More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13613 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13613  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 469 aa  958    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.324359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5123  cysteinyl-tRNA synthetase  80.79 
 
 		 481 aa  797    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642853  normal  0.372364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4737  cysteinyl-tRNA synthetase  80.79 
 
 		 481 aa  796    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343923  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0973  cysteinyl-tRNA synthetase  70.59 
 
 		 463 aa  662    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.110281  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1446  cysteinyl-tRNA synthetase  80.73 
 
 		 467 aa  745    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.5503  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4823  cysteinyl-tRNA synthetase  80.79 
 
 		 481 aa  796    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5338  cysteinyl-tRNA synthetase  83.15 
 
 		 463 aa  783    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0605  cysteinyl-tRNA synthetase  67.9 
 
 		 465 aa  618  1e-176  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35130  cysteinyl-tRNA synthetase  60.83 
 
 		 459 aa  574  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.782995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0360  cysteinyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4314  cysteinyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 467 aa  538  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0212  cysteinyl-tRNA synthetase  60.39 
 
 		 466 aa  537  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4925  cysteinyl-tRNA synthetase  57.97 
 
 		 473 aa  530  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0654  cysteinyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 467 aa  520  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0512859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0970  Cysteine--tRNA ligase  55.53 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0911  cysteinyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 471 aa  508  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.741601  normal  0.0529443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0506  cysteinyl-tRNA synthetase  55.75 
 
 		 464 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.630345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0711  cysteinyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 		 465 aa  497  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848323  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0082  cysteinyl-tRNA synthetase  55.91 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0780  cysteinyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 		 474 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.176113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31750  cysteinyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 477 aa  481  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.443609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4659  cysteinyl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 471 aa  481  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4021  cysteinyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 471 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163649  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4222  cysteinyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.926894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8151  cysteinyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0354  cysteinyl-tRNA synthetase  52.67 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2953  cysteinyl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 480 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0855  cysteinyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 488 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03790  cysteinyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 485 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0671  cysteinyl-tRNA synthetase  55.25 
 
 		 481 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.590475  hitchhiker  0.000900008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0730  cysteinyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 487 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236803  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2068  cysteinyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 469 aa  438  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.742832 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03760  cysteinyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 500 aa  438  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0729069 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1048  cysteinyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 549 aa  416  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0329  cysteine--tRNA ligase  42.5 
 
 		 588 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.608913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0366  cysteinyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 506 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0158714  hitchhiker  0.00296969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4251  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 524 aa  384  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12690  cysteinyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 481 aa  381  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 481 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 456 aa  368  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 456 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 493 aa  361  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 479 aa  359  5e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 		 485 aa  359  7e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 487 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 485 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 497 aa  357  1.9999999999999998e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19450  cysteinyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 498 aa  357  2.9999999999999997e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000839474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 461 aa  355  5.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 481 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 461 aa  354  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  42.2 
 
 		 485 aa  353  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 		 463 aa  352  7e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 481 aa  352  8.999999999999999e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 485 aa  352  1e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 493 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 465 aa  350  4e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 485 aa  350  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 485 aa  349  7e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 465 aa  348  8e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 488 aa  348  2e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 480 aa  346  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 461 aa  346  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 485 aa  345  8e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 459 aa  345  8e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 455 aa  345  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 459 aa  344  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2878  cysteinyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 460 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.846571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 494 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 480 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 459 aa  343  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 470 aa  343  5e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 459 aa  343  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 505 aa  342  8e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 468 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 486 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 468 aa  342  1e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 484 aa  341  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0429  cysteinyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 455 aa  340  2e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2786  cysteinyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 460 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 474 aa  340  4e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2905  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 460 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 480 aa  340  5e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 458 aa  339  5e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2398  cysteinyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 461 aa  339  5e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 484 aa  339  5e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 459 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1447  cysteinyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 483 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2407  cysteinyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 		 460 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0439107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0210  cysteinyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 460 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0208  cysteinyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 460 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1109  cysteinyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 488 aa  338  9.999999999999999e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.98105  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 454 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.462524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 477 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0064  cysteinyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 469 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00940017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 460 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>