More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2944 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2944  flagellar biosynthesis protein FliP  100 
 
 		 248 aa  482  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.854882  normal  0.307606 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4178  flagellar biosynthesis protein FliP  66.67 
 
 		 243 aa  314  8e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2969  flagellar biosynthesis protein FliP  67.41 
 
 		 238 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.481259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1309  flagellar biosynthesis protein FliP  67.41 
 
 		 239 aa  301  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2742  flagellar biosynthesis protein FliP  65.77 
 
 		 236 aa  295  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3267  flagellar biosynthesis protein FliP  65.78 
 
 		 242 aa  294  7e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.845556 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2652  flagellar biosynthesis protein FliP  59.31 
 
 		 241 aa  261  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2568  flagellar biosynthetic protein FliP  50.66 
 
 		 248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1515  flagellar biosynthesis protein FliP  52.3 
 
 		 254 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0763826  normal  0.868949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3779  flagellar biosynthesis protein FliP  52.19 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0132845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1364  flagellar biosynthesis protein FliP  48.36 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4413  flagellar biosynthesis protein FliP  50.4 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1390  flagellar biosynthesis protein FliP  50.2 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1130  flagellar biosynthesis protein FliP  51.97 
 
 		 251 aa  224  8e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3463  flagellar biosynthesis protein FliP  50 
 
 		 266 aa  224  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.431036  normal  0.0273005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5499  flagellar biosynthesis protein FliP  52.04 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.078003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1691  flagellar biosynthesis protein FliP  53.07 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458469  normal  0.283342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5540  flagellar biosynthetic protein FliP  49.37 
 
 		 251 aa  221  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5157  flagellar biosynthetic protein FliP  50.22 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.251875  normal  0.071611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0498  flagellar biosynthetic protein FliP  49.78 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0358  flagellar biosynthesis protein FliP  47.88 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756484  normal  0.0468118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0289  flagellar biosynthesis protein FliP  48.9 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0326  flagellar biosynthesis protein FliP  48.95 
 
 		 245 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.454453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0461  flagellar biosynthetic protein FliP  49.78 
 
 		 253 aa  214  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.120712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1683  flagellar biosynthetic protein FliP  48.28 
 
 		 245 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0427  flagellar biosynthetic protein FliP  49.55 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0747  flagellar biosynthesis protein FliP  47.68 
 
 		 245 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1940  flagellar biosynthesis protein FliP  45.61 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5050  flagellar biosynthetic protein FliP  50.22 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3025  flagellar biosynthesis protein FliP  49.06 
 
 		 262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0755911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2135  flagellar biosynthesis protein FliP  47.35 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3218  flagellar biosynthesis protein FliP  46.48 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0627  flagellar biosynthesis protein FliP  47.85 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.192782 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1292  flagellar biosynthesis protein FliP  46.48 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0605  flagellar biosynthesis protein FliP  48.11 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.353393  normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0033  flagellar biosynthetic protein FliP  45.97 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3647  flagellar biosynthetic protein FliP  47.39 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.313077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1359  flagellar biosynthesis protein FliP  46.48 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0264  flagellar biosynthesis protein FliP  46.67 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1352  flagellar biosynthesis protein FliP  46.48 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0394085  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1376  flagellar biosynthesis protein FliP  46.38 
 
 		 255 aa  206  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.831081  normal  0.157907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0638  flagellar biosynthesis protein FliP  47.85 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.975734  normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2566  flagellar biosynthesis protein FliP  46.48 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0584  flagellar biosynthetic protein FliP  48.54 
 
 		 252 aa  204  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1135  flagellar biosynthesis protein FliP  48.37 
 
 		 247 aa  204  8e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2287  flagellar biosynthesis protein FliP  46.98 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.340468  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0160  flagellar biosynthesis protein FliP  45.42 
 
 		 246 aa  202  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0144  flagellar biosynthesis protein FliP  45.42 
 
 		 246 aa  202  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1447  flagellar biosynthesis protein FliP  47.44 
 
 		 248 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.115557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3058  flagellar biosynthesis protein FliP  47.44 
 
 		 248 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31141  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2926  flagellar biosynthesis protein FliP  47.44 
 
 		 248 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.766938  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2916  flagellar biosynthesis protein FliP  47.44 
 
 		 248 aa  201  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117955  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1628  flagellar biosynthesis protein FliP  46.3 
 
 		 248 aa  201  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1166  flagellar biosynthesis protein FliP  44.87 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3056  flagellar biosynthesis protein FliP  46.05 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  0.0898606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2157  flagellar biosynthetic protein FliP  41.88 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.112947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2830  flagellar biosynthesis protein FliP  51.53 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4203  flagellar biosynthesis protein FliP  46.58 
 
 		 246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.236152  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1192  flagellar biosynthesis protein FliP  42.57 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1103  flagellar biosynthesis protein FliP  51.83 
 
 		 248 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.196359  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02877  flagellar biosynthesis protein FliP  47.69 
 
 		 251 aa  194  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1371  flagellar biosynthesis protein FliP  45.37 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.605314  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2162  flagellar biosynthesis protein FliP  45.33 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1336  flagellar biosynthesis protein FliP  44.44 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0837  flagellar biosynthesis protein FliP  43.69 
 
 		 244 aa  190  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0481  flagellar biosynthesis protein FliP  43.1 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000846074  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1195  flagellar biosynthesis protein FliP  43.69 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0339029  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0982  flagellar biosynthesis protein FliP  43.24 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0907  flagellar biosynthesis protein FliP  43.69 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2172  flagellar biosynthesis protein FliP  45.83 
 
 		 280 aa  187  9e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3037  flagellar biosynthesis protein FliP  46.54 
 
 		 251 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4178  flagellar biosynthetic protein FliP  43.93 
 
 		 253 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1126  flagellar biosynthesis protein FliP  44.61 
 
 		 222 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1271  flagellar biosynthesis protein FliP  44.02 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.515413  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3221  flagellar biosynthesis protein FliP  44.34 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.258501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0033  flagellar biosynthesis protein FliP  44.34 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0037  flagellar biosynthesis protein FliP  44.34 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0056  flagellar biosynthesis protein FliP  44.34 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0655  flagellar biosynthesis protein FliP  40.43 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0423  flagellar biosynthesis protein FliP  47.83 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2941  flagellar biosynthesis protein FliP  43.44 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.901296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1512  flagellar biosynthesis protein FliP  40.24 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3434  flagellar biosynthesis protein FliP  41.15 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1122  flagellar biosynthetic protein FliP  45.29 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0159276  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0038  flagellar biosynthesis protein FliP  43.87 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.853389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0029  flagellar biosynthesis protein FliP  43.87 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1698  flagellar biosynthesis protein FliP  43.58 
 
 		 301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112333 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2298  flagellar biosynthesis protein FliP  43.89 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0063  flagellar biosynthesis protein FliP  43.58 
 
 		 301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03151  flagellar biosynthesis protein FliP  43.98 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3917  flagellar biosynthesis protein FliP  41.74 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3290  flagellar biosynthesis protein FliP  42.99 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1705  flagellar biosynthesis protein FliP  42.72 
 
 		 299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0962  flagellar biosynthetic protein FliP  45.16 
 
 		 277 aa  182  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1550  flagellar biosynthetic protein FliP  43.38 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4199  flagellar biosynthesis protein FliP  45.93 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1753  flagellar biosynthetic protein FliP  42.39 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3780  flagellar biosynthesis protein FliP  43.4 
 
 		 277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1651  flagellar biosynthesis protein FliP  42.98 
 
 		 246 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.232423  normal  0.748822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1666  flagellar biosynthesis protein FliP  45.09 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>