More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12738 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12738  GTP-binding protein hflX  100 
 
 
495 aa  983    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.324868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2164  GTP-binding protein, HSR1-related  81.18 
 
 
483 aa  689    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.951338  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1800  GTP-binding proten HflX  74.4 
 
 
479 aa  648    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2151  GTP-binding protein, HSR1-related  81.4 
 
 
483 aa  690    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464276  normal  0.0136453 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2210  GTP-binding protein, HSR1-related  81.18 
 
 
483 aa  689    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60775  normal  0.0439435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2436  GTP-binding protein, HSR1-related  82.66 
 
 
482 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.445847  normal  0.220236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3960  GTP-binding protein, HSR1-related  80.76 
 
 
482 aa  680    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.342247  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2215  GTP-binding proten HflX  69.81 
 
 
484 aa  632  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27610  GTP-binding proten HflX  66.88 
 
 
482 aa  585  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3905  GTP-binding proten HflX  68.86 
 
 
512 aa  568  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.13556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3269  GTP-binding proten HflX  68.83 
 
 
485 aa  569  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000617793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7080  GTP-binding proten HflX  65.12 
 
 
502 aa  561  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1436  GTP-binding proten HflX  69.37 
 
 
480 aa  554  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1231  small GTP-binding protein  63.66 
 
 
503 aa  545  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.592117  normal  0.0200783 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1051  GTP-binding proten HflX  63.44 
 
 
509 aa  546  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.128813 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0820  small GTP-binding protein domain-containing protein  64.22 
 
 
493 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3511  small GTP-binding protein domain-containing protein  62.8 
 
 
486 aa  535  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.67992  normal  0.0915245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3981  GTP-binding proten HflX  61.29 
 
 
487 aa  534  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0693971  normal  0.0467716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1140  GTP-binding proten HflX  64.24 
 
 
501 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.762868 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1466  small GTP-binding protein  63.64 
 
 
522 aa  525  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00807526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0684  GTP-binding proten HflX  63.85 
 
 
512 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1468  GTP-binding proten HflX  62.42 
 
 
553 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000115477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17490  GTP-binding proten HflX  63.45 
 
 
517 aa  517  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106124  normal  0.236778 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10600  GTP-binding proten HflX  64.44 
 
 
521 aa  518  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.697427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2263  GTP-binding family protein ; K03665 GTP-binding protein HflX  61.83 
 
 
494 aa  516  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0586252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1449  GTP-binding protein, HSR1-related  64.79 
 
 
494 aa  508  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.062201  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1562  GTP-binding proten HflX  64.38 
 
 
505 aa  509  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.410019  hitchhiker  0.00407104 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1482  small GTP-binding protein  62.71 
 
 
524 aa  511  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.578947  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3837  GTP-binding protein, HSR1-related  59.66 
 
 
493 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4564  GTP-binding proten HflX  67.83 
 
 
466 aa  502  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.631716  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23070  GTP-binding proten HflX  64.25 
 
 
515 aa  503  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0748737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1407  small GTP-binding protein  64.58 
 
 
515 aa  502  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1255  GTP-binding proten HflX  62.94 
 
 
515 aa  498  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2436  GTP-binding proten HflX  64.71 
 
 
493 aa  497  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07300  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein TIGR00650  60.8 
 
 
546 aa  494  9.999999999999999e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1503  small GTP-binding protein  61.63 
 
 
530 aa  477  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0726763  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0583  GTP-binding protein HflX  55.09 
 
 
512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.622699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0164  GTPase  55.65 
 
 
501 aa  442  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1612  GTP-binding proten HflX  47.42 
 
 
436 aa  349  8e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000211402  unclonable  5.44053e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10790  GTP-binding proten HflX  45.67 
 
 
433 aa  336  7e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000931239  unclonable  0.00000000274038 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0772  GTP-binding proten HflX  42.72 
 
 
437 aa  331  2e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.426006  normal  0.338027 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1259  GTP-binding protein, HSR1-related  43.87 
 
 
421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027448  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  43.93 
 
 
441 aa  318  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  47.2 
 
 
461 aa  316  7e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0528  GTP-binding proten HflX  57.85 
 
 
384 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11140  small GTP-binding protein  43.28 
 
 
395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1110  GTP-binding protein, HSR1-related  48.19 
 
 
422 aa  313  6.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000612987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  46.05 
 
 
454 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3611  GTP-binding proten HflX  43.3 
 
 
414 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0108116  normal  0.379187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  45.83 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  45.81 
 
 
454 aa  306  8.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  44.84 
 
 
440 aa  303  5.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4111  GTP-binding proten HflX  45.31 
 
 
425 aa  300  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2081  small GTP-binding protein  42.38 
 
 
582 aa  299  7e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00812611  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  44.78 
 
 
442 aa  298  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1081  GTP-binding proten HflX  40.76 
 
 
405 aa  297  2e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0783851  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0658  GTP-binding proten HflX  46.97 
 
 
425 aa  296  4e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  42.29 
 
 
433 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1441  small GTP-binding protein  39.86 
 
 
413 aa  294  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  42.06 
 
 
433 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  41.71 
 
 
415 aa  293  6e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  43.65 
 
 
489 aa  291  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1834  GTP-binding protein, HSR1-related  46.09 
 
 
528 aa  291  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  43.91 
 
 
489 aa  291  2e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32115  predicted protein  38.99 
 
 
519 aa  291  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0275  GTP-binding proten HflX  43.37 
 
 
564 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0275  GTP-binding proten HflX  43.37 
 
 
564 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3508  GTP-binding protein  38.23 
 
 
419 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2262  GTP-binding proten HflX  41.62 
 
 
435 aa  291  3e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3241  GTP-binding proten HflX  44.77 
 
 
553 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300166  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0394  small GTP-binding protein  42.15 
 
 
406 aa  290  3e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000766043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0534  GTP-binding proten HflX  41.26 
 
 
420 aa  290  4e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000187355  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  47.92 
 
 
404 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  47.92 
 
 
404 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1434  GTP-binding protein HSR1-related  38 
 
 
419 aa  289  7e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3259  GTP-binding proten HflX  46.04 
 
 
450 aa  289  8e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0957781 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  43 
 
 
435 aa  289  9e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1951  GTP-binding protein  38.23 
 
 
419 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.697887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  42.03 
 
 
433 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1872  GTP-binding protein  38.46 
 
 
419 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000726379 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  47.92 
 
 
396 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  42.03 
 
 
433 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1674  GTP-binding protein  38.23 
 
 
419 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.887073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  42.03 
 
 
433 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2221  GTP-binding proten HflX  47.65 
 
 
387 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  41.53 
 
 
432 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1650  GTP-binding protein  38.23 
 
 
419 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101149  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1868  GTP-binding protein, HSR1-related  43.33 
 
 
481 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0249572  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  45.58 
 
 
439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0178  GTP-binding proten HflX  41.75 
 
 
596 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.22171  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  41.91 
 
 
435 aa  286  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5107  small GTP-binding protein  47.65 
 
 
396 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245706  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2240  GTP-binding protein HflX  47.09 
 
 
392 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224831  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2349  GTP-binding protein HflX  47.37 
 
 
392 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2183  GTP-binding proten HflX  47.37 
 
 
387 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1830  GTP-binding proten HflX  47.65 
 
 
395 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0068  GTP-binding protein HflX  47.37 
 
 
387 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0515568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1806  small GTP-binding protein  47.65 
 
 
395 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1100  GTP-binding protein HflX  47.37 
 
 
387 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1828  GTP-binding protein HflX  47.37 
 
 
387 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>