More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0957 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0957  superoxide dismutase  100 
 
 		 204 aa  416  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0616  Superoxide dismutase  80.39 
 
 		 204 aa  351  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2086  superoxide dismutase  76 
 
 		 226 aa  318  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242809  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3578  Superoxide dismutase  75.25 
 
 		 207 aa  315  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0209455  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1827  Superoxide dismutase  76 
 
 		 208 aa  315  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000201558 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2079  Superoxide dismutase  71.29 
 
 		 209 aa  298  4e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5044  superoxide dismutase  70.79 
 
 		 207 aa  296  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5132  superoxide dismutase  70.79 
 
 		 207 aa  296  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5423  superoxide dismutase  70.79 
 
 		 207 aa  296  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01340  superoxide dismutase  71.57 
 
 		 207 aa  295  3e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.345095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1888  Superoxide dismutase  69.31 
 
 		 207 aa  293  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.544416  hitchhiker  0.00197441 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00270  superoxide dismutase  68.32 
 
 		 209 aa  292  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19570  superoxide dismutase  68.32 
 
 		 209 aa  293  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00440124  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11340  superoxide dismutase  69.5 
 
 		 208 aa  293  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.551271  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0126  Superoxide dismutase  70.71 
 
 		 200 aa  291  6e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0230866  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1450  Superoxide dismutase  68.5 
 
 		 206 aa  290  8e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.755095  normal  0.0649698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5819  Superoxide dismutase  65.33 
 
 		 299 aa  287  7e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13882  superoxide dismutase [Fe] sodA  69.31 
 
 		 207 aa  286  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2012  Superoxide dismutase  71.51 
 
 		 209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2817  superoxide dismutase  66 
 
 		 203 aa  283  8e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8508  Superoxide dismutase  63.87 
 
 		 202 aa  278  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3497  superoxide dismutase  62.63 
 
 		 203 aa  274  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.912988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0732  Superoxide dismutase  61.22 
 
 		 200 aa  271  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15670  superoxide dismutase  67.2 
 
 		 207 aa  270  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33940  superoxide dismutase  64.62 
 
 		 207 aa  269  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.87857 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0161  Superoxide dismutase  63.05 
 
 		 209 aa  269  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0492  Superoxide dismutase  63.45 
 
 		 209 aa  261  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4045  Superoxide dismutase  50 
 
 		 269 aa  222  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1236  Superoxide dismutase  52.28 
 
 		 198 aa  214  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000554492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1523  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 304 aa  208  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1192  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 304 aa  208  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3822  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 304 aa  207  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000660557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1391  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 304 aa  208  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1561  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000819306 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1629  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1593  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.386764  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1378  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1351  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1350  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1489  superoxide dismutase  50.25 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2227  Superoxide dismutase  49.24 
 
 		 348 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000583713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0394  Superoxide dismutase  50.76 
 
 		 437 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1239  superoxide dismutase  48.95 
 
 		 198 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1715  superoxide dismutase  52.31 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.654042 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1059  superoxide dismutase  47.94 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1075  Superoxide dismutase  45.6 
 
 		 195 aa  191  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948241 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2010  superoxide dismutase  48.98 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00876227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0685  superoxide dismutase  47.67 
 
 		 208 aa  187  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0473365  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2167  superoxide dismutase  47.24 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3497  Superoxide dismutase  47.52 
 
 		 205 aa  184  7e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05577  Superoxide dismutase (EC 1.15.1.1) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P945]  48.19 
 
 		 223 aa  184  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.212062  normal  0.279078 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1711  superoxide dismutase  46.84 
 
 		 199 aa  184  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1916  superoxide dismutase  44.85 
 
 		 226 aa  184  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0120241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31067  Mn-Superoxide dismutase  45.6 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.076255  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3589  superoxide dismutase  44.72 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0641051  normal  0.0607523 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0229  superoxide dismutase  46.94 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1038  superoxide dismutase  46.94 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.170029  normal  0.225243 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1503  superoxide dismutase  47.24 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0226275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2365  superoxide dismutase  45.37 
 
 		 261 aa  177  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1705  superoxide dismutase  47.45 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0830  superoxide dismutase  45.07 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.168274  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1592  Superoxide dismutase  46.15 
 
 		 214 aa  174  7e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0179  Superoxide dismutase  45.32 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0690  manganese and iron superoxide dismutase  42.19 
 
 		 223 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63831  manganese-superoxide dismutase  46.97 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2237  Superoxide dismutase  43.28 
 
 		 241 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.420871 
 
 
-
 
NC_002620  TC0567  superoxide dismutase  45.32 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3008  superoxide dismutase  42.71 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2974  superoxide dismutase  44.33 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0340  Superoxide dismutase  42.36 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0394  superoxide dismutase  41.38 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.177491 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0762  superoxide dismutase (Mn)  45.23 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0276674  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2155  superoxide dismutase  47.24 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569828  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2392  Superoxide dismutase  44.06 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0920  Superoxide dismutase  43.78 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34151  manganese-superoxide dismutase  45.13 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.096588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00389  superoxide dismutase  43.5 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.283594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1445  manganese and iron superoxide dismutase  41.26 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2597  Superoxide dismutase  40.2 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000228513  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01590  manganese superoxide dismutase, putative  42.86 
 
 		 225 aa  167  7e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3693  superoxide dismutase  42.57 
 
 		 203 aa  167  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5082  superoxide dismutase  43.78 
 
 		 204 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3003  superoxide dismutase  43.63 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0438  Superoxide dismutase  45.23 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624115  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4269  superoxide dismutase  42.86 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58000  superoxide dismutase  42.79 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1167  Superoxide dismutase  46.53 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.374236 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0315  superoxide dismutase  43.22 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000304525  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4025  superoxide dismutase, Mn  43.14 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00239326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2181  superoxide dismutase  42.29 
 
 		 203 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801158  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0979  Superoxide dismutase  43.56 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.713822  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3014  Superoxide dismutase  40.89 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0845  superoxide dismutase, Mn  43.14 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.468897  normal  0.0284696 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4355  superoxide dismutase, Mn  43.14 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4177  superoxide dismutase, Mn  43.14 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000823929  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4015  superoxide dismutase, Mn  43.14 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4295  superoxide dismutase, Mn  43.14 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000676308 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4499  superoxide dismutase, Mn  43.14 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1103  superoxide dismutase  45.85 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.780298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4408  superoxide dismutase, Mn  43.14 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00543011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>