207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4278 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4278  ATPase  100 
 
 		 301 aa  632  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5079  ATPase  34.07 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.141996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5501  ATPase  30.98 
 
 		 346 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4668  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.45 
 
 		 373 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  29.79 
 
 		 307 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.79 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1297  cobalamin biosynthesis protein, CobS family  36.76 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0573751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  27.62 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4067  ATPase  29.5 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2608  ATPase  27.3 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.8348 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0106  AAA family ATPase  29.08 
 
 		 322 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0687561  normal  0.0739465 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.25 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.47653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2922  ATPase  28.87 
 
 		 338 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3433  ATPase  28.07 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  28.19 
 
 		 4917 aa  83.2  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  28.45 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01380  midasin, putative  29.11 
 
 		 4844 aa  80.5  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71553  predicted protein  29.3 
 
 		 4979 aa  79  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.473575 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  28.02 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  28.76 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  24.9 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5308  Cobaltochelatase  28.34 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1301  hypothetical protein  28.34 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.146345  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  29.67 
 
 		 263 aa  72  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  26.29 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  25.43 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  26.72 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4201  ATPase  25.83 
 
 		 324 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.72 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.52 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23838  predicted protein  26.07 
 
 		 1879 aa  68.9  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  26.72 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  26.67 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  25 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  26.67 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.72 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  26.42 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  26.7 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  26.7 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  26.67 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  26.7 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  27.73 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  27.01 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0394  cobalamin biosynthesis CobS-like protein  24.29 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0313111  hitchhiker  0.00145489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  26.19 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  24.42 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  25.96 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  25.24 
 
 		 260 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  22.86 
 
 		 277 aa  67  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  25.24 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  26.19 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  26.61 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  25.94 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  23.87 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  28.37 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  26.72 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  26.39 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  28.37 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  26.89 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.33 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  27.18 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  25 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  25 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7219  ATPase AAA_5  26.99 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2280  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  23.85 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  25.6 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  25.86 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  26.42 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  23.87 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  25.47 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  26.29 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  26.16 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  25.64 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3069  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  22.89 
 
 		 343 aa  62.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.51378  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  25.94 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  26.61 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  25.79 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  25.79 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  24.47 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  22.87 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  25 
 
 		 272 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2173  ATPase  27.78 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.651836  normal  0.906401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.1 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.23 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000122684  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0643  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  24.49 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.040533  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  25.85 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6496  cobalt chelatase, pCobS small subunit  23.01 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0251136  decreased coverage  0.00405526 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  25.47 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0318  cobalt chelatase, pCobS small subunit  22.59 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0350783 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  23.5 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7565  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  22.37 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  24.14 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.89 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1713  cobalt chelatase, pCobS small subunit  21.76 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736131  normal  0.451542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0498  cobalt chelatase, pCobS small subunit  23.29 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  26.92 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  23.98 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0687  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  24.14 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5623 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0080  cobaltochelatase, CobS subunit  22.71 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  25.64 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>