More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0803 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0803  DNA recombination protein RecA precursor  100 
 
 		 1177 aa  2403    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106303  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3294  recA protein  70 
 
 		 729 aa  911    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.088639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12750  DNA recombination protein RecA  53.57 
 
 		 790 aa  252  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000250397  normal  0.0414269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  85.61 
 
 		 378 aa  249  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  85.5 
 
 		 365 aa  239  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  85.29 
 
 		 367 aa  236  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  83.21 
 
 		 366 aa  236  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  82.17 
 
 		 376 aa  235  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1492  recA protein  82.27 
 
 		 348 aa  234  6e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.148956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  80.99 
 
 		 345 aa  234  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  80.14 
 
 		 347 aa  233  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  79.72 
 
 		 347 aa  232  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  78.42 
 
 		 346 aa  232  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  53.82 
 
 		 350 aa  231  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  83.72 
 
 		 350 aa  231  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  82.44 
 
 		 345 aa  231  7e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  83.82 
 
 		 350 aa  231  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  83.82 
 
 		 350 aa  231  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  83.82 
 
 		 347 aa  230  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  78.57 
 
 		 345 aa  230  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  83.82 
 
 		 347 aa  230  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  83.82 
 
 		 347 aa  230  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  58.52 
 
 		 345 aa  229  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  83.82 
 
 		 352 aa  229  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  83.82 
 
 		 359 aa  229  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  83.09 
 
 		 348 aa  228  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  82.35 
 
 		 348 aa  227  8e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  82.35 
 
 		 364 aa  227  8e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3919  recA protein  83.82 
 
 		 344 aa  227  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  82.35 
 
 		 351 aa  227  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  81.62 
 
 		 347 aa  225  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  80.15 
 
 		 368 aa  225  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2431  recombinase A  80.74 
 
 		 343 aa  225  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.173685  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  81.62 
 
 		 351 aa  224  4.9999999999999996e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  81.62 
 
 		 350 aa  224  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3521  recA protein (recombinase A), N-terminal region  79.26 
 
 		 208 aa  224  8e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000289981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3792  RecA protein  79.26 
 
 		 208 aa  224  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000169081 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3539  recA protein (recombinase A), N-terminal region  79.26 
 
 		 208 aa  224  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000000558928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3827  protein RecA  79.26 
 
 		 208 aa  224  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000195249  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3550  recombinase A  79.26 
 
 		 343 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000225228  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  78.52 
 
 		 364 aa  223  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3814  recombinase A  79.26 
 
 		 343 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000388705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3629  recombinase A  79.26 
 
 		 343 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000256078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1421  recombinase A  79.26 
 
 		 343 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173809  normal  0.454678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  80.88 
 
 		 383 aa  223  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  78.63 
 
 		 352 aa  223  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3878  recombinase A  79.26 
 
 		 343 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000422739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  80.15 
 
 		 349 aa  222  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  77.78 
 
 		 418 aa  220  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  77.21 
 
 		 344 aa  219  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  77.04 
 
 		 358 aa  218  4e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  76.3 
 
 		 347 aa  218  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  76.3 
 
 		 379 aa  216  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  76.3 
 
 		 352 aa  217  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  76.3 
 
 		 352 aa  217  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  77.04 
 
 		 355 aa  217  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  48.69 
 
 		 362 aa  216  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  77.78 
 
 		 348 aa  216  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  75.56 
 
 		 343 aa  215  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  76.3 
 
 		 346 aa  215  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  78.52 
 
 		 349 aa  214  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  75 
 
 		 357 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  75.56 
 
 		 344 aa  214  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2093  recombinase A  74.81 
 
 		 379 aa  213  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00668121  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  75.56 
 
 		 352 aa  213  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  77.1 
 
 		 346 aa  212  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0077  recombinase A  73.33 
 
 		 379 aa  212  4e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1382  recombinase A  76.3 
 
 		 376 aa  211  5e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.217546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  73.33 
 
 		 356 aa  211  6e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  74.81 
 
 		 345 aa  211  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0400  recombinase A  74.26 
 
 		 387 aa  211  9e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.392545  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  74.81 
 
 		 352 aa  210  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1371  recombinase A  73.33 
 
 		 347 aa  210  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.150356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1345  recombinase A  73.33 
 
 		 347 aa  210  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0958775  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  71.32 
 
 		 348 aa  209  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  71.85 
 
 		 357 aa  209  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  76.3 
 
 		 385 aa  210  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  74.81 
 
 		 361 aa  209  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  72.59 
 
 		 343 aa  209  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  73.53 
 
 		 379 aa  209  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03480  RecA  72.59 
 
 		 337 aa  208  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  72.59 
 
 		 356 aa  208  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  71.85 
 
 		 360 aa  208  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  69.12 
 
 		 390 aa  207  7e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  74.07 
 
 		 341 aa  207  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2553  recA protein  68.15 
 
 		 352 aa  207  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.159054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  73.33 
 
 		 336 aa  207  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4134  recA protein  71.11 
 
 		 345 aa  206  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00773385  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  73.33 
 
 		 352 aa  206  2e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  71.32 
 
 		 362 aa  206  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  74.81 
 
 		 341 aa  206  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  73.33 
 
 		 352 aa  206  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  71.85 
 
 		 364 aa  206  3e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0858  recA protein  72.93 
 
 		 349 aa  205  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.873565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0852  recombinase A  73.33 
 
 		 349 aa  205  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.173922  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  72.59 
 
 		 358 aa  205  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4925  recombinase A  72.59 
 
 		 358 aa  205  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.705325  normal  0.253637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0745  recA protein  73.68 
 
 		 349 aa  205  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.624125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0986  recA protein  74.81 
 
 		 356 aa  205  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000028976  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  69.85 
 
 		 350 aa  205  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>