More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0154 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0154  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  100 
 
 
692 aa  1390    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.152136  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0155  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  25.17 
 
 
623 aa  180  7e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541883  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  36.46 
 
 
1130 aa  167  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  36.46 
 
 
1133 aa  167  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  29.71 
 
 
1805 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  34.64 
 
 
1119 aa  162  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1171  intracellular signalling protein  24.79 
 
 
690 aa  117  5e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3029  adenylate/guanylate cyclase  29.26 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0863  adenylate/guanylate cyclase family protein  27.51 
 
 
272 aa  108  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  26.94 
 
 
358 aa  104  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  26.35 
 
 
864 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  28.68 
 
 
1473 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  27.6 
 
 
364 aa  99.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  28.68 
 
 
1473 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  28.68 
 
 
1473 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.02 
 
 
861 aa  98.2  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  31.71 
 
 
614 aa  97.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  27.52 
 
 
903 aa  95.9  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1622  response regulator receiver protein  22.89 
 
 
641 aa  94.7  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.923164  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  31.38 
 
 
641 aa  93.6  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.76 
 
 
737 aa  92.8  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  30.7 
 
 
284 aa  93.2  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  27.52 
 
 
911 aa  92  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  27 
 
 
744 aa  92  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.62 
 
 
757 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 
1207 aa  91.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.75 
 
 
797 aa  91.3  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  32.84 
 
 
636 aa  90.9  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  26.76 
 
 
859 aa  90.5  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  25.66 
 
 
740 aa  90.5  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.33 
 
 
860 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
437 aa  90.1  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  29.67 
 
 
431 aa  89.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  25.82 
 
 
696 aa  88.6  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  27.23 
 
 
483 aa  87.8  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  27.23 
 
 
483 aa  87.4  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  25.45 
 
 
735 aa  87  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  29.81 
 
 
439 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  30.96 
 
 
546 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
469 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  29.74 
 
 
638 aa  84  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  26.24 
 
 
437 aa  83.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  26.69 
 
 
858 aa  83.6  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  26.92 
 
 
670 aa  83.2  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  29.02 
 
 
702 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
734 aa  82.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0710  hypothetical protein  26.24 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  29.94 
 
 
586 aa  81.6  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  24.5 
 
 
794 aa  81.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  26.69 
 
 
667 aa  81.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 
483 aa  81.3  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  26.25 
 
 
936 aa  80.9  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.53 
 
 
440 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  25.77 
 
 
645 aa  80.9  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  28.11 
 
 
459 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
407 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.41 
 
 
611 aa  80.1  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  27.94 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  29.03 
 
 
410 aa  79.7  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.38 
 
 
701 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  33.12 
 
 
517 aa  79  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.63 
 
 
758 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  30.63 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1545  histidine kinase  21.12 
 
 
708 aa  78.2  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00108525  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  24.78 
 
 
717 aa  77.8  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.56 
 
 
656 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.11 
 
 
672 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  25.61 
 
 
746 aa  77.8  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  27.94 
 
 
441 aa  77.4  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5211  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.32 
 
 
529 aa  77.4  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  28.34 
 
 
582 aa  77  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9841  adenylate cyclase protein  26.05 
 
 
449 aa  76.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  29.34 
 
 
591 aa  77  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  31.65 
 
 
464 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.36 
 
 
696 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  31.38 
 
 
526 aa  76.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  27.37 
 
 
741 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  32.1 
 
 
404 aa  76.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  28.87 
 
 
713 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4218  adenylate/guanylate cyclase  27.87 
 
 
468 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.459756 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  25.09 
 
 
641 aa  75.5  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  20.54 
 
 
701 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  30.15 
 
 
464 aa  75.1  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  29.79 
 
 
524 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  26.29 
 
 
665 aa  74.7  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  23.86 
 
 
712 aa  75.1  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  30.45 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.64 
 
 
657 aa  74.7  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.32 
 
 
643 aa  74.7  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.11 
 
 
758 aa  74.3  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  24.68 
 
 
729 aa  73.9  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  28.14 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  27.03 
 
 
518 aa  74.3  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  30.45 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  27.23 
 
 
1020 aa  73.9  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.73 
 
 
725 aa  73.9  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  28.5 
 
 
701 aa  73.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  28.11 
 
 
701 aa  73.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  26.67 
 
 
532 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.79 
 
 
662 aa  73.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>