More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1499 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1454  ABC transporter related  99.58 
 
 
238 aa  474  1e-133  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1499  ABC transporter related  100 
 
 
238 aa  476  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0406  ABC transporter related  52.29 
 
 
231 aa  246  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0667  ABC transporter related  36.92 
 
 
317 aa  148  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.747248  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  36.19 
 
 
251 aa  141  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  32.88 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  34.63 
 
 
273 aa  132  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  35.35 
 
 
334 aa  132  6e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  30.84 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0329  ABC transporter related  35 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.31 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0458  ABC transporter related protein  30.8 
 
 
309 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  30.59 
 
 
243 aa  126  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  30.26 
 
 
251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3736  Na+ extrusion transport system ATP-binding protein  30.59 
 
 
249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2894  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.95 
 
 
323 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  30.7 
 
 
243 aa  125  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  34.4 
 
 
241 aa  125  8.000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1537  ABC transporter related protein  33.18 
 
 
241 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  32.27 
 
 
244 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  35.71 
 
 
293 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0763  ABC transporter related  35.27 
 
 
296 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 
248 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0523  ABC transporter, ATP-binding protein  30.73 
 
 
368 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000509478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33 
 
 
334 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  32.82 
 
 
338 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  33.64 
 
 
244 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  33.65 
 
 
295 aa  122  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3932  ABC transporter related  32.55 
 
 
242 aa  122  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0903  ABC transporter related  33.33 
 
 
303 aa  122  5e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1796  ABC transporter related protein  35.24 
 
 
229 aa  122  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0869  ABC transporter related  31.25 
 
 
305 aa  122  7e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.348691 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  37.56 
 
 
495 aa  122  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0913  ABC transporter related  33.64 
 
 
361 aa  121  9e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  32.11 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  29.44 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  31.78 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  32 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1668  ABC transporter related protein  32.21 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207751  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  30.63 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  33.03 
 
 
310 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  31.82 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  33.82 
 
 
303 aa  118  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  35 
 
 
295 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3238  ABC transporter related  32.6 
 
 
304 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  28.84 
 
 
339 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  32.57 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0435  ABC transporter related  29.95 
 
 
328 aa  117  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.490211  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  30 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  34.25 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  34.25 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3258  ABC transporter related protein  31.16 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335184  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  33.01 
 
 
310 aa  116  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3971  ABC transporter related  33.73 
 
 
306 aa  116  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0872  ABC transporter related  32.64 
 
 
229 aa  116  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0610304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03370  ABC transporter, ATP binding component  33.18 
 
 
308 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  32.27 
 
 
244 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  32.03 
 
 
325 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  30.69 
 
 
248 aa  116  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  32.27 
 
 
244 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0699  ABC transporter related  32.02 
 
 
356 aa  116  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  30.69 
 
 
248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  32.27 
 
 
244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.66 
 
 
334 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  30.94 
 
 
359 aa  115  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.35 
 
 
313 aa  115  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
309 aa  115  6e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  31.63 
 
 
244 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  34.1 
 
 
287 aa  115  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  31.82 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0178  ABC transporter related  31.36 
 
 
243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.02 
 
 
338 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  31.53 
 
 
244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3152  ABC transporter related  35.78 
 
 
318 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  29.77 
 
 
339 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  32.27 
 
 
244 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  33.18 
 
 
311 aa  114  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.22 
 
 
331 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  32.86 
 
 
296 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.89 
 
 
355 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4080  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.3 
 
 
350 aa  114  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.754321  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.05 
 
 
312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.19 
 
 
331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  28.64 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  33.48 
 
 
321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  32.06 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  32.06 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  32.06 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1645  ABC transporter related  33.79 
 
 
478 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.467673  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  32.14 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.6 
 
 
337 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3673  ABC transporter related protein  34.45 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0296  ABC transporter related  32.13 
 
 
267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  31.7 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.43 
 
 
339 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1205  ABC transporter related  31.82 
 
 
275 aa  113  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00183606  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  30.91 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  35.19 
 
 
494 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3803  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 
281 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  31.63 
 
 
313 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>