92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0120 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0120  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0042  Methyltransferase type 12  61.11 
 
 		 223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1655  methyltransferase type 12  53.36 
 
 		 222 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.159478  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  51.82 
 
 		 223 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  55.5 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14181  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.11 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  40.18 
 
 		 226 aa  138  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07721  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.75 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795739 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07191  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.07 
 
 		 227 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.182786  normal  0.0203679 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0094  SAM-dependent methyltransferase  34.07 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.333279  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  36.49 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07151  methylase  27.54 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353179  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07171  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.86 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0662  hypothetical protein  25.43 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07351  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.138217  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2907  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.59 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 411 aa  55.1  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  29.38 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  36.64 
 
 		 312 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  35.48 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  34.84 
 
 		 307 aa  53.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6101  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 320 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0353  methyltransferase type 12  29.52 
 
 		 300 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0874936 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6510  methyltransferase type 12  29.07 
 
 		 320 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1319  methyltransferase type 12  29.07 
 
 		 320 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284137  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  34.12 
 
 		 307 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0960  Methyltransferase type 11  21.51 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 283 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  65.79 
 
 		 267 aa  49.3  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 272 aa  48.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.27 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  29.34 
 
 		 328 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.36 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.17 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 309 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 339 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 253 aa  45.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0176  hypothetical protein  28.83 
 
 		 279 aa  45.4  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.1 
 
 		 260 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 327 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.21 
 
 		 155 aa  45.1  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.91 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4615  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369451  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  24.81 
 
 		 239 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1299  methyltransferase type 12  31.2 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.44 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.41 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  22.82 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  23.36 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2655  Methyltransferase type 12  38.24 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0191778  normal  0.203757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.93 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  27.56 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.66 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.21 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2686  methyltransferase type 12  25.62 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0980634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3596  modification methylase HemK  34.33 
 
 		 280 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.67 
 
 		 257 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.56 
 
 		 294 aa  43.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5944  methyltransferase type 12  24.71 
 
 		 320 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  31.63 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  23.76 
 
 		 255 aa  42.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  25.4 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.37 
 
 		 261 aa  42.4  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  24.28 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  48.94 
 
 		 272 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  32.22 
 
 		 259 aa  42  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  31.17 
 
 		 284 aa  42  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.97 
 
 		 262 aa  42.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  36.99 
 
 		 211 aa  42  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.85 
 
 		 257 aa  42  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2578  Methyltransferase type 12  34.74 
 
 		 287 aa  42  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000360148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.58 
 
 		 259 aa  42  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2379  Methyltransferase type 12  28.16 
 
 		 240 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  32.5 
 
 		 262 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  31.17 
 
 		 284 aa  42  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 		 274 aa  41.6  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 258 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  45.71 
 
 		 252 aa  41.6  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  45.71 
 
 		 252 aa  41.6  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  31 
 
 		 258 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  45.71 
 
 		 252 aa  41.6  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.74 
 
 		 299 aa  41.6  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 		 272 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  45.71 
 
 		 252 aa  41.6  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>