More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6399 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6399  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  591  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0179787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1341  transcriptional regulator, LysR family  55.44 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0524  transcriptional regulator, LysR family  55.51 
 
 		 304 aa  242  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2692  transcriptional regulator, LysR family  49.66 
 
 		 312 aa  242  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5154  transcriptional regulator, LysR family  53.12 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6040  transcriptional regulator, LysR family  57.68 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4390  LysR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3750  transcriptional regulator, LysR family  48.22 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195821  hitchhiker  0.00432039 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18090  transcriptional regulator  46.84 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.132657  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0053  transcriptional regulator, LysR family  45.89 
 
 		 306 aa  205  9e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.488501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4601  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.685719 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0579  LysR substrate-binding protein  41.92 
 
 		 299 aa  182  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2095  transcriptional regulator, LysR family  48.5 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12305  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11030  transcriptional regulator  43.6 
 
 		 313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 294 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2159  LysR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0448  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0509  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.187244  hitchhiker  0.00160332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  35.55 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 297 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2775  transcriptional regulator, LysR family  40.52 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  34.38 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0284  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 303 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0434  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  25 
 
 		 296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2531  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 308 aa  126  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.351481  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2159  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 308 aa  126  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.597139  hitchhiker  0.0000167573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 290 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4025  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1386  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.72 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1985  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.97 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.464368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1184  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204393 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0880  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0236  LysR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0946906  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2680  transcriptional regulator, LysR family  37.45 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.578382  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1763  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0831  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 296 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2009  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 334 aa  119  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476347  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  33.98 
 
 		 319 aa  119  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3257  translation initiation factor IF-2  33.9 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1713  transcriptional regulator, LysR family  27.5 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1980  LysR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 329 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.362231  normal  0.28719 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0726  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 308 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1657  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.27 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0307226  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0953  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20130  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4857  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 307 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.224966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1679  transcriptional regulator, LysR family  27.86 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2158  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000128289  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02086  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.72 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0640427  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2304  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.72 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791446 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.72 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0606  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.85701  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  32.72 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2659  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.112809  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0809  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.72 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.72 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0266  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2454  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.72 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1732  putative transcriptional regulator  30.85 
 
 		 308 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4022  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2469  transcriptional regulator, LysR family protein  30.57 
 
 		 297 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  28.28 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1928  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.16 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0121617  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2471  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.643373 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4836  LysR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4080  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0186  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000312054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3635  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.287506  normal  0.0415744 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0138  ndhF3 operon transcriptional regulator  36.13 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184087  normal  0.45783 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4548  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456524 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1637  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1239  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  hitchhiker  0.00000000418584 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  29.06 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4630  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  27.95 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2131  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2875  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4870  transcriptional regulator, LysR family  28.99 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  28.87 
 
 		 300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1844  LysR family transcription regulator  28.43 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00735854  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.9 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>