More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10016 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  79.55 
 
 		 491 aa  784    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  79.3 
 
 		 491 aa  786    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  100 
 
 		 491 aa  990    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  79.3 
 
 		 491 aa  786    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  79.3 
 
 		 491 aa  786    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  78.69 
 
 		 491 aa  771    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  56.94 
 
 		 504 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  52.31 
 
 		 495 aa  482  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  50.1 
 
 		 489 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  50.81 
 
 		 493 aa  451  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  49.59 
 
 		 482 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  48.17 
 
 		 488 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  47.87 
 
 		 485 aa  411  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  47.66 
 
 		 480 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.93 
 
 		 480 aa  401  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.84 
 
 		 485 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  46.6 
 
 		 489 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.78 
 
 		 493 aa  368  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.18 
 
 		 489 aa  361  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.2 
 
 		 485 aa  359  5e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.47 
 
 		 483 aa  355  8.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  43.41 
 
 		 485 aa  355  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.1 
 
 		 483 aa  350  3e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  40.73 
 
 		 490 aa  334  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  41.37 
 
 		 501 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.68 
 
 		 481 aa  332  8e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  40.64 
 
 		 503 aa  326  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.34 
 
 		 490 aa  320  3.9999999999999996e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  40.08 
 
 		 488 aa  316  7e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  38.66 
 
 		 482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.41 
 
 		 487 aa  307  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.39 
 
 		 484 aa  300  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.87 
 
 		 486 aa  296  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  37.4 
 
 		 488 aa  288  2e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.98 
 
 		 486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.31 
 
 		 481 aa  282  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.92 
 
 		 490 aa  277  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  37.34 
 
 		 492 aa  270  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 		 504 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  34.93 
 
 		 473 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  37.11 
 
 		 493 aa  227  3e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  32.48 
 
 		 489 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  35.93 
 
 		 461 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  32.05 
 
 		 972 aa  216  5e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.26 
 
 		 458 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.93 
 
 		 478 aa  211  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  30.18 
 
 		 471 aa  205  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.6 
 
 		 472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 		 470 aa  193  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.44 
 
 		 503 aa  193  6e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 		 547 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.06 
 
 		 476 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  35.73 
 
 		 578 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  34.87 
 
 		 577 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  32.04 
 
 		 570 aa  180  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  30.02 
 
 		 933 aa  180  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.06 
 
 		 573 aa  178  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  30.2 
 
 		 487 aa  177  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.22 
 
 		 924 aa  176  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  30 
 
 		 487 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.34 
 
 		 574 aa  173  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  34.3 
 
 		 640 aa  172  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.61 
 
 		 954 aa  171  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  32.53 
 
 		 584 aa  166  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  30.95 
 
 		 921 aa  163  7e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  29.52 
 
 		 610 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.84 
 
 		 636 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  32.02 
 
 		 535 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  31.52 
 
 		 615 aa  157  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  31.68 
 
 		 643 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  30.58 
 
 		 645 aa  156  7e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.37 
 
 		 642 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  30.49 
 
 		 639 aa  154  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  30.23 
 
 		 643 aa  151  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  28.63 
 
 		 646 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  30.43 
 
 		 629 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  29.21 
 
 		 611 aa  150  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 		 629 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  28.39 
 
 		 635 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  29.92 
 
 		 557 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  32.47 
 
 		 641 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  30.61 
 
 		 629 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  27.39 
 
 		 579 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  29.22 
 
 		 635 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  29.95 
 
 		 557 aa  147  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  30.7 
 
 		 647 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  32.17 
 
 		 647 aa  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  29.55 
 
 		 629 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  29.34 
 
 		 634 aa  144  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  29.33 
 
 		 723 aa  143  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  30.75 
 
 		 630 aa  143  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  29.51 
 
 		 646 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  31.18 
 
 		 551 aa  143  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 		 822 aa  143  9e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  30.3 
 
 		 766 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  30.13 
 
 		 646 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  31.67 
 
 		 681 aa  141  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  27.83 
 
 		 599 aa  141  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 709 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  29.55 
 
 		 793 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>