More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1748 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1748  ribosome small subunit-dependent GTPase A  100 
 
 
293 aa  592  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000167014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2303  ribosome small subunit-dependent GTPase A  51.03 
 
 
294 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.304027  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1068  ribosome-associated GTPase  49.83 
 
 
293 aa  295  5e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1715  ribosome small subunit-dependent GTPase A  48.62 
 
 
292 aa  288  7e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1958  ribosome-associated GTPase  50.17 
 
 
293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3960  ribosome-associated GTPase  47.44 
 
 
293 aa  278  9e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.673313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1283  ribosome-associated GTPase  47.44 
 
 
293 aa  278  9e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0350933  hitchhiker  0.000819324 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3903  ribosome-associated GTPase  48.45 
 
 
293 aa  277  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3712  ribosome-associated GTPase  48.46 
 
 
293 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0352319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3602  ribosome-associated GTPase  48.46 
 
 
293 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000137277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3620  ribosome-associated GTPase  48.45 
 
 
293 aa  277  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0108869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3999  ribosome-associated GTPase  48.46 
 
 
293 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.164627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3875  ribosome-associated GTPase  48.46 
 
 
293 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01425e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3909  ribosome-associated GTPase  48.45 
 
 
293 aa  277  1e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3684  ribosome-associated GTPase  47.78 
 
 
293 aa  275  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2513  ribosome-associated GTPase  47.08 
 
 
293 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00240237  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2485  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.06 
 
 
291 aa  261  8e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1310  ribosome small subunit-dependent GTPase A  46.13 
 
 
292 aa  256  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.972269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1326  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.18 
 
 
292 aa  251  7e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1536  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.64 
 
 
305 aa  249  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1770  ribosome-associated GTPase  45.3 
 
 
290 aa  249  4e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0913  GTPase EngC  46.53 
 
 
290 aa  248  6e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000815657  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1697  ribosome small subunit-dependent GTPase A  49.43 
 
 
302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1587  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.55 
 
 
293 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1046  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.89 
 
 
290 aa  240  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0232344  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0575  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.26 
 
 
294 aa  239  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1907  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.21 
 
 
300 aa  239  4e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000047717  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1777  ribosome-associated GTPase  43.9 
 
 
290 aa  238  6.999999999999999e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1013  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.58 
 
 
295 aa  237  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1117  ribosome small subunit-dependent GTPase A  47.58 
 
 
293 aa  237  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2327  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.91 
 
 
319 aa  235  8e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549322 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09970  ribosome small subunit-dependent GTPase A  43.6 
 
 
282 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1990  ribosome-associated GTPase  45.22 
 
 
287 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1708  ribosome-associated GTPase  44.85 
 
 
287 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2198  ribosome-associated GTPase  43.05 
 
 
307 aa  228  7e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1505  ribosome small subunit-dependent GTPase A  45.8 
 
 
288 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.57 
 
 
296 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1168  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.96 
 
 
296 aa  225  8e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310528  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1510  GTPase  43 
 
 
295 aa  223  2e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.116173  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  39.87 
 
 
319 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1224  GTPase EngC  41.72 
 
 
294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2354  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.54 
 
 
300 aa  215  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.559987  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0668  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.14 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000332058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0787  hypothetical protein  39.86 
 
 
291 aa  212  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2475  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.44 
 
 
296 aa  205  7e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.818864  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3806  ribosome-associated GTPase  39.46 
 
 
306 aa  205  9e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.482923  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0558  ribosome-associated GTPase  43.73 
 
 
380 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.752261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3595  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.72 
 
 
306 aa  203  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1305  hypothetical protein  37.93 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.276493  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1280  hypothetical protein  37.93 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.390036  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3189  ribosome-associated GTPase  38.93 
 
 
376 aa  198  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2930  ribosome-associated GTPase  38.93 
 
 
405 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1982  ribosome small subunit-dependent GTPase A  42.05 
 
 
370 aa  196  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07390  ribosome-associated GTPase  35.16 
 
 
315 aa  194  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0765  GTPase  36.75 
 
 
297 aa  192  6e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0138143  hitchhiker  0.000000123539 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf718  GTPase YjeQ/EngC  36.84 
 
 
279 aa  191  9e-48  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0549  ribosome small subunit-dependent GTPase A  40.4 
 
 
375 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.938885  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0387  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.81 
 
 
318 aa  189  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000179584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.34 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1341  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.86 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.85094  normal  0.38449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0381  ribosome-associated GTPase  38.38 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3198  ribosome-associated GTPase  35.86 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0513  ribosome-associated GTPase  35.43 
 
 
325 aa  182  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2400  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.7 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0261  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.63 
 
 
300 aa  182  6e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  36.16 
 
 
316 aa  182  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0329  GTPase EngC  37.92 
 
 
319 aa  181  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000202541  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2044  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.14 
 
 
293 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4690  ribosome-associated GTPase  37 
 
 
364 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1753  ribosome-associated GTPase  36.51 
 
 
374 aa  176  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0099  ribosome small subunit-dependent GTPase A  38.44 
 
 
307 aa  176  6e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0211  ribosome small subunit-dependent GTPase A  35.86 
 
 
301 aa  175  7e-43  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0429  ribosome-associated GTPase  34.52 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2071  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.47 
 
 
322 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0137612  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  33.65 
 
 
315 aa  172  7.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  38.06 
 
 
343 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2076  ribosome-associated GTPase  36.64 
 
 
350 aa  169  6e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.822356 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0355  ribosome-associated GTPase  35.22 
 
 
312 aa  168  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3548  ribosome-associated GTPase  33.44 
 
 
354 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.814958  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  34.97 
 
 
337 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  34.43 
 
 
332 aa  166  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1204  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.67 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16978  predicted protein  37 
 
 
352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.609433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2727  ribosome-associated GTPase  33.77 
 
 
307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.853912  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4179  ribosome-associated GTPase  34.97 
 
 
352 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  34.2 
 
 
354 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3004  ribosome-associated GTPase  35.44 
 
 
289 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.587446  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  34.74 
 
 
354 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  34.28 
 
 
353 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl222  GTPase  33.45 
 
 
298 aa  160  2e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  34.42 
 
 
340 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  34.42 
 
 
354 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  34.42 
 
 
354 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5830  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.21 
 
 
308 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.700319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  34.53 
 
 
354 aa  159  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  35.71 
 
 
343 aa  158  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1099  ribosome-associated GTPase  34.97 
 
 
350 aa  158  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000548544  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  33.77 
 
 
354 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4903  ribosome-associated GTPase  36.47 
 
 
343 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2677  putative GTPase  33.94 
 
 
343 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>