127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1850 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  99.43 
 
 
351 aa  705    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  100 
 
 
351 aa  710    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  58.92 
 
 
352 aa  438  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  59.45 
 
 
328 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  56.16 
 
 
360 aa  405  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  45.41 
 
 
302 aa  207  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  30.24 
 
 
353 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  30.27 
 
 
353 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  29.64 
 
 
353 aa  124  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  28.57 
 
 
371 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  29.65 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  28.2 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  32 
 
 
355 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  32.3 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  32.31 
 
 
348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  28.69 
 
 
396 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  36.68 
 
 
364 aa  109  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  34.71 
 
 
347 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  29.77 
 
 
364 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.28 
 
 
354 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  30.52 
 
 
372 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  30.52 
 
 
379 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  33.16 
 
 
387 aa  103  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.29 
 
 
330 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  36.9 
 
 
348 aa  103  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  33.49 
 
 
332 aa  103  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  31.56 
 
 
379 aa  103  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  28.83 
 
 
353 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.69 
 
 
347 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.77 
 
 
327 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  27.14 
 
 
383 aa  100  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  32.6 
 
 
340 aa  99.4  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  32.72 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  31.51 
 
 
372 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  31.84 
 
 
368 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  29.22 
 
 
372 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  31.09 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  32.06 
 
 
342 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  35.6 
 
 
369 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  32.84 
 
 
354 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  32.84 
 
 
354 aa  90.1  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  29.6 
 
 
369 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  30.2 
 
 
367 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.76 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  28.4 
 
 
381 aa  87  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  30.04 
 
 
369 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  29.15 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.01 
 
 
360 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  31.01 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  28.9 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  27.35 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  27.86 
 
 
368 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  27.86 
 
 
368 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  27.1 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  27.7 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  25.57 
 
 
489 aa  67  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  27.61 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.21 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  25.77 
 
 
505 aa  63.5  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  24.91 
 
 
412 aa  62.8  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  25.45 
 
 
334 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  25.71 
 
 
379 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.9 
 
 
521 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.44 
 
 
414 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.32 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2360  hypothetical protein  23.58 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.615726  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.54 
 
 
418 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.93 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  26.17 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.39 
 
 
382 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  29.6 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0464  ATP-dependent Clp protease  34.44 
 
 
759 aa  47  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.921546  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  25.81 
 
 
304 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  25.77 
 
 
304 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  31.72 
 
 
674 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  26.56 
 
 
303 aa  46.2  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  30 
 
 
308 aa  46.2  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  24.01 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  26.87 
 
 
315 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  25.33 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2426  ATPase  28.99 
 
 
314 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  25.55 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  25.55 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.55 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  30.66 
 
 
390 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2007  ATPase  29.69 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  25.55 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  26.52 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  31.03 
 
 
674 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  31.03 
 
 
674 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  25.55 
 
 
303 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2054  MoxR-like ATPases  27.56 
 
 
312 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0418936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  28.79 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  31.2 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  26.72 
 
 
303 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2044  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.63 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1695  AAA ATPase  33.67 
 
 
801 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.408857 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0640  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  34.71 
 
 
726 aa  44.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.680329  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.89 
 
 
285 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2903  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  33.6 
 
 
778 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.265378 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>