More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1763 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  100 
 
 
410 aa  833    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  76.28 
 
 
404 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6516  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  74.02 
 
 
406 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.268585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2198  ABC transporter-like protein  72.06 
 
 
405 aa  590  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  0.643805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2331  ABC transporter related protein  74.75 
 
 
404 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.048634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  56.82 
 
 
406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  56.34 
 
 
426 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  55.09 
 
 
409 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  54.48 
 
 
374 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3954  ABC transporter related protein  58.29 
 
 
416 aa  428  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4879  ABC transporter related protein  56.97 
 
 
399 aa  428  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.431904  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  54.21 
 
 
370 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4683  ABC transporter related  52.24 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  51.73 
 
 
370 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  53.58 
 
 
388 aa  411  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  53.23 
 
 
370 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  53.94 
 
 
398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  52.2 
 
 
372 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  54.04 
 
 
364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0180  ABC transporter related protein  54.22 
 
 
393 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  52.35 
 
 
368 aa  401  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  51.74 
 
 
372 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5799  ABC transporter related protein  56.65 
 
 
398 aa  395  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5221  ABC transporter related  53.6 
 
 
381 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.533287  normal  0.501993 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  53.96 
 
 
402 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  52.49 
 
 
367 aa  398  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  52.01 
 
 
370 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  52.49 
 
 
367 aa  398  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  50.99 
 
 
369 aa  392  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5484  ABC transporter related  53.12 
 
 
382 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.211283  normal  0.256732 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  51.46 
 
 
370 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4944  ABC transporter related  52.46 
 
 
388 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.719486  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.75 
 
 
366 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  50.62 
 
 
366 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.75 
 
 
366 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  51.51 
 
 
370 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5747  ABC transporter related  53.23 
 
 
380 aa  391  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  51.13 
 
 
366 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.5 
 
 
366 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  52.61 
 
 
380 aa  388  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 
366 aa  388  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  50.61 
 
 
367 aa  390  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.5 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.5 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.5 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.5 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0810  ABC transporter related  53.87 
 
 
396 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  49.5 
 
 
369 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  51.94 
 
 
408 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06520  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  52.22 
 
 
393 aa  388  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.5 
 
 
366 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4614  ABC transporter related  51.91 
 
 
398 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  53.23 
 
 
380 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  50.99 
 
 
367 aa  384  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  49.39 
 
 
384 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  49.5 
 
 
369 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  50.74 
 
 
367 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  49.25 
 
 
366 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  50.86 
 
 
367 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1869  ABC transporter related protein  50.86 
 
 
389 aa  381  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  50.86 
 
 
367 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  58.33 
 
 
364 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  58.64 
 
 
364 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  58.64 
 
 
364 aa  380  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  58.64 
 
 
364 aa  378  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  49.88 
 
 
367 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4455  ABC transporter related protein  51.38 
 
 
378 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  51.85 
 
 
381 aa  381  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04610  ATPase component of ABC-type sugar transporter  51.98 
 
 
430 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  52.43 
 
 
405 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11263  sugar-transport ATP-binding protein ABC transporter sugC  53.77 
 
 
393 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  52.33 
 
 
405 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  49.75 
 
 
367 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  52.33 
 
 
405 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2541  ABC transporter-related protein  53.1 
 
 
399 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  52.49 
 
 
409 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  50.86 
 
 
358 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  48.43 
 
 
425 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0259  ABC transporter related protein  57.1 
 
 
366 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4657  ABC transporter related  59.2 
 
 
363 aa  371  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.400776  normal  0.472803 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0120  ABC transporter related protein  57.1 
 
 
366 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1202  ABC transporter related protein  51.12 
 
 
393 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4220  ABC transporter related  59.44 
 
 
363 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.886813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  52.38 
 
 
364 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1143  ABC transporter related  49.51 
 
 
376 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.402141  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2065  ABC transporter related  50.75 
 
 
366 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.424295  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7343  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.89 
 
 
369 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  51.74 
 
 
363 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4920  ABC transporter related  60.44 
 
 
378 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0020  ABC transporter related protein  58.82 
 
 
370 aa  366  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.925288  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1466  sugar ABC transporter ATPase  50.25 
 
 
375 aa  364  1e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  51.49 
 
 
360 aa  363  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0244  ABC transporter related protein  49.64 
 
 
368 aa  363  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.414588 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0492  ABC transporter related  47.63 
 
 
372 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.495421  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0971  ABC transporter related  47.63 
 
 
372 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7041  ABC transporter related  50.12 
 
 
365 aa  363  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0932  ABC transporter related  47.63 
 
 
372 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3490  sugar ABC transportor, ATP-binding protein  59.94 
 
 
370 aa  362  5.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.662972  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  47.94 
 
 
378 aa  362  7.0000000000000005e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31720  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  49.88 
 
 
376 aa  362  8e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>