53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3225 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 477 aa  962    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3320  von Willebrand factor, type A  37.83 
 
 		 855 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1721  von Willebrand factor, type A  49.36 
 
 		 1356 aa  220  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13107  normal  0.394888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4158  von Willebrand factor type A  38.2 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.590263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  36.14 
 
 		 504 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3349  von Willebrand factor, type A  37.77 
 
 		 429 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4065  von Willebrand factor, type A  30.15 
 
 		 422 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  37.5 
 
 		 436 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  40.31 
 
 		 681 aa  113  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  35.38 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1795  von Willebrand factor type A  30.61 
 
 		 626 aa  109  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0322  D-amino acid dehydrogenase, large subunit  31.52 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2063  hypothetical protein  31.61 
 
 		 251 aa  86.3  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0618531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4136  von Willebrand factor type A  31.49 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.281515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0472  von Willebrand factor type A  25.23 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3156  von Willebrand factor, type A  27.53 
 
 		 575 aa  70.1  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314115  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4241  von Willebrand factor, type A  24.37 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33156  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51980  hypothetical protein  33.96 
 
 		 581 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10690  hypothetical protein  30.77 
 
 		 157 aa  57  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  26.84 
 
 		 583 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  25.74 
 
 		 315 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  26.98 
 
 		 327 aa  55.1  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 		 1188 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  26.13 
 
 		 315 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  24.7 
 
 		 298 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2623  hypothetical protein  29.46 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00179753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  27.01 
 
 		 576 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1539  hypothetical protein  24.38 
 
 		 597 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  29.19 
 
 		 608 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  25.87 
 
 		 315 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  27.43 
 
 		 892 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  26.6 
 
 		 329 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  26.29 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 618 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  23.56 
 
 		 319 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  29.9 
 
 		 515 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1366  von Willebrand factor, type A  29.11 
 
 		 491 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  23.98 
 
 		 319 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0397  von Willebrand factor type A  30.53 
 
 		 579 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.14 
 
 		 616 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  23.87 
 
 		 319 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  25.36 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  28.57 
 
 		 657 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  25.82 
 
 		 640 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  23.96 
 
 		 307 aa  44.3  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  27.93 
 
 		 1100 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3026  von Willebrand factor, type A  28.23 
 
 		 316 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.443806 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  24.12 
 
 		 647 aa  43.9  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0446  Mg-chelatase subunit ChlD-like protein  24.54 
 
 		 592 aa  43.5  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3038  von Willebrand factor type A  23.45 
 
 		 319 aa  43.5  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2088  von Willebrand factor type A  25.63 
 
 		 318 aa  43.5  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>