More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2033 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2033  ferrochelatase  100 
 
 		 367 aa  749    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.814285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2424  ferrochelatase  64.63 
 
 		 370 aa  443  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.695246  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0929  ferrochelatase  59.72 
 
 		 367 aa  433  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2013  ferrochelatase  59.03 
 
 		 367 aa  430  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2973  ferrochelatase  57.49 
 
 		 367 aa  425  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1545  ferrochelatase  59.77 
 
 		 369 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2495  ferrochelatase  60.77 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.292462 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0772  ferrochelatase  57.99 
 
 		 344 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2471  ferrochelatase  56.33 
 
 		 371 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2877  ferrochelatase  56.06 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2643  ferrochelatase  55.53 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.272624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1723  ferrochelatase  59.71 
 
 		 365 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170322  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2565  ferrochelatase  55.46 
 
 		 368 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2502  ferrochelatase  59.23 
 
 		 356 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0266  Ferrochelatase  55.93 
 
 		 369 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3965  ferrochelatase  57.56 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0641641 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0253  ferrochelatase  54.5 
 
 		 364 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.210033  normal  0.880215 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0746  ferrochelatase  57.56 
 
 		 354 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.442383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2562  ferrochelatase  55.04 
 
 		 365 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.722508  normal  0.132687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1001  ferrochelatase  54.28 
 
 		 371 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.535203 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0045  ferrochelatase  52.7 
 
 		 370 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1037  ferrochelatase  54.28 
 
 		 371 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0733  ferrochelatase  56.98 
 
 		 356 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1104  ferrochelatase  58.72 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624385  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1652  ferrochelatase  60.06 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.219302 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2330  ferrochelatase  58.72 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3316  ferrochelatase  58.72 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3326  ferrochelatase  58.72 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3835  ferrochelatase  59.01 
 
 		 354 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1771  ferrochelatase  57.45 
 
 		 364 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2211  ferrochelatase  58.72 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3283  ferrochelatase  58.72 
 
 		 367 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140379  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2052  ferrochelatase  60.06 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0268125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0495  ferrochelatase  58.72 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.950986  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0716  ferrochelatase  58.43 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.825613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1574  ferrochelatase  57.27 
 
 		 398 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102455 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1303  ferrochelatase  59.3 
 
 		 355 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00654  ferrochelatase  49.86 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3987  ferrochelatase  47.96 
 
 		 360 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.189595  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2638  ferrochelatase  58.43 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0262  ferrochelatase  57.85 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0640  ferrochelatase  57.1 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2425  ferrochelatase  60.75 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0664  ferrochelatase  56.82 
 
 		 354 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1496  ferrochelatase  52.21 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1486  ferrochelatase  55.39 
 
 		 364 aa  362  6e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0819  ferrochelatase  50.68 
 
 		 371 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186844  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0179  ferrochelatase  54.14 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0358  Ferrochelatase  54.14 
 
 		 337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.22206  normal  0.609581 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3000  ferrochelatase  58.82 
 
 		 354 aa  354  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434422 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1545  ferrochelatase  47.97 
 
 		 368 aa  346  4e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1864  ferrochelatase  48.2 
 
 		 378 aa  344  1e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000715246  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1140  ferrochelatase  51.84 
 
 		 355 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0737  ferrochelatase  50 
 
 		 373 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1529  ferrochelatase  49.07 
 
 		 331 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000651574  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2814  ferrochelatase  51.62 
 
 		 353 aa  333  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0305061  normal  0.192347 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1130  ferrochelatase  50.95 
 
 		 337 aa  333  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.138367  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4598  ferrochelatase  57.54 
 
 		 336 aa  329  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2579  ferrochelatase  51.22 
 
 		 360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.208307  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0376  ferrochelatase  47.88 
 
 		 339 aa  326  5e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2057  ferrochelatase  47.62 
 
 		 339 aa  326  5e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.967381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2683  ferrochelatase  50.79 
 
 		 337 aa  325  6e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3348  ferrochelatase  50.63 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4648  ferrochelatase  50.3 
 
 		 360 aa  323  2e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1335  ferrochelatase  48.18 
 
 		 343 aa  323  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2691  ferrochelatase  50 
 
 		 345 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.957435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1470  Ferrochelatase  49.85 
 
 		 356 aa  323  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.776609  normal  0.141968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0734  ferrochelatase  49.71 
 
 		 360 aa  322  7e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2248  ferrochelatase  47.99 
 
 		 348 aa  322  8e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000320467  normal  0.140516 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1198  ferrochelatase  50.31 
 
 		 327 aa  322  8e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0198316  normal  0.5717 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1671  ferrochelatase  52.24 
 
 		 325 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1470  ferrochelatase  49.54 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734047 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0415  ferrochelatase  47.58 
 
 		 339 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1748  Ferrochelatase  49.54 
 
 		 356 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.828123  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2440  ferrochelatase  47.99 
 
 		 348 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000390134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1197  ferrochelatase  49.84 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1268  ferrochelatase  49.84 
 
 		 327 aa  319  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0020308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1235  ferrochelatase  47.68 
 
 		 345 aa  319  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.404951  normal  0.452003 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0129  ferrochelatase  53.42 
 
 		 371 aa  319  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3415  ferrochelatase  48.62 
 
 		 345 aa  319  6e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2678  ferrochelatase  49.39 
 
 		 338 aa  318  7e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0698939  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2019  ferrochelatase  47.53 
 
 		 348 aa  318  9e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1316  ferrochelatase  48.76 
 
 		 327 aa  318  9e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059381  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2296  ferrochelatase  48.14 
 
 		 347 aa  318  9e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000361328  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2320  ferrochelatase  47.68 
 
 		 348 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  unclonable  0.0000443294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2253  ferrochelatase  56.17 
 
 		 331 aa  316  4e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1357  ferrochelatase  49.24 
 
 		 351 aa  315  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0509358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0928  ferrochelatase  48.96 
 
 		 347 aa  315  7e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.809998  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1039  ferrochelatase  47.48 
 
 		 354 aa  314  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2852  ferrochelatase  49.37 
 
 		 337 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.142653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2846  ferrochelatase  47.26 
 
 		 335 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  decreased coverage  0.00000000209416 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3021  ferrochelatase  48.31 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00598338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3179  ferrochelatase  48.31 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00714455  normal  0.0188906 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1342  Ferrochelatase  48 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000000000751933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3036  ferrochelatase  48.15 
 
 		 337 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000027258  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4266  ferrochelatase  44.96 
 
 		 350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3712  ferrochelatase  47.06 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3304  ferrochelatase  47.71 
 
 		 344 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3476  ferrochelatase  49.4 
 
 		 353 aa  309  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.328207  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3336  ferrochelatase  51.23 
 
 		 337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>