48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0289 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0289  Thioredoxin-related protein-like protein  100 
 
 		 184 aa  370  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.190044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0376  Thioredoxin-related protein-like protein  61.93 
 
 		 193 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.341694  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0316  Thioredoxin-related protein-like protein  58.79 
 
 		 184 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0523  hypothetical protein  53.9 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.419067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2117  hypothetical protein  51.01 
 
 		 168 aa  160  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.860814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0739  hypothetical protein  43.6 
 
 		 197 aa  150  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2363  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  88.2  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3719  hypothetical protein  31.4 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0526022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2493  thioredoxin-related protein-like protein  31.72 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0887  thioredoxin-related protein-like protein  30.99 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.435213 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1524  hypothetical protein  31.72 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.74359 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2808  putative thioredoxin  33.33 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4155  putative thioredoxin  27.53 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4964  putative thioredoxin  26 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.598511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3670  putative thioredoxin-like protein  26.09 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1653  hypothetical protein  31.13 
 
 		 449 aa  58.2  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4375  twin-arginine translocation pathway signal  26.8 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.514109  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1646  hypothetical protein  31.13 
 
 		 449 aa  57.8  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0377  thioredoxin-related protein  29.75 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719942  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2142  thioredoxin-related protein  25.42 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0061  thioredoxin-related protein-like protein  25.18 
 
 		 349 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3919  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.07 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.231123 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2569  hypothetical protein  31.18 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.930787  normal  0.0743009 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4149  thioredoxin SoxW  29.82 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0426  hypothetical protein  23.63 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0272126  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0065  hypothetical protein  26.92 
 
 		 194 aa  47.8  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1855  protein of unknown function DUF255  26.59 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0808  conserved hypothetical lipoprotein  21.74 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.799463  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04029  disulphide-isomerase  30.48 
 
 		 529 aa  45.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1096  Thioredoxin-related protein  24.83 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3273  thioredoxin domain-containing protein  26.32 
 
 		 576 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0349373 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4856  thioredoxin domain-containing protein  26.32 
 
 		 531 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0190  hypothetical protein  25.44 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047477  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3116  thioredoxin domain-containing protein  26.32 
 
 		 522 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0427  hypothetical protein  30.16 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00405131  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2056  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 522 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.740123  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1452  disulphide-isomerase  26.32 
 
 		 522 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4740  thioredoxin domain-containing protein  26.32 
 
 		 531 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2347  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 522 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3231  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  26.32 
 
 		 522 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.804297  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1364  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 522 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419734  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1082  putative lipoprotein  26.32 
 
 		 522 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.27834  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5403  thioredoxin domain-containing protein  26.67 
 
 		 534 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.236496  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5532  thioredoxin domain-containing protein  26.32 
 
 		 531 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0125  hypothetical protein  26.32 
 
 		 556 aa  41.6  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1112  thioredoxin-related protein-like protein  26.06 
 
 		 227 aa  41.2  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00378585  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5329  thioredoxin domain-containing protein  26.32 
 
 		 566 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7115  Protein-disulfide reductase  22.83 
 
 		 658 aa  41.2  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>