222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0140 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  100 
 
 		 633 aa  1272    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  42.49 
 
 		 633 aa  457  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  41 
 
 		 633 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  41.16 
 
 		 633 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  39.05 
 
 		 635 aa  445  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  41.17 
 
 		 633 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  43.04 
 
 		 649 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  36.47 
 
 		 640 aa  431  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  45.42 
 
 		 647 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  44.01 
 
 		 652 aa  422  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  42.74 
 
 		 666 aa  421  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  42.44 
 
 		 696 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  42.05 
 
 		 712 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  41.83 
 
 		 695 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  45.55 
 
 		 712 aa  415  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  36.07 
 
 		 652 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  36.93 
 
 		 656 aa  391  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  40.77 
 
 		 628 aa  377  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  35.22 
 
 		 650 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  28.89 
 
 		 649 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  32.2 
 
 		 657 aa  240  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  28.53 
 
 		 645 aa  239  9e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  27.84 
 
 		 653 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  31.15 
 
 		 662 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  30.53 
 
 		 670 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  28.5 
 
 		 654 aa  230  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  29.04 
 
 		 654 aa  229  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  28.5 
 
 		 660 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  29.32 
 
 		 654 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  28.71 
 
 		 654 aa  224  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  27.96 
 
 		 646 aa  223  7e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  29.39 
 
 		 656 aa  223  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  28.2 
 
 		 654 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  29.92 
 
 		 646 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  30.38 
 
 		 670 aa  221  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  28.3 
 
 		 654 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  28.65 
 
 		 654 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  27.56 
 
 		 654 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  29.28 
 
 		 678 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  29.04 
 
 		 654 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  29.46 
 
 		 663 aa  219  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  27.27 
 
 		 634 aa  208  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  27.37 
 
 		 665 aa  205  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  27.03 
 
 		 646 aa  203  6e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  27.29 
 
 		 682 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  27.9 
 
 		 717 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  27.34 
 
 		 685 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  27.34 
 
 		 685 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  27.23 
 
 		 685 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  26.07 
 
 		 700 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  27.08 
 
 		 690 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  26.44 
 
 		 697 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  26.14 
 
 		 700 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  28.36 
 
 		 621 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  25.85 
 
 		 695 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  33.01 
 
 		 643 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  28.69 
 
 		 611 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  26.57 
 
 		 695 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  34.6 
 
 		 550 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  30.85 
 
 		 628 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  25.52 
 
 		 597 aa  120  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1848  sulfatase  25.76 
 
 		 645 aa  117  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  26.98 
 
 		 630 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  23.5 
 
 		 643 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  27.07 
 
 		 666 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  28.37 
 
 		 651 aa  111  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  27.91 
 
 		 639 aa  106  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3506  sulfatase  25.32 
 
 		 677 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.633638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  25.11 
 
 		 641 aa  105  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  28.75 
 
 		 671 aa  105  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  24.75 
 
 		 677 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  25.24 
 
 		 642 aa  96.3  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2203  sulfatase  26.43 
 
 		 736 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  27.64 
 
 		 640 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1015  sulfatase  27.4 
 
 		 588 aa  90.5  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3776  sulfatase  25.34 
 
 		 639 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000208589 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3608  sulfatase  25.34 
 
 		 639 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3517  sulfatase  25.34 
 
 		 639 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3895  sulfatase  25.34 
 
 		 639 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3505  sulfatase  25.34 
 
 		 639 aa  89.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000809194  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1434  sulfatase  25 
 
 		 639 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.511966  normal  0.0230537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3535  sulfatase  25 
 
 		 639 aa  88.6  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.009662  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3804  sulfatase  25 
 
 		 639 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00040285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3797  sulfatase  25 
 
 		 639 aa  87  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000542687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5606  sulfatase  21.22 
 
 		 642 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000063545  unclonable  7.68096e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5348  sulfatase  22.64 
 
 		 642 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000124675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5353  sulfatase  22.57 
 
 		 642 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5404  sulfatase  22.64 
 
 		 642 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000849395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  22.26 
 
 		 642 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  24.66 
 
 		 639 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5024  sulfatase  22.71 
 
 		 642 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00083521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  22.26 
 
 		 642 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3757  phosphoglycerol transferase I  23.39 
 
 		 701 aa  86.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  22.33 
 
 		 642 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4928  sulfatase  22.26 
 
 		 642 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2768  sulfatase  24.13 
 
 		 731 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.518041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  22.33 
 
 		 642 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3766  sulfatase  22.57 
 
 		 642 aa  84.7  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000560432  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  26.65 
 
 		 609 aa  84.3  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4896  phosphoglycerol transferase I  25.21 
 
 		 763 aa  81.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>