More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0237 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0237  Fur family ferric uptake regulator  100 
 
 
161 aa  328  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0518  ferric ion uptake regulator  81.34 
 
 
139 aa  226  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0145  fur family transcriptional regulator  71.64 
 
 
140 aa  201  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4803  ferric uptake regulator, Fur family  73.44 
 
 
154 aa  196  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4454  ferric uptake regulator, Fur family  72.09 
 
 
147 aa  191  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  63.85 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  63.08 
 
 
142 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20420  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  63.64 
 
 
140 aa  170  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375668  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2095  ferric uptake regulator family protein  63.36 
 
 
166 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.509153  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1937  ferric uptake regulator, Fur family  58.78 
 
 
137 aa  164  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  54.41 
 
 
139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1879  ferric uptake regulator, Fur family  62.02 
 
 
139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00751157  normal  0.013308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1623  ferric uptake regulator, Fur family  58.21 
 
 
137 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  59.7 
 
 
170 aa  162  3e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1102  ferric uptake regulator, Fur family  53.38 
 
 
140 aa  160  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.387055  normal  0.912899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  59.06 
 
 
145 aa  157  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  58.59 
 
 
152 aa  157  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0839  ferric-uptake regulator  57.46 
 
 
143 aa  157  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1532  ferric uptake regulator family protein  58.27 
 
 
174 aa  157  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0229059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3209  ferric uptake regulator family protein  60.63 
 
 
147 aa  156  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829925  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0874  ferric-uptake regulator  60.99 
 
 
146 aa  156  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.250116  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3814  ferric uptake regulator, Fur family  60.47 
 
 
146 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000136698  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  58.14 
 
 
150 aa  155  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22450  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  54.48 
 
 
159 aa  154  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0468  ferric-uptake regulator  55.38 
 
 
173 aa  154  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4192  ferric uptake regulator, Fur family  61.24 
 
 
141 aa  153  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2714  ferric-uptake regulator  57.48 
 
 
147 aa  153  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352648  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36340  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  54.29 
 
 
151 aa  153  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2705  ferric uptake regulator, Fur family  57.03 
 
 
139 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2124  ferric uptake regulator, Fur family  56.92 
 
 
157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.506102  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2681  ferric uptake regulator family protein  58.65 
 
 
195 aa  151  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.445944  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2712  ferric uptake regulator family protein  58.65 
 
 
157 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.673301 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2726  ferric uptake regulator family protein  58.65 
 
 
157 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2983  ferric uptake regulator family protein  56.39 
 
 
149 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.319363  normal  0.752016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  54.69 
 
 
201 aa  148  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3313  ferric uptake regulator, Fur family  55.47 
 
 
146 aa  148  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.977689  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2159  ferric uptake regulator family protein  53.91 
 
 
146 aa  144  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00488582 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3965  ferric uptake regulator, Fur family  53.85 
 
 
138 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0866  ferric uptake regulator, Fur family  52.94 
 
 
154 aa  141  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0758878  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24980  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  54.74 
 
 
153 aa  140  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01070  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  54.69 
 
 
142 aa  140  8e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3239  ferric uptake regulator, Fur family  52.71 
 
 
173 aa  137  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0517924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4885  ferric uptake regulator family protein  63.92 
 
 
108 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0503467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4974  ferric uptake regulator family protein  63.92 
 
 
108 aa  130  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5253  ferric uptake regulator family protein  60.58 
 
 
158 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4279  ferric uptake regulator, Fur family  43.15 
 
 
183 aa  118  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000762776  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3077  ferric uptake regulator family protein  48.85 
 
 
155 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2781  ferric uptake regulator, Fur family  48.09 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.028886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2668  ferric uptake regulator family protein  38.06 
 
 
146 aa  86.3  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1301  ferric uptake regulator family protein  32.58 
 
 
166 aa  82  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0281675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3278  ferric uptake regulator, Fur family  34.92 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.351465 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2644  ferric uptake regulator family protein  33.8 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1966  ferric uptake regulator family protein  32.33 
 
 
149 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00359557  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1064  ferric uptake regulator family protein  30.83 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1048  ferric uptake regulator family protein  30.6 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000518354  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0105  ferric uptake regulator family protein  33.08 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.013681  normal  0.263297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  30.23 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0498  ferric uptake regulator, Fur family  27.01 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5746  ferric uptake regulator, DNA-binding transcriptional dual regulator of siderophore biosynthesis and transport  32.89 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2141  ferric uptake regulator family protein  36.15 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2520  ferric uptake regulator, Fur family  34.09 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0734  ferric uptake regulator family protein  30.22 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000194517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5708  ferric uptake regulator, Fur family  32.56 
 
 
143 aa  72  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2623  ferric uptake regulation protein  27.74 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.376677  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0347  ferric uptake regulator, Fur family  34.06 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1792  ferric uptake regulator, Fur family  34.88 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000306351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3653  ferric uptake regulator family protein  35.14 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188238  normal  0.295199 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0767  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.531572  normal  0.0222977 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  28.36 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1364  ferric uptake regulator, Fur family  27.01 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0967  ferric uptake regulator, Fur family  31.06 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.924679  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0438  ferric uptake regulation protein  31.39 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0414  ferric uptake regulation protein  31.39 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1405  ferric uptake regulator family protein  28.8 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2809  FUR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.110848  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  27.94 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0637  ferric uptake regulator family protein  30.3 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.835222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0406  ferric uptake regulator, Fur family  28.47 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0019  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0229  ferric uptake regulator family protein  34.04 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  29.93 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1885  ferric uptake regulator family protein  26.92 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0375  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.105221 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0312  ferric uptake regulator family protein  30.71 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2620  ferric uptake regulator, Fur family  31.25 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2050  ferric uptake regulator, Fur family  30.71 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  27.74 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1648  ferric uptake regulator family protein  34.88 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.499744 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  28.89 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07031  ferric uptake regulator family protein  30.88 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0821588  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2458  ferric uptake regulator  30.16 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0265  ferric-uptake regulator family  27.54 
 
 
144 aa  67  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.460406  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6009  ferric uptake regulator family protein  29.41 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.964976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  30.92 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4610  ferric uptake regulator family protein  29.41 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0726  ferric uptake regulator, Fur family  32.26 
 
 
130 aa  67  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.787789  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4099  ferric uptake regulator family protein  32.82 
 
 
143 aa  67  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2645  ferric uptake regulator  30.16 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0375  ferric uptake regulator  30.16 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4251  FUR family nickel uptake regulator  31.25 
 
 
139 aa  67  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0966436  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>