51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2207 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2207  putative TonB protein  100 
 
 		 290 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259099 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0783  protein TolA  50 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4054  TonB, C-terminal  48.94 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4425  TonB, C-terminal  28.62 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.333696  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4796  TonB domain-containing protein  31.27 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.389022  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2674  TonB-like  29.9 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2892  TonB-like  30.3 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.141277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  33.12 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2956  putative tolA-related transport transmembrane protein  34.77 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.15947  normal  0.706854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  33.33 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2263  protein TolA  40 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.113233  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2773  TonB family protein  40 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  32.8 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  33.52 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1159  TonB-like  27.78 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.808431  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0794  TonB, C-terminal  36.78 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2461  protein TolA  40.91 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0243  TonB family protein  38.64 
 
 		 333 aa  58.9  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2676  TonB-like protein  37.08 
 
 		 360 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2924  TonB family protein  35.58 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  36.46 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  35.42 
 
 		 332 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  42.47 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2454  protein TolA  39.39 
 
 		 351 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3919  TonB protein  37.88 
 
 		 347 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  36.49 
 
 		 441 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0760  protein TolA  33.33 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.149249  normal  0.490523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1852  TonB-like protein  30.22 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  30.43 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  27.09 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1228  TolA protein, putative  45.65 
 
 		 467 aa  46.2  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.382434  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2586  protein TolA  35.8 
 
 		 350 aa  45.8  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.807612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36650  TolA protein  32.53 
 
 		 452 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.428912  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3202  TolA protein  37.31 
 
 		 341 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0770  protein TolA  39.39 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0734059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0318  TonB-like  34.94 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.782104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0801  TonB family protein  34.94 
 
 		 351 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3890  TonB/TolA-like protein  34.94 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  24.65 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  35.37 
 
 		 308 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2080  hypothetical protein  37.31 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2662  TolA protein  37.31 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1948  TolA protein  37.31 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3240  TolA protein  37.31 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137391  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3255  TolA-related transport transmembrane protein  37.31 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0828  TolA protein  37.31 
 
 		 341 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1374  TolA protein superfamily  37.31 
 
 		 334 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0858  Fis family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.487763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0695  protein TolA  40 
 
 		 355 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0678  TolA family protein  32.53 
 
 		 355 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.805886  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2715  TonB-like  42.86 
 
 		 353 aa  42.7  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0316774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>