191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3247 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  100 
 
 		 172 aa  345  1e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  64.74 
 
 		 176 aa  205  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  57.95 
 
 		 175 aa  200  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0721  CheW protein  58.86 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0750  CheW protein  58.86 
 
 		 176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  57.71 
 
 		 174 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  55.11 
 
 		 176 aa  196  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1016  CheW protein  38 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  33.55 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.13 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  30.6 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  26.83 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  28.85 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  26.75 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  26.57 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  29.92 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  30.61 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  28.48 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  28.48 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  28.3 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  27.21 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3777  CheW protein  27.39 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  32 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  28.69 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1846  putative CheW protein  28.57 
 
 		 568 aa  54.3  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0940518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  27.18 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2285  CheW protein  34.38 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  27.18 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2029  CheW protein  30.32 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1768  CheW protein  30.88 
 
 		 514 aa  52  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110635 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  35.48 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2817  CheW protein  36.59 
 
 		 141 aa  52  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  28.8 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  32.67 
 
 		 299 aa  51.6  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  36.79 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  31.68 
 
 		 299 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  31.68 
 
 		 299 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  31.68 
 
 		 299 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  32.17 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  31.82 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  34.31 
 
 		 314 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  32.38 
 
 		 308 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  25.17 
 
 		 515 aa  49.7  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  34.15 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  31.82 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2527  CheW-like protein  35.64 
 
 		 297 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  28.87 
 
 		 299 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  26.09 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  30.08 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  28.87 
 
 		 299 aa  48.5  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  25.71 
 
 		 444 aa  48.1  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  25.38 
 
 		 159 aa  48.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2936  putative CheW protein  30.07 
 
 		 298 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.243491 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1561  response regulator receiver modulated CheW protein  30.07 
 
 		 298 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0294399  hitchhiker  0.00399966 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  32.18 
 
 		 528 aa  47.8  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2796  putative CheW protein  30.07 
 
 		 298 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  30.94 
 
 		 157 aa  47.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2816  putative CheW protein  30.07 
 
 		 298 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2190  CheW protein  28.37 
 
 		 199 aa  47.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  32.41 
 
 		 163 aa  47.8  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0227  CheW protein  34.07 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0960  CheW protein  42.25 
 
 		 779 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0366627  normal  0.772368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  30.53 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  26.35 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  30.69 
 
 		 298 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  29.73 
 
 		 301 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  26 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  28.89 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4463  putative CheW protein  31.73 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0229  putative CheW protein  34.07 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1391  CheW protein  23.74 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  37.93 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  29.31 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  27.64 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  27.61 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  31.03 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3073  CheW protein  29.37 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325581 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  29.79 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  29.5 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0150  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.53 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  30.69 
 
 		 295 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  27.42 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  27.42 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  28.21 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  26.49 
 
 		 205 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1381  CheW protein  27.5 
 
 		 245 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.519881  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  33.64 
 
 		 317 aa  45.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  27.95 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2689  CheW protein  30.17 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  26.27 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  28.89 
 
 		 218 aa  44.7  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  32.32 
 
 		 306 aa  44.7  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  35 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  27.46 
 
 		 300 aa  44.7  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0172  putative CheW protein  26.62 
 
 		 146 aa  44.7  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0865787  normal  0.924879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  29.41 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  27.97 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  32.41 
 
 		 185 aa  44.3  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  27.97 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  27.97 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>