More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2781 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 
609 aa  1247    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  52.07 
 
 
609 aa  643    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  46.55 
 
 
598 aa  532  1e-150  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  42.93 
 
 
610 aa  528  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1983  ABC transporter related  42.16 
 
 
629 aa  510  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0860642 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  37.91 
 
 
597 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  40.34 
 
 
617 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  36.91 
 
 
594 aa  403  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  37.37 
 
 
597 aa  400  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  36.85 
 
 
594 aa  399  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  36.92 
 
 
617 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  41 
 
 
625 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  37.76 
 
 
609 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  36.9 
 
 
614 aa  383  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.67 
 
 
589 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  38.42 
 
 
594 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  34.79 
 
 
635 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  38.59 
 
 
608 aa  372  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  34.18 
 
 
598 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.63 
 
 
598 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  37.44 
 
 
620 aa  371  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  38.36 
 
 
625 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.46 
 
 
598 aa  369  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  36.04 
 
 
592 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  36.33 
 
 
593 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  37.25 
 
 
613 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  38.03 
 
 
600 aa  369  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  39.64 
 
 
620 aa  368  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  36.58 
 
 
598 aa  364  2e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.13 
 
 
598 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
607 aa  363  5.0000000000000005e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  35.12 
 
 
592 aa  363  6e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  36.53 
 
 
636 aa  363  7.0000000000000005e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0348  ABC transporter related  36.6 
 
 
663 aa  362  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  36.58 
 
 
602 aa  362  1e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.69 
 
 
598 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  37.03 
 
 
587 aa  359  6e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  35.06 
 
 
611 aa  359  9e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6290  ABC transporter related protein  36.99 
 
 
598 aa  358  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  35.08 
 
 
598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  36.02 
 
 
556 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  36.52 
 
 
610 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  36.52 
 
 
610 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  36.52 
 
 
610 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  37.62 
 
 
675 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.95 
 
 
598 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  34.95 
 
 
598 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.95 
 
 
598 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  36.68 
 
 
591 aa  353  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  36.89 
 
 
586 aa  353  5e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.95 
 
 
598 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  37.63 
 
 
597 aa  352  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  37.42 
 
 
597 aa  351  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.42 
 
 
632 aa  352  2e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.56 
 
 
598 aa  350  3e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  34.02 
 
 
607 aa  351  3e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  37.82 
 
 
652 aa  350  5e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.78 
 
 
677 aa  348  1e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  37.88 
 
 
671 aa  348  1e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  34.56 
 
 
605 aa  349  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  34.46 
 
 
589 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  37.57 
 
 
615 aa  348  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0584  ABC transporter transmembrane region  34.55 
 
 
582 aa  348  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.321607  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.6 
 
 
702 aa  348  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0422  ABC transporter related  35.75 
 
 
606 aa  347  3e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  38.76 
 
 
598 aa  347  4e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2429  ABC transporter related  38.15 
 
 
619 aa  346  6e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.572705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  38.17 
 
 
669 aa  346  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0148  ABC transporter related  38.68 
 
 
628 aa  345  1e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  35.18 
 
 
575 aa  345  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.96 
 
 
721 aa  345  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129131  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  35.96 
 
 
600 aa  345  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0806  ABC transporter related  36.86 
 
 
666 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  35.88 
 
 
586 aa  344  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  35.61 
 
 
623 aa  344  2.9999999999999997e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  34.21 
 
 
608 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0856  ABC transporter related  34.15 
 
 
626 aa  343  4e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  34.19 
 
 
611 aa  343  4e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2250  ABC transporter, transmembrane region  36.26 
 
 
634 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993927  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  33.5 
 
 
610 aa  342  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0842  ABC transporter, transmembrane region  38.69 
 
 
672 aa  342  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  36.47 
 
 
631 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  33.57 
 
 
600 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  35.25 
 
 
622 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0545  ABC transporter related  34.58 
 
 
602 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0526  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.48 
 
 
592 aa  340  5e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000230499  normal  0.803212 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  33.56 
 
 
618 aa  339  8e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.39 
 
 
584 aa  339  8e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2169  ABC transporter related  37.74 
 
 
620 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  34.63 
 
 
598 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  34.15 
 
 
587 aa  336  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0367  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.93 
 
 
593 aa  336  9e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.823105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  34.66 
 
 
602 aa  336  9e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  37.15 
 
 
606 aa  335  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  33.05 
 
 
584 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  34.46 
 
 
637 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  37.45 
 
 
618 aa  335  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  34.51 
 
 
625 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1736  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.14 
 
 
616 aa  335  1e-90  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  34.52 
 
 
587 aa  335  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>