215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1560 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1560  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
611 aa  1183    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  56.87 
 
 
591 aa  557  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20431  hypothetical protein  54.9 
 
 
711 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  36.23 
 
 
798 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  29.23 
 
 
769 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4092  ComEC/Rec2-related protein  28.67 
 
 
748 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4131  ComEC/Rec2-related protein  31.21 
 
 
748 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  24.8 
 
 
734 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2458  ComEC/Rec2-related protein  35.69 
 
 
724 aa  133  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000361147  unclonable  0.000000000000145403 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3864  ComEC/Rec2-related protein  34.92 
 
 
816 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0924  comEC/Rec2-like protein  30.98 
 
 
792 aa  123  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.158151  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  37.55 
 
 
837 aa  100  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0825  ComEC/Rec2-related protein  34.39 
 
 
784 aa  100  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0607183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.18 
 
 
757 aa  96.3  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1667  ComEC/Rec2-related protein  27.15 
 
 
469 aa  95.5  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.85 
 
 
780 aa  95.1  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1203  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.66 
 
 
770 aa  94.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  27 
 
 
684 aa  94.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7077  ComEC/Rec2-related protein  34.39 
 
 
516 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3188  ComEC/Rec2-related protein  36.62 
 
 
519 aa  90.9  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3433  ComEC/Rec2-related protein  28.45 
 
 
494 aa  90.9  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.179393 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2244  ComEC/Rec2-related protein  32.76 
 
 
656 aa  90.5  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.425398  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  32.91 
 
 
493 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1887  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.09 
 
 
772 aa  90.1  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.12 
 
 
794 aa  90.1  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.32 
 
 
773 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  27.11 
 
 
684 aa  88.6  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  32.04 
 
 
706 aa  88.2  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1609  ComEC/Rec2-related protein  27.17 
 
 
546 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  27.53 
 
 
671 aa  87  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.64 
 
 
773 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.84 
 
 
781 aa  86.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  33.01 
 
 
626 aa  85.9  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.13 
 
 
778 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.5 
 
 
791 aa  85.5  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  34.8 
 
 
489 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2275  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)- like protein  34.11 
 
 
798 aa  84.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805588  normal  0.334125 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2229  ComEC/Rec2-related protein  37.37 
 
 
502 aa  84.7  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.019727  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28 
 
 
759 aa  84  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1258  ComEC/Rec2-related protein  35.91 
 
 
872 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0672087 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  22.78 
 
 
679 aa  82.8  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07760  ComEC/Rec2-related protein  28.72 
 
 
843 aa  82.4  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.121725  normal  0.611385 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  40.14 
 
 
781 aa  82.4  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17320  ComEC/Rec2-related protein  34.38 
 
 
829 aa  82  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.111271  normal  0.0143903 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1738  ComEC/Rec2-related protein protein  36.73 
 
 
821 aa  82  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  23.39 
 
 
531 aa  81.3  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  22.88 
 
 
720 aa  80.9  0.00000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3524  ComEC/Rec2-related protein  36.11 
 
 
514 aa  80.5  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.683854  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12450  Putative ComEC/Rec2-related protein  32.01 
 
 
867 aa  80.1  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.92 
 
 
773 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2101  ComEC/Rec2-related protein  24.63 
 
 
636 aa  79.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.639499  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2538  ComEC/Rec2-related protein  23.12 
 
 
604 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.96 
 
 
773 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1143  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  38.71 
 
 
859 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0774  ComEC/Rec2-related protein  33.47 
 
 
559 aa  77  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.434179  normal  0.339317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.51 
 
 
773 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0330  putative hydrolase  31.47 
 
 
474 aa  76.6  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1519  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.95 
 
 
790 aa  77  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1561  ComEC/Rec2-related protein  32.83 
 
 
826 aa  75.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.16578  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0927  ComEC/Rec2-related protein  28.81 
 
 
694 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  26.61 
 
 
672 aa  74.7  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1955  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.17 
 
 
786 aa  74.3  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1639  ComEC/Rec2-related protein  29.91 
 
 
695 aa  73.9  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.830432  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  33.67 
 
 
710 aa  73.9  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4317  ComEC/Rec2-related protein  30.53 
 
 
872 aa  73.9  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1519  ComEC/Rec2-related protein  29.14 
 
 
531 aa  73.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0429537  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0243  ComEC/Rec2-related protein  27.67 
 
 
369 aa  72.8  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  29.33 
 
 
773 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.04 
 
 
840 aa  72  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3434  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  36.19 
 
 
800 aa  70.9  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242762  normal  0.0166392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  31.25 
 
 
593 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  22.9 
 
 
672 aa  70.9  0.00000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  35.68 
 
 
503 aa  70.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1320  ComEC/Rec2-related protein  25.43 
 
 
524 aa  70.1  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.725773  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2785  ComEC/Rec2-related protein  28.98 
 
 
726 aa  70.1  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.457375  hitchhiker  0.00294021 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.33 
 
 
654 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1470  ComEC/Rec2-related protein  28.1 
 
 
609 aa  69.7  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.85 
 
 
772 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.85 
 
 
773 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.85 
 
 
772 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.1 
 
 
752 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  24.43 
 
 
674 aa  69.3  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.15 
 
 
734 aa  68.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2207  hypothetical protein  30.18 
 
 
754 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.01066  normal  0.239269 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  29.1 
 
 
706 aa  68.9  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.97 
 
 
796 aa  68.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13280  ComEC/Rec2-related protein  28.21 
 
 
888 aa  68.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.368254 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.65 
 
 
818 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  28.57 
 
 
697 aa  67.8  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0575  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.04 
 
 
809 aa  67.4  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  35.46 
 
 
806 aa  66.6  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1551  ComEC/Rec2-related protein  26.69 
 
 
734 aa  67  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1011  hypothetical protein  28.63 
 
 
754 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00460048  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0942  ComEC/Rec2-like protein  26.09 
 
 
562 aa  66.6  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  25.28 
 
 
708 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  28.62 
 
 
879 aa  65.9  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3303  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  33.21 
 
 
789 aa  66.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.78547  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5470  ComEC/Rec2-related protein  37.5 
 
 
819 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  23.02 
 
 
795 aa  65.1  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3672  ComEC/Rec2-related protein  21.19 
 
 
454 aa  64.7  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>