.0398541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14270  protein of unknown function (DUF397)  43.94 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  40.62 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1596  hypothetical protein  44.44 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8470  protein of unknown function DUF397  35.94 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0521  protein of unknown function DUF397  44.23 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  36.36 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6312  protein of unknown function DUF397  40.98 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61619  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1548  hypothetical protein  39.68 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0220305  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1588  hypothetical protein  39.68 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08900  protein of unknown function (DUF397)  39.19 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0905  hypothetical protein  40.91 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0955654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  42.86 
 
 		 65 aa  47.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  47.54 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  40.54 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  44.07 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  40 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12060  protein of unknown function (DUF397)  40.68 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  42.37 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20560  protein of unknown function (DUF397)  40.68 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3784  hypothetical protein  49.02 
 
 		 85 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  41.82 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  39.47 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12020  protein of unknown function (DUF397)  38.98 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  40.32 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5628  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36640  protein of unknown function (DUF397)  40 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0015395  normal  0.323981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1444  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.184265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1984  protein of unknown function DUF397  41.27 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00383957  normal  0.845583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  40.98 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  37.93 
 
 		 64 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 		 63 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  39.71 
 
 		 73 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  40 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0876  protein of unknown function DUF397  35.62 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0924  hypothetical protein  36.67 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.277312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  46.3 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  35.94 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0266  protein of unknown function DUF397  35.94 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.687438  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2128  protein of unknown function DUF397  41.46 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7553  hypothetical protein  35.71 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  37.7 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0708  hypothetical protein  45.28 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  38.18 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  35.94 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1445  protein of unknown function DUF397  42.55 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.12043  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  41.82 
 
 		 68 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>