More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13124 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  100 
 
 		 527 aa  1056    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  66.35 
 
 		 536 aa  647    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  65.41 
 
 		 535 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  53.04 
 
 		 532 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  54.08 
 
 		 531 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  53.51 
 
 		 532 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  49.43 
 
 		 534 aa  491  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  53.76 
 
 		 546 aa  490  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  51.31 
 
 		 502 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  47.83 
 
 		 534 aa  473  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  39.15 
 
 		 529 aa  299  8e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  37.38 
 
 		 527 aa  293  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  38.57 
 
 		 531 aa  280  5e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  38.87 
 
 		 525 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  38.87 
 
 		 525 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  38.87 
 
 		 525 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  33.75 
 
 		 552 aa  267  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.23 
 
 		 533 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  37.2 
 
 		 545 aa  265  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  33.51 
 
 		 554 aa  266  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.33 
 
 		 528 aa  264  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  39.35 
 
 		 521 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  37.36 
 
 		 524 aa  262  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  35.07 
 
 		 556 aa  261  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  34.07 
 
 		 532 aa  261  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  38.1 
 
 		 527 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.74 
 
 		 521 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  30.02 
 
 		 563 aa  257  5e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.17 
 
 		 518 aa  256  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  38.07 
 
 		 550 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.43 
 
 		 572 aa  253  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  32.21 
 
 		 584 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.59 
 
 		 531 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  30.99 
 
 		 559 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.23 
 
 		 534 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.47 
 
 		 565 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  36.13 
 
 		 520 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  32.26 
 
 		 531 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.11 
 
 		 540 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.44 
 
 		 568 aa  223  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  31.57 
 
 		 538 aa  223  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  28.81 
 
 		 583 aa  219  7e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  31.06 
 
 		 531 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.87 
 
 		 557 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.18 
 
 		 534 aa  213  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  29.21 
 
 		 586 aa  202  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.25 
 
 		 564 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  32.98 
 
 		 470 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.35 
 
 		 579 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.91 
 
 		 467 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.13 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  26.15 
 
 		 554 aa  165  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  29.11 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.34 
 
 		 510 aa  153  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  29.39 
 
 		 513 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.86 
 
 		 523 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.15 
 
 		 516 aa  149  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  29.66 
 
 		 520 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.04 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  28.96 
 
 		 517 aa  143  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  25.34 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  25.34 
 
 		 484 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  25.34 
 
 		 484 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  25.34 
 
 		 484 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  25.34 
 
 		 484 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.34 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  25.11 
 
 		 484 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  25.11 
 
 		 484 aa  134  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  24.43 
 
 		 484 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  26.49 
 
 		 472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.89 
 
 		 457 aa  120  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.13 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.24 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  28.12 
 
 		 459 aa  117  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  24.31 
 
 		 451 aa  117  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.61 
 
 		 470 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3429  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.65 
 
 		 887 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0215799  decreased coverage  0.000769346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  28.12 
 
 		 459 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.4 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.46 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  27.2 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  27.4 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  27.2 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.4 
 
 		 470 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6927  FAD linked oxidase domain protein  27.72 
 
 		 461 aa  115  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  26.99 
 
 		 470 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.99 
 
 		 470 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1117  FAD linked oxidase domain protein  28.45 
 
 		 489 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1198  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.45 
 
 		 474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  26.32 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.89 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  27.07 
 
 		 459 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.17 
 
 		 488 aa  110  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4968  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.17 
 
 		 476 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.23 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0127  FAD linked oxidase domain protein  28.05 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  36 
 
 		 572 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.77 
 
 		 890 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.15 
 
 		 477 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  26.91 
 
 		 466 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>