More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0587 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0587  transaldolase B  100 
 
 		 327 aa  662    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  53.33 
 
 		 316 aa  331  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1655  transaldolase B  52.37 
 
 		 316 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000243642  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3234  transaldolase B  50.15 
 
 		 324 aa  320  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3479  transaldolase A  53.87 
 
 		 316 aa  319  5e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2069  transaldolase B  51.56 
 
 		 318 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851541  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  52.52 
 
 		 319 aa  316  4e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02355  transaldolase A  50.32 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1206  transaldolase  50.32 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2742  transaldolase A  50.32 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2610  transaldolase A  50.32 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3685  transaldolase A  50.32 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0746  transaldolase A  51.13 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02317  hypothetical protein  50.32 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1213  transaldolase A  50.32 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2593  transaldolase A  50.32 
 
 		 316 aa  310  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1919  transaldolase B  50.15 
 
 		 321 aa  310  2e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2149  transaldolase A  49.84 
 
 		 316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1075  transaldolase B  50.46 
 
 		 319 aa  309  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1167  transaldolase B  50.16 
 
 		 319 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0982  transaldolase A  50.8 
 
 		 316 aa  308  9e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2089  transaldolase B  50 
 
 		 318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.466177  normal  0.339985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3736  transaldolase B  49.07 
 
 		 321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3437  transaldolase B  49.07 
 
 		 321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2959  transaldolase A  50.97 
 
 		 316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.874274 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1231  transaldolase B  49.21 
 
 		 319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2830  transaldolase A  49.68 
 
 		 316 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2706  transaldolase A  50.97 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2617  transaldolase A  50.97 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2732  transaldolase A  50.97 
 
 		 316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2666  transaldolase A  50.97 
 
 		 316 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2839  transaldolase A  50.97 
 
 		 316 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  50.78 
 
 		 316 aa  301  7.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3095  transaldolase B  48.73 
 
 		 316 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0822  transaldolase B  46.79 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.128995 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0076  transaldolase A  49.68 
 
 		 317 aa  300  3e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  50.16 
 
 		 318 aa  299  5e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675704  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0296  transaldolase B  48.59 
 
 		 317 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1940  transaldolase B  48.59 
 
 		 317 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1174  transaldolase B  48.59 
 
 		 317 aa  298  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.980689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0852  transaldolase B  48.59 
 
 		 317 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1013  transaldolase B  48.59 
 
 		 317 aa  298  7e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.930396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4350  transaldolase B  49.52 
 
 		 320 aa  298  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.45347 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0696  transaldolase B  48.73 
 
 		 316 aa  298  9e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136448 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1326  transaldolase B  48.59 
 
 		 317 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0962  transaldolase B  48.9 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.544979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1166  transaldolase B  48.59 
 
 		 317 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0674  transaldolase B  48.73 
 
 		 316 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.181851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00008  transaldolase B  46.71 
 
 		 317 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3588  transaldolase  46.71 
 
 		 317 aa  297  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00008  hypothetical protein  46.71 
 
 		 317 aa  297  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  46.71 
 
 		 338 aa  296  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0009  transaldolase B  46.71 
 
 		 317 aa  297  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.967516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1126  transaldolase B  49.68 
 
 		 315 aa  297  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  46.71 
 
 		 338 aa  297  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3647  transaldolase B  46.71 
 
 		 317 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0008  transaldolase B  46.71 
 
 		 317 aa  297  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  46.71 
 
 		 317 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2104  transaldolase B  49.53 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5675  transaldolase B  48.25 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  47.96 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3664  transaldolase B  46.71 
 
 		 317 aa  295  8e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0204  transaldolase B  48.58 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3386  transaldolase B  50.16 
 
 		 315 aa  294  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0570  transaldolase B  46.39 
 
 		 317 aa  293  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1265  transaldolase B  51.1 
 
 		 339 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.785654  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  50.16 
 
 		 317 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3859  transaldolase B  47.19 
 
 		 317 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0943  transaldolase B  49.21 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.396631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  46.39 
 
 		 317 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1102  transaldolase B  49.69 
 
 		 318 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1228  transaldolase B  49.22 
 
 		 317 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  46.39 
 
 		 317 aa  293  4e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  46.39 
 
 		 317 aa  293  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1723  transaldolase B  47.96 
 
 		 317 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2335  transaldolase B  47.96 
 
 		 317 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4104  transaldolase B  48.43 
 
 		 320 aa  292  6e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.559408  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2358  transaldolase B  47.96 
 
 		 317 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2734  transaldolase B  50 
 
 		 317 aa  292  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145141  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0685  transaldolase B  50.62 
 
 		 322 aa  292  7e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.947987  normal  0.786497 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07571  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  48.42 
 
 		 390 aa  291  9e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0007  transaldolase B  45.45 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  48.58 
 
 		 318 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0537  transaldolase B  47.02 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1653  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  47.27 
 
 		 390 aa  291  1e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0007  transaldolase B  45.45 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0007  transaldolase B  45.45 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3318  transaldolase B  49.53 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0830908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0007  transaldolase B  45.45 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111561  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05211  transaldolase B  48.46 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  45.26 
 
 		 392 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  48.73 
 
 		 318 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000240039  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1914  transaldolase B  50 
 
 		 313 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1357  transaldolase B  46.77 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  48.73 
 
 		 318 aa  289  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0752  transaldolase B  48.41 
 
 		 315 aa  289  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3806  transaldolase B  47.44 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.390141 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0700  transaldolase A  50 
 
 		 315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2374  transaldolase B  47.96 
 
 		 317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0007  transaldolase B  45.14 
 
 		 317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>