180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2233 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  69.19 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  68.02 
 
 		 185 aa  244  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  64.5 
 
 		 187 aa  229  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  59.54 
 
 		 181 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  60.36 
 
 		 176 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  58.93 
 
 		 176 aa  211  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  59.89 
 
 		 181 aa  209  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  59.89 
 
 		 181 aa  209  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  59.17 
 
 		 176 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  59.17 
 
 		 176 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  58.58 
 
 		 174 aa  204  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  59.39 
 
 		 168 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  54.55 
 
 		 180 aa  203  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  54.86 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  58.33 
 
 		 177 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  57.74 
 
 		 177 aa  201  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  61.08 
 
 		 184 aa  201  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  55.17 
 
 		 196 aa  200  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  57.74 
 
 		 191 aa  200  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  57.4 
 
 		 181 aa  197  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  50.79 
 
 		 194 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  55.17 
 
 		 186 aa  191  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  53.01 
 
 		 190 aa  186  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  52.72 
 
 		 186 aa  184  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  54.29 
 
 		 190 aa  181  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  51.48 
 
 		 257 aa  177  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  49.7 
 
 		 187 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  37.14 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  35.62 
 
 		 167 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  36.3 
 
 		 167 aa  89  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  32.19 
 
 		 164 aa  89  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  34.48 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  32.12 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  30.66 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  32.12 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  31.39 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  30.14 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  32.12 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  30.82 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  32.12 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  30.99 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  29.71 
 
 		 138 aa  60.5  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  34.97 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2408  Ferritin Dps family protein  27.27 
 
 		 156 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  33.1 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  30.92 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1742  Ferritin and Dps  28.97 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  34.07 
 
 		 156 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5727  Ferritin Dps family protein  27.97 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.517178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1762  Ferritin and Dps  26.57 
 
 		 144 aa  51.2  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.915655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  31.85 
 
 		 156 aa  51.2  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  31.34 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  30.37 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  30.23 
 
 		 275 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4317  Ferritin Dps family protein  27.27 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000113171  hitchhiker  0.0023195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  31.11 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4256  Ferritin Dps family protein  27.27 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3324  Ferritin Dps family protein  26.67 
 
 		 148 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  31.85 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  32.84 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  31.3 
 
 		 158 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  32.82 
 
 		 154 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_002978  WD1247  bacterioferritin  32.12 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2388  Ferritin and Dps  25.71 
 
 		 153 aa  49.3  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0062  Ferritin and Dps  33.04 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686559 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  30.6 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  31.62 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  31.62 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  31.62 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  31.62 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  31.62 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  29.2 
 
 		 161 aa  48.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  30.07 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  32.84 
 
 		 158 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  32.84 
 
 		 158 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  32.84 
 
 		 158 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  32.84 
 
 		 158 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  32.84 
 
 		 158 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2250  bacterioferritin  31.39 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0153548  decreased coverage  0.00706074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  29.79 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1400  Ferritin and Dps  25.52 
 
 		 154 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  31.39 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2787  Ferritin and Dps  29.25 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793439 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  30.5 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  29.8 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  32.82 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  32.06 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  32.82 
 
 		 157 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  29.86 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  28.36 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  30.6 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  27.14 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  32.82 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  29.71 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  32.82 
 
 		 157 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1788  Dps family ferritin  23.78 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0243  bacterioferritin  29.63 
 
 		 158 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  32.85 
 
 		 155 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  27.74 
 
 		 172 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>