More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0701 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0701  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 1421 aa  2877    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05120  nuclease-like protein  40.75 
 
 		 1408 aa  793    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.61882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2952  serine/threonine protein kinase  33.54 
 
 		 1406 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1544  serine/threonine protein kinase  33.98 
 
 		 1387 aa  542  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0113  protein kinase domain-containing protein  34.23 
 
 		 1400 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4285  protein kinase  30.55 
 
 		 1427 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3204  protein kinase  30.16 
 
 		 1405 aa  382  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.375808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4796  NERD domain-containing protein  38.87 
 
 		 316 aa  207  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  23.16 
 
 		 746 aa  84  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.64 
 
 		 863 aa  83.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.18 
 
 		 715 aa  82.8  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.87 
 
 		 647 aa  81.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  27.4 
 
 		 626 aa  79.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1671  protein kinase  28.52 
 
 		 617 aa  79.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2809  serine/threonine kinase protein  27.84 
 
 		 618 aa  78.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  27.49 
 
 		 1032 aa  78.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3960  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.96 
 
 		 550 aa  77.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  26.69 
 
 		 625 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28923  predicted protein  23.83 
 
 		 348 aa  77  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.125872  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.16 
 
 		 880 aa  76.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.44 
 
 		 1804 aa  76.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.62 
 
 		 579 aa  77  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  26.33 
 
 		 625 aa  75.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1201  serine/threonine protein kinase  23.4 
 
 		 1413 aa  75.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0875665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  27.15 
 
 		 1032 aa  75.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.46 
 
 		 676 aa  75.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.37 
 
 		 2017 aa  75.1  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 		 624 aa  75.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  26.12 
 
 		 666 aa  74.7  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 		 624 aa  75.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 		 624 aa  75.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  28.9 
 
 		 1018 aa  74.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04650  SNF1A/AMP-activated protein kinase, putative  25.95 
 
 		 751 aa  73.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  27.76 
 
 		 1053 aa  74.3  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  26.77 
 
 		 1850 aa  72.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  30.91 
 
 		 1795 aa  72.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.77 
 
 		 1805 aa  72.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68332  carbon catabolite derepressing ser/thr protein kinase  24.72 
 
 		 580 aa  72.8  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.721612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  28.42 
 
 		 1794 aa  72.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  24.66 
 
 		 750 aa  72  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  24.82 
 
 		 664 aa  72  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  24.82 
 
 		 664 aa  72  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1757  serine/threonine protein kinase  27.83 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.90325  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01630  serine/threonine-protein kinase, putative  22.51 
 
 		 1022 aa  71.6  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0459  serine/threonine protein kinase  24.91 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.14812  normal  0.0434619 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01100  proliferation-associated serine/threonine protein kinase, putative  24.9 
 
 		 575 aa  71.2  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0510  serine/threonine protein kinase  27.3 
 
 		 661 aa  70.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  27.5 
 
 		 1057 aa  70.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.1 
 
 		 943 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  29.1 
 
 		 533 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  29.77 
 
 		 555 aa  70.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  28.12 
 
 		 554 aa  70.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  26.7 
 
 		 1934 aa  70.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.4 
 
 		 594 aa  70.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3947  serine/threonine protein kinase  26.12 
 
 		 602 aa  70.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0694263  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1116  Serine/threonine protein kinase-like  25.09 
 
 		 820 aa  69.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3873  serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 		 545 aa  69.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.3 
 
 		 681 aa  69.7  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 		 490 aa  69.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5322  serine/threonine protein kinase  27.19 
 
 		 671 aa  69.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  27.64 
 
 		 502 aa  69.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  27.31 
 
 		 604 aa  69.3  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  31.14 
 
 		 758 aa  69.3  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0991  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.6 
 
 		 551 aa  69.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  30.53 
 
 		 566 aa  69.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2492  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.65 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3485  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 754 aa  68.6  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000103616  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.07 
 
 		 664 aa  68.6  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 		 585 aa  67.8  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.59 
 
 		 650 aa  68.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 628 aa  68.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  23.72 
 
 		 889 aa  68.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3486  serine/threonine protein kinase  26.28 
 
 		 989 aa  67.8  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00873447  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0446  serine/threonine protein kinase  24.2 
 
 		 519 aa  68.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6472  serine/threonine protein kinase  27.99 
 
 		 497 aa  68.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0240846 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1461  protein kinase, putative  22.3 
 
 		 1376 aa  67  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  21.38 
 
 		 565 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  27.48 
 
 		 1034 aa  67  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1553  serine/threonine protein kinase  28.01 
 
 		 299 aa  67.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0134  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27 
 
 		 700 aa  67.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  25.26 
 
 		 615 aa  67.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 		 562 aa  67  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.340026 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07695  AMP-activated serine/threonine protein kinase (Eurofung)  23.88 
 
 		 616 aa  66.6  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0235538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  27.43 
 
 		 1774 aa  66.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04050  conserved hypothetical protein  26.59 
 
 		 473 aa  66.6  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  23.05 
 
 		 638 aa  67  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2187  serine/threonine protein kinase  25.3 
 
 		 477 aa  66.6  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0818693 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.37 
 
 		 916 aa  67  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  28.76 
 
 		 599 aa  66.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0119  protein kinase  28.83 
 
 		 519 aa  66.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.251317  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  25.94 
 
 		 582 aa  67  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 		 505 aa  67  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  26.73 
 
 		 2077 aa  66.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  26.22 
 
 		 661 aa  66.2  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.26 
 
 		 1044 aa  66.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2112  protein kinase  30.45 
 
 		 477 aa  66.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  24.24 
 
 		 625 aa  65.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 		 651 aa  65.9  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40725  predicted protein  26.29 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.316803  normal  0.0251732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>