223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1459 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1459  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  728    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00281125  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4580  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  82.72 
 
 		 371 aa  586  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1842  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  79.27 
 
 		 378 aa  584  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000090477  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  80.56 
 
 		 361 aa  584  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6473  ATPase, AAA family  80.67 
 
 		 355 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00194874  normal  0.0705527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1277  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  76.4 
 
 		 363 aa  560  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  76.26 
 
 		 366 aa  553  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2407  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  76.62 
 
 		 362 aa  538  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000130079  decreased coverage  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7991  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  72.98 
 
 		 364 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4022  ATPase  70.9 
 
 		 359 aa  536  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2047  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  77.59 
 
 		 380 aa  537  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.844262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4846  ATPase  69.75 
 
 		 360 aa  532  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.653979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2429  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  68.36 
 
 		 379 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.371786  hitchhiker  0.000116144 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3512  AAA family ATPase  67.68 
 
 		 364 aa  518  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1552  ATPase  75.85 
 
 		 395 aa  514  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00806987  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1512  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  68.17 
 
 		 366 aa  498  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal  0.71993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3739  ATPase  65.74 
 
 		 365 aa  498  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1512  ATPase  67.89 
 
 		 366 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.179479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1791  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  67.89 
 
 		 366 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0199364  normal  0.106767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0756  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  65.73 
 
 		 358 aa  488  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0255  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.34 
 
 		 361 aa  408  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000276642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0132  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.17 
 
 		 369 aa  298  8e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.45 
 
 		 373 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7549  moxR-like ATPase  48.2 
 
 		 363 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0027  hypothetical protein  44.84 
 
 		 371 aa  282  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467374  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2019  ATPase  44.32 
 
 		 370 aa  278  8e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10155  normal  0.253393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2927  ATPase  44.05 
 
 		 370 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3407  ATPase  44.14 
 
 		 372 aa  273  4.0000000000000004e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1220  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.53 
 
 		 365 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1397  ATPase  48.32 
 
 		 369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.741445  normal  0.388244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2511  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.88 
 
 		 385 aa  266  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0434152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0599  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.94 
 
 		 381 aa  265  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2882  ATPase  46.15 
 
 		 378 aa  261  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.567857  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3884  ATPase  46.05 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000147668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1887  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.18 
 
 		 363 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02048  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  42.35 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02006  hypothetical protein  42.35 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2253  AAA family ATPase  42.35 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1529  ATPase  42.62 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2407  AAA family ATPase  42.35 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3105  ATPase, AAA family  42.08 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.874723  normal  0.838574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0925  AAA family ATPase  42.35 
 
 		 362 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.81345  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1539  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.08 
 
 		 362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.153364  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1555  ATPase AAA_5  44.51 
 
 		 376 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.464923  normal  0.54994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1963  ATPase  38.72 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.22 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2354  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.95 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000632557  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  33.13 
 
 		 620 aa  72.8  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4949  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.56 
 
 		 297 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.596599  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  32.21 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  29.44 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  29.5 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.91 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.55 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  30.95 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  24.43 
 
 		 4979 aa  57.4  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3196  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.55 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  30.29 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  30.41 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  26.83 
 
 		 310 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  25.51 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  28.25 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  27.96 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.44 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  28.33 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  29.15 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  28.76 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  28.33 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  29.24 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.09 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  28.44 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  29.36 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.41 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12454  hypothetical protein  28.81 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.446115 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  29.44 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  26.94 
 
 		 299 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  28.39 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.67 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.98 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  27.33 
 
 		 263 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  27.33 
 
 		 263 aa  53.9  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.29 
 
 		 295 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1615  ATPase  24.4 
 
 		 308 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  28 
 
 		 318 aa  53.5  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  29.17 
 
 		 301 aa  53.1  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  28.73 
 
 		 306 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.78 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  33.53 
 
 		 348 aa  52.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.3 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  24.55 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  26.72 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.24 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.24 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  25 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1359  ATPase  30.59 
 
 		 655 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  27.62 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  32.26 
 
 		 400 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  31.25 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  26.02 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>