More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12305 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12305  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3750  transcriptional regulator, LysR family  49.16 
 
 		 307 aa  250  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195821  hitchhiker  0.00432039 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4390  LysR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1341  transcriptional regulator, LysR family  46.21 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0579  LysR substrate-binding protein  43.71 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5154  transcriptional regulator, LysR family  45.1 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18090  transcriptional regulator  44.37 
 
 		 302 aa  195  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.132657  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0053  transcriptional regulator, LysR family  41.08 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.488501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6040  transcriptional regulator, LysR family  49.45 
 
 		 295 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0524  transcriptional regulator, LysR family  40.71 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2692  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 312 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6399  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0179787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11030  transcriptional regulator  38.11 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4601  transcriptional regulator, LysR family  40.85 
 
 		 301 aa  152  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2095  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4857  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 		 307 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 294 aa  123  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  33.45 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  31.8 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 302 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2471  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.643373 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  32.06 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4369  LysR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 307 aa  113  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  29.23 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5262  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.94 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 296 aa  109  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0698  LysR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  36.03 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  30.85 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1694  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 290 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0726  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 308 aa  105  8e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0263  transcriptional regulator, LysR family  30.19 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0987  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.830946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0434  transcriptional regulator, LysR family  32.49 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0959  LysR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1014  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1679  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3233  transcriptional regulator, LysR family  34.85 
 
 		 306 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363202 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2350  transcriptional regulator, LysR family  26.49 
 
 		 308 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02086  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0640427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2454  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2304  putative DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4548  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456524 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2469  transcriptional regulator, LysR family protein  29.96 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.73 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0809  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.97 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2273  transcriptional regulator LysR family  35.32 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.351493  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2324  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.65 
 
 		 286 aa  102  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0861  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 325 aa  102  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.278142  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  27 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1535  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.97 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0934769  normal  0.198722 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2754  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.97 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.810251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2672  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.97 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0637  transcriptional regulator, LysR family  31.18 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000713061  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0475  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000111111  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000192  transcriptional regulator LysR family  32.13 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0226889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  32.71 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05922  transcriptional regulator  32.49 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0142  transcriptional regulator, LysR family  27.5 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 300 aa  99.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.16 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3257  translation initiation factor IF-2  29.51 
 
 		 297 aa  99.4  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0284  LysR substrate-binding protein  27.34 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2885  LysR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 298 aa  99.4  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  25.53 
 
 		 298 aa  99  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  26.49 
 
 		 297 aa  99  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1969  transcriptional regulator, LysR family  36.2 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3595  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2392  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.49 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  hitchhiker  0.00212314 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2550  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.49 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>