153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2423 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2423  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
213 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  53.18 
 
 
218 aa  191  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  50.94 
 
 
203 aa  188  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  53.95 
 
 
213 aa  177  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  46.48 
 
 
212 aa  171  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  46.48 
 
 
212 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  46.48 
 
 
212 aa  170  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  48.62 
 
 
218 aa  169  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  46.7 
 
 
203 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  46.7 
 
 
203 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  46.7 
 
 
203 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  45.54 
 
 
212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  48.59 
 
 
207 aa  157  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  43.87 
 
 
243 aa  153  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  66.99 
 
 
316 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  44.5 
 
 
220 aa  148  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  43.4 
 
 
217 aa  143  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  40.36 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  46.98 
 
 
204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  45.7 
 
 
219 aa  139  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  39.55 
 
 
214 aa  137  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  38.89 
 
 
233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  41.01 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2711  hypothetical protein  46.26 
 
 
206 aa  129  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592555  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0889  protein of unknown function DUF162  44.34 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3036  protein of unknown function DUF162  40.57 
 
 
203 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12930  hypothetical protein  41.1 
 
 
251 aa  94.4  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109611  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  28.64 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  31.03 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  30.64 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0391  hypothetical protein  32.61 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.633551  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  30 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  29.8 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  28.57 
 
 
218 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  24 
 
 
215 aa  61.6  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  30.04 
 
 
233 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  31 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  28.76 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  28.02 
 
 
231 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  26.43 
 
 
222 aa  58.9  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  39.58 
 
 
219 aa  57.8  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  25.19 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1053  hypothetical protein  29.46 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000873871  normal  0.361547 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  35.71 
 
 
142 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2931  protein of unknown function DUF162  29.02 
 
 
220 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00316375  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0750  hypothetical protein  24.57 
 
 
223 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.73294  normal  0.342361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4214  hypothetical protein  30.67 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000286287  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  37.08 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3136  hypothetical protein  31.58 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.110641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  29.91 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  27.27 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  28.64 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  26.38 
 
 
231 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  26.38 
 
 
231 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  36.56 
 
 
224 aa  52.4  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  35.05 
 
 
228 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  30 
 
 
203 aa  52.4  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  25.74 
 
 
234 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  26.38 
 
 
231 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  26.38 
 
 
231 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  30.77 
 
 
230 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  30.77 
 
 
230 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  31.43 
 
 
223 aa  52  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  30.77 
 
 
230 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3244  hypothetical protein  37.11 
 
 
205 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00147785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1867  protein of unknown function DUF162  29.56 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0809  hypothetical protein  37.5 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0239766  normal  0.348083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  35.96 
 
 
220 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  38.46 
 
 
212 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  21.76 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  29.81 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1411  hypothetical protein  27.72 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00806317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  30.85 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2811  hypothetical protein  32.48 
 
 
254 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00389939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0511  hypothetical protein  32.48 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2929  YvbY  32.48 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000182781  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1898  hypothetical protein  26.21 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.482836  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2500  hypothetical protein  32.48 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000206523  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2782  hypothetical protein  32.48 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000618138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2872  hypothetical protein  32.48 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1823  hypothetical protein  32.48 
 
 
220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0164958  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1315  protein of unknown function DUF162  36.67 
 
 
183 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000245285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2910  protein of unknown function DUF162  35.11 
 
 
183 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0390  protein of unknown function DUF162  26.89 
 
 
241 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  32.99 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0962  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
239 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898925  normal  0.0872687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43100  hypothetical protein  32.65 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110434  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2896  hypothetical protein  27.88 
 
 
234 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0416847  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0897  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
239 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0565  protein of unknown function DUF162  29.57 
 
 
189 aa  48.9  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.476806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0622  hypothetical protein  28.44 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0626984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1101  hypothetical protein  28.44 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000778046  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1466  hypothetical protein  29.41 
 
 
375 aa  48.9  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1060  hypothetical protein  28.44 
 
 
220 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000437379  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  31.25 
 
 
213 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0977  hypothetical protein  32.17 
 
 
220 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0260458  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2202  hypothetical protein  29.33 
 
 
220 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000275393  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1717  protein of unknown function DUF162  27.78 
 
 
223 aa  48.5  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  31.78 
 
 
174 aa  48.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  21.3 
 
 
218 aa  48.1  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>