210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1049 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1049  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  295  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3844  hypothetical protein  76.51 
 
 
156 aa  174  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.991912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  54.25 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  50.66 
 
 
162 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  46.98 
 
 
159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  46.31 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  48.34 
 
 
176 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  43.62 
 
 
162 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  47.02 
 
 
154 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  50 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  48.05 
 
 
160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  49.33 
 
 
148 aa  114  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4351  hypothetical protein  50.7 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  43.33 
 
 
152 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  41.33 
 
 
155 aa  107  8.000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0351  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  54.48 
 
 
165 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0109042 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  44.52 
 
 
146 aa  97.1  8e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  49.33 
 
 
156 aa  97.1  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  54.67 
 
 
154 aa  96.3  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  40.65 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  50.42 
 
 
181 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  50.42 
 
 
170 aa  94.4  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  44.54 
 
 
168 aa  92.8  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  41.38 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  44.62 
 
 
184 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  46.98 
 
 
158 aa  90.5  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  42.62 
 
 
163 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  42.62 
 
 
163 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  42.11 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  44.17 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2912  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like  46.24 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  42.15 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  40.62 
 
 
171 aa  80.5  0.000000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5377  hypothetical protein  47.11 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5484  hypothetical protein  47.11 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0450  hypothetical protein  51.26 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4787  hypothetical protein  47.11 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  41.22 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1818  hypothetical protein  51.26 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0816  hypothetical protein  51.26 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1107  hypothetical protein  51.26 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2080  hypothetical protein  51.26 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  40.16 
 
 
169 aa  77  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  38.98 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  34.52 
 
 
207 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  37.17 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  36.59 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  42.61 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  34.62 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  30.91 
 
 
243 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  31.25 
 
 
273 aa  57.8  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  33.87 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  31.03 
 
 
268 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  37.63 
 
 
262 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  30.07 
 
 
216 aa  55.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  36.3 
 
 
283 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2968  Rossmann fold nucleotide-binding protein  32.53 
 
 
182 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0141  hypothetical protein  39.2 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0775358 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  33.03 
 
 
267 aa  54.7  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  40 
 
 
267 aa  54.3  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  31.61 
 
 
278 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  34.45 
 
 
239 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  35.56 
 
 
283 aa  53.9  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  34.45 
 
 
239 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  37.5 
 
 
280 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  26.09 
 
 
240 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  30 
 
 
239 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  29.2 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  25 
 
 
245 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  41.73 
 
 
178 aa  52.4  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  32.89 
 
 
263 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3171  hypothetical protein  36.36 
 
 
260 aa  51.6  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  51.2  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1086  hypothetical protein  33.54 
 
 
178 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  29.07 
 
 
266 aa  50.8  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  31.25 
 
 
269 aa  50.8  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  30.77 
 
 
245 aa  50.4  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  31.93 
 
 
317 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  31.82 
 
 
239 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  31.82 
 
 
245 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  28.57 
 
 
245 aa  50.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  29.63 
 
 
241 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  29.23 
 
 
229 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  32.63 
 
 
225 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  36.56 
 
 
247 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  33.64 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  32.77 
 
 
317 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  37.96 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  34.51 
 
 
289 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  33.98 
 
 
267 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  31.19 
 
 
241 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  31.93 
 
 
317 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38540  hypothetical protein  32.64 
 
 
359 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  31.45 
 
 
263 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  37.08 
 
 
288 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  29.05 
 
 
313 aa  48.1  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  33.94 
 
 
264 aa  48.5  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1570  hypothetical protein  27.11 
 
 
515 aa  48.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.193511  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  29.73 
 
 
241 aa  48.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  33.85 
 
 
275 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>