More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1107 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1107  transcription elongation factor NusA  100 
 
 		 495 aa  999    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0830  transcription elongation factor NusA  38.6 
 
 		 482 aa  335  2e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0231544  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0383  NusA antitermination factor  34.9 
 
 		 498 aa  307  3e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.66797  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  43.34 
 
 		 404 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  40 
 
 		 365 aa  276  7e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  42.21 
 
 		 346 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1441  NusA antitermination factor  42.77 
 
 		 380 aa  270  5.9999999999999995e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0429547  normal  0.129125 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  39.66 
 
 		 384 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  39.94 
 
 		 362 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  40.62 
 
 		 382 aa  259  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  38.36 
 
 		 382 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  41.24 
 
 		 449 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  39.2 
 
 		 373 aa  257  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  41.76 
 
 		 377 aa  257  4e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3914  transcription elongation factor NusA  38.33 
 
 		 368 aa  256  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  38.82 
 
 		 493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3638  transcription elongation factor NusA  38.89 
 
 		 368 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000480862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2468  transcription elongation factor NusA  38.33 
 
 		 366 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000156927  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0897  transcription elongation factor NusA  40.62 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0054777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3863  transcription elongation factor NusA  37.83 
 
 		 368 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000188549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3854  transcription elongation factor NusA  37.83 
 
 		 368 aa  254  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000110606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3667  transcription elongation factor NusA  37.83 
 
 		 368 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3557  transcription elongation factor NusA  37.83 
 
 		 368 aa  254  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3575  transcription elongation factor NusA  37.83 
 
 		 368 aa  254  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000544237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  36.91 
 
 		 383 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3953  transcription elongation factor NusA  37.83 
 
 		 368 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3828  transcription elongation factor NusA  37.83 
 
 		 368 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  38.33 
 
 		 368 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3191  transcription elongation factor NusA  39.72 
 
 		 381 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000141994  normal  0.115207 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1206  NusA antitermination factor  40.96 
 
 		 360 aa  250  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876177  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0607  NusA antitermination factor  37.18 
 
 		 433 aa  251  3e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457156  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0735  transcription elongation factor NusA  42.61 
 
 		 344 aa  249  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000302084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  39.83 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1134  NusA antitermination factor  37.89 
 
 		 442 aa  248  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000746814  normal  0.939177 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  42.23 
 
 		 381 aa  247  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  39.6 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3749  NusA antitermination factor  37.32 
 
 		 442 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409142  unclonable  0.0000152852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  34.95 
 
 		 534 aa  244  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1943  transcription elongation factor NusA  40.67 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1661  transcription elongation factor NusA  40.67 
 
 		 366 aa  243  5e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3683  NusA antitermination factor  37.11 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00388019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0923  transcription elongation factor NusA  36.9 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000194155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  39.26 
 
 		 383 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  39.26 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  37.82 
 
 		 385 aa  240  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4218  NusA antitermination factor  35.93 
 
 		 534 aa  240  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000184689  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  34.34 
 
 		 531 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1047  transcription elongation factor NusA  39.48 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000699393  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1065  transcription elongation factor NusA  39.77 
 
 		 344 aa  238  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  33.9 
 
 		 557 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  35.01 
 
 		 536 aa  237  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  34.49 
 
 		 534 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  31.9 
 
 		 552 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  34.21 
 
 		 557 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  34.21 
 
 		 557 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1475  transcription termination factor NusA  34.83 
 
 		 393 aa  236  7e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000477736  unclonable  0.00000325116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0473  NusA antitermination factor  36.75 
 
 		 444 aa  236  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000679634  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  38.71 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  34.35 
 
 		 544 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  33.19 
 
 		 443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 401 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  34.35 
 
 		 537 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  33.71 
 
 		 533 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1932  NusA antitermination factor  35.18 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000167668  decreased coverage  0.000000000752271 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  34.35 
 
 		 537 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0811  transcription elongation factor NusA  38.1 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000010954  hitchhiker  0.00234388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  32.71 
 
 		 538 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  33.49 
 
 		 535 aa  233  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  34.56 
 
 		 532 aa  233  6e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  32.7 
 
 		 572 aa  233  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  34.35 
 
 		 535 aa  232  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  38.18 
 
 		 406 aa  232  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1308  NusA antitermination factor  37.07 
 
 		 421 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17701  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  33.55 
 
 		 538 aa  231  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  34.43 
 
 		 538 aa  231  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3219  NusA antitermination factor  38.4 
 
 		 503 aa  231  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.517549  normal  0.104407 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  33.55 
 
 		 516 aa  230  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  32.63 
 
 		 429 aa  229  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  35.51 
 
 		 449 aa  229  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  32.14 
 
 		 506 aa  229  8e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  33.85 
 
 		 556 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2777  NusA antitermination factor  39.54 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000726051  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  35.6 
 
 		 539 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  32.83 
 
 		 537 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  33.41 
 
 		 536 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  38.69 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  34.6 
 
 		 537 aa  227  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  37.37 
 
 		 538 aa  227  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0912  NusA antitermination factor  39.07 
 
 		 372 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  31.75 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0696  NusA antitermination factor  38.2 
 
 		 395 aa  227  4e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000696258  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  33.48 
 
 		 545 aa  227  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  33.55 
 
 		 545 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  33.7 
 
 		 545 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  35.6 
 
 		 537 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  33.98 
 
 		 560 aa  226  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  37.53 
 
 		 535 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  37.53 
 
 		 535 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1412  transcription elongation factor NusA  38.04 
 
 		 344 aa  224  3e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000474551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  35.34 
 
 		 541 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>