More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1760 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2267  acetyl-CoA acetyltransferase  82.86 
 
 
394 aa  656    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0453724 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1903  thiolase  86.4 
 
 
400 aa  676    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0201769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1760  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
398 aa  805    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0597198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6729  Acetyl-CoA C-acyltransferase  81.5 
 
 
399 aa  666    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal  0.313674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1469  acetyl-CoA acetyltransferase  79.29 
 
 
398 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336544  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  80.65 
 
 
407 aa  654    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2853  acetyl-CoA acetyltransferases  81.12 
 
 
441 aa  652    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1544  acetyl-CoA acetyltransferase  81.68 
 
 
406 aa  659    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  84.21 
 
 
399 aa  689    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1527  acetyl-CoA acetyltransferase  78.79 
 
 
398 aa  639    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340504  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6777  acetyl-CoA acetyltransferase  77.53 
 
 
404 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3548  acetyl-CoA acetyltransferase  75.88 
 
 
435 aa  621  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000428807  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2379  acetyl-CoA acetyltransferase  76.01 
 
 
396 aa  622  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3017  acetyl-CoA acetyltransferase  78.09 
 
 
400 aa  610  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1330  Acetyl-CoA C-acyltransferase  77.72 
 
 
402 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175377  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5179  acetyl-CoA acetyltransferase  78.09 
 
 
405 aa  600  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.974685  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16370  acetyl-CoA acetyltransferase  74.36 
 
 
414 aa  600  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.30355  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1648  acetyl-CoA acetyltransferase  73.91 
 
 
431 aa  598  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822923 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  74.48 
 
 
416 aa  595  1e-169  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0190156  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1655  acetyl-CoA acetyltransferases  75.57 
 
 
443 aa  595  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00972339  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  76.09 
 
 
413 aa  585  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0375657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3502  acetyl-CoA acetyltransferase  72.93 
 
 
403 aa  559  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1961  acetyl-CoA acetyltransferase  70.1 
 
 
405 aa  545  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141974  hitchhiker  0.000049161 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  67.68 
 
 
407 aa  539  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.908715  normal  0.564099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1403  acetyl-CoA acetyltransferases  59.75 
 
 
397 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.485333  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.21 
 
 
401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.21 
 
 
401 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.21 
 
 
401 aa  301  9e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.21 
 
 
401 aa  301  9e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.67 
 
 
402 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  42.21 
 
 
400 aa  299  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.07 
 
 
404 aa  298  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.49 
 
 
404 aa  296  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  44.55 
 
 
411 aa  293  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.79 
 
 
401 aa  291  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.03 
 
 
406 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  44.3 
 
 
399 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.5 
 
 
401 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.86 
 
 
399 aa  289  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.9 
 
 
387 aa  289  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.79 
 
 
401 aa  289  6e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.35 
 
 
402 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.25 
 
 
401 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.7 
 
 
406 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4045  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.49 
 
 
387 aa  285  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.9 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.21 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.39 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.86 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.9 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.9 
 
 
387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  42.4 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.98 
 
 
387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  42.04 
 
 
401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.01 
 
 
387 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  41.69 
 
 
399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.46 
 
 
406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.49 
 
 
387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.45 
 
 
412 aa  282  7.000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.84 
 
 
406 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.15 
 
 
400 aa  280  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.77 
 
 
402 aa  280  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.59 
 
 
401 aa  279  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.13 
 
 
386 aa  279  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.54 
 
 
400 aa  279  6e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.04 
 
 
402 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  41.04 
 
 
398 aa  279  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  42.04 
 
 
403 aa  279  7e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.73 
 
 
400 aa  279  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.65 
 
 
402 aa  279  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.36 
 
 
402 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.92 
 
 
401 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.73 
 
 
400 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.9 
 
 
400 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4315  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.87 
 
 
387 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.75003  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0916  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.96 
 
 
400 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  38.15 
 
 
401 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.14 
 
 
400 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.14 
 
 
400 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.14 
 
 
400 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.14 
 
 
400 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.14 
 
 
405 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.14 
 
 
400 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.14 
 
 
400 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4165  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.62 
 
 
387 aa  276  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000604115 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.14 
 
 
400 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5284  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.62 
 
 
387 aa  276  5e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.11 
 
 
400 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.14 
 
 
405 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.14 
 
 
405 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.14 
 
 
400 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.14 
 
 
405 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.14 
 
 
405 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4068  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.62 
 
 
387 aa  275  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.142998  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  37.72 
 
 
404 aa  275  7e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.54 
 
 
387 aa  276  7e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.86 
 
 
401 aa  275  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.98 
 
 
400 aa  275  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4136  acetyl-CoA C-acyltransferase FadA  40.62 
 
 
387 aa  275  9e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.29 
 
 
401 aa  275  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>