More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11545 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11545  GDP-D-mannose dehydratase gmdA  100 
 
 
340 aa  705    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2614  GDP-mannose 4,6-dehydratase  82.2 
 
 
342 aa  589  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4754  GDP-mannose 4,6-dehydratase  79.28 
 
 
350 aa  559  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  78.21 
 
 
351 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0963  GDP-mannose 4,6-dehydratase  78.21 
 
 
351 aa  555  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.6787 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  73.75 
 
 
380 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0843944  normal  0.941368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4203  GDP-mannose 4,6-dehydratase  68.47 
 
 
340 aa  488  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1827  GDP-mannose 4,6-dehydratase  74.84 
 
 
330 aa  475  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691167  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3395  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.96 
 
 
360 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.122885 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2688  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.36 
 
 
359 aa  456  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.354293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4287  GDP-mannose 4,6-dehydratase  67.89 
 
 
340 aa  451  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.183807  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3545  GDP-mannose 4,6-dehydratase  65.14 
 
 
362 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.424654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.06 
 
 
340 aa  447  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  65.44 
 
 
362 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4243  GDP-mannose 4,6-dehydratase  67.18 
 
 
338 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0263773  normal  0.0307991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0490  GDP-mannose 4,6-dehydratase  65.55 
 
 
342 aa  448  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588474  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4448  GDP-mannose 4,6-dehydratase  67.58 
 
 
340 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4424  GDP-mannose 4,6-dehydratase  67.28 
 
 
340 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0211  GDP-mannose 4,6-dehydratase  65.47 
 
 
358 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.140202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2129  GDP-mannose 4,6-dehydratase  63.8 
 
 
347 aa  442  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2132  GDP-mannose 4,6-dehydratase  63.55 
 
 
348 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0323729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3945  GDP-mannose 4,6-dehydratase  66.15 
 
 
328 aa  436  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.406952  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1407  GDP-mannose 4,6-dehydratase  61.85 
 
 
384 aa  431  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000685892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2097  GDP-mannose 4,6-dehydratase  65.57 
 
 
344 aa  421  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.822363  hitchhiker  0.0000115306 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1762  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.62 
 
 
349 aa  421  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319433 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1488  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.14 
 
 
349 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0017  GDP-mannose 4,6-dehydratase  60.12 
 
 
364 aa  412  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3405  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.28 
 
 
351 aa  411  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00873108  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0034  GDP-mannose 4,6 dehydratase  57.69 
 
 
373 aa  408  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0188537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3135  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.24 
 
 
361 aa  408  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4139  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.47 
 
 
354 aa  401  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.927486 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1281  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.4 
 
 
387 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3210  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.25 
 
 
349 aa  401  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.293077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1311  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.02 
 
 
360 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.782429 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1932  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.98 
 
 
353 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2843  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.3 
 
 
362 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0439  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.02 
 
 
360 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.920435 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0626  GDP-mannose 4,6-dehydratase  59.54 
 
 
349 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3183  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.01 
 
 
373 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0784026  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0425  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.7 
 
 
353 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3251  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.93 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3441  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.76 
 
 
345 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3041  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.01 
 
 
373 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0773  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.14 
 
 
360 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1146  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56 
 
 
372 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0522  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.89 
 
 
362 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6237  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.48 
 
 
363 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0542194  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1491  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.85 
 
 
360 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1923  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.94 
 
 
359 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.578659  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0432  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.02 
 
 
382 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.85 
 
 
363 aa  394  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3954  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.59 
 
 
370 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0807  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.41 
 
 
348 aa  393  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1776  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.39 
 
 
361 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.16 
 
 
371 aa  392  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2901  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.78 
 
 
361 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6433  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.89 
 
 
367 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.418914  normal  0.286402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2561  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.64 
 
 
362 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1394  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.46 
 
 
368 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0703  GDP-mannose 4,6 dehydratase  57.41 
 
 
348 aa  393  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14441  gdpmannose 4,6-dehydratase  54.18 
 
 
364 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.327555  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2093  hypothetical protein  54.86 
 
 
372 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2385  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.43 
 
 
361 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1523  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.55 
 
 
373 aa  388  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1525  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.1 
 
 
360 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0821  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.43 
 
 
372 aa  388  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3863  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56 
 
 
372 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.713411  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3814  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.69 
 
 
360 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.953325  normal  0.405066 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1249  GDP-mannose 4,6-dehydratase  56.4 
 
 
355 aa  389  1e-107  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0059  GDP-D-mannose dehydratase  53.58 
 
 
370 aa  390  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0291032 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13991  gdpmannose 4,6-dehydratase  52.41 
 
 
380 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.193432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2364  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.78 
 
 
365 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000029315  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0330  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.52 
 
 
370 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.125638  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6329  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.75 
 
 
354 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2731  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.86 
 
 
371 aa  387  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.122235 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25417  gdp-mannose 4,6-dehydratase  56.56 
 
 
363 aa  387  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.807653  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2667  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.28 
 
 
373 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0082  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.33 
 
 
352 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0652  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.44 
 
 
400 aa  386  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1316  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.12 
 
 
367 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0253  GDP-mannose 4,6-dehydratase  58.02 
 
 
356 aa  387  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3269  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.21 
 
 
383 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0412  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.31 
 
 
382 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2471  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.43 
 
 
375 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.236107  normal  0.502765 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3372  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.23 
 
 
371 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2117  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  52.86 
 
 
374 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.579852  normal  0.77541 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02910  GDP-D-mannose dehydratase  51.98 
 
 
372 aa  386  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2604  GDP-mannose 4,6-dehydratase  54.57 
 
 
372 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5712  GDP-mannose 4,6-dehydratase (GDP-D-mannose dehydratase)  56.64 
 
 
361 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3190  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.62 
 
 
367 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.41976  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_002950  PG1288  GDP-mannose 4,6-dehydratase  57.89 
 
 
361 aa  384  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0419  GDP-mannose 4,6-dehydratase Bme9  56.34 
 
 
356 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2342  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.99 
 
 
373 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0174  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.98 
 
 
373 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.338951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2335  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.99 
 
 
373 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.575039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2449  GDP-mannose 4,6-dehydratase  52.99 
 
 
373 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0119174 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5860  GDP-D-mannose dehydratase, NAD(P)-binding  55.37 
 
 
401 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1482  GDP-mannose 4,6-dehydratase  55.3 
 
 
373 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.246967  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3362  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.2 
 
 
388 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1136  GDP-mannose 4,6-dehydratase  53.65 
 
 
379 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>