167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2565 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2565  sigma-54 factor  100 
 
 
662 aa  1318    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.289153  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29251  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  62.92 
 
 
695 aa  855    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3607  cyclic nucleotide-binding protein  42.18 
 
 
841 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.29767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3536  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  41.69 
 
 
841 aa  494  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1527  nitrogen assimilation regulatory protein  43.05 
 
 
838 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0745  cyclic nucleotide-binding protein  44.43 
 
 
837 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.274315  normal  0.0506496 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3683  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.05 
 
 
476 aa  165  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3170  cyclic nucleotide-binding protein  27.42 
 
 
785 aa  160  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0158223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.69 
 
 
476 aa  153  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.613283 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  27.52 
 
 
857 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2488  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.73 
 
 
462 aa  133  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  24.95 
 
 
860 aa  119  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1451  cyclic nucleotide-binding protein  28.02 
 
 
516 aa  99.8  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0275  polyferredoxin-like  24.33 
 
 
918 aa  87.8  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0469  hypothetical protein  30.93 
 
 
619 aa  80.5  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3291  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.69 
 
 
470 aa  80.5  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00624459  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1993  hypothetical protein  28.86 
 
 
452 aa  77.4  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3247  hypothetical protein  24.14 
 
 
463 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1656  hypothetical protein  25.11 
 
 
452 aa  75.5  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2230  polyferredoxin-like protein  28.03 
 
 
465 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5871  polyferredoxin-like  26.94 
 
 
465 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2206  polyferredoxin-like protein  26.94 
 
 
465 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1371  polyferredoxin-like protein  24 
 
 
474 aa  72  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2032  hypothetical protein  28.74 
 
 
466 aa  72  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1924  nitrogen fixation protein VnfA  28.19 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5534  polyferredoxin-like  26.77 
 
 
465 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0884  hypothetical protein  28.19 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1743  hypothetical protein  28.19 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0676107  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0011  hypothetical protein  28.19 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0511  hypothetical protein  28.19 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0911  hypothetical protein  28.19 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0609  hypothetical protein  28.35 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.398547  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2123  polyferredoxin-like protein  27.17 
 
 
465 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.334313  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2244  polyferredoxin-like protein  28.02 
 
 
465 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1071  polyferredoxin-like protein  28.43 
 
 
465 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1400  putative nitrogen fixation protein VnfA  28.5 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11103  normal  0.0950642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1954  putative nitrogen fixation protein VnfA  27.73 
 
 
469 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285515  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3149  putative nitrogen fixation protein VnfA  26.89 
 
 
468 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.604637  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3801  hypothetical protein  31.49 
 
 
477 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0435809  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3606  nitrogen fixation protein VnfA  28.69 
 
 
461 aa  63.9  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_881  NapH protein  32.86 
 
 
480 aa  62.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4288  hypothetical protein  35.03 
 
 
471 aa  62  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0607453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0216  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  29.87 
 
 
334 aa  61.6  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.417368  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0392  hypothetical protein  33.55 
 
 
484 aa  60.8  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3630  hypothetical protein  30.6 
 
 
474 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00502149 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0384  hypothetical protein  31.69 
 
 
477 aa  58.9  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2522  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  25.58 
 
 
509 aa  58.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0332  hypothetical protein  31.69 
 
 
457 aa  57.8  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2352  polyferredoxin-like protein  27.46 
 
 
438 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1873  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.98 
 
 
368 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2165  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.68 
 
 
368 aa  55.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0573677  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1282  putative GAF sensor protein  25.12 
 
 
509 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3153  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
335 aa  54.3  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.758597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1329  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.64 
 
 
645 aa  54.3  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.2343  normal  0.019579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0297  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.43 
 
 
335 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.012248  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2322  4Fe-4S binding domain protein  30.43 
 
 
357 aa  53.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2603  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.43 
 
 
357 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.31548 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1109  putative regulatory protein  30.15 
 
 
463 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4134  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  22.94 
 
 
503 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0773  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.67 
 
 
404 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3704  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
329 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1379  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.47 
 
 
351 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0798  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.29 
 
 
356 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223587  hitchhiker  0.00276018 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07620  4Fe-4S protein  23.38 
 
 
292 aa  53.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.49628 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00995  predicted 4Fe-4S membrane protein  29.91 
 
 
357 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2650  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.91 
 
 
357 aa  52  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000361433  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0274  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.25 
 
 
326 aa  52  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01002  hypothetical protein  29.91 
 
 
357 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.682335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.91 
 
 
357 aa  52  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1108  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.91 
 
 
357 aa  52  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000240222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1228  4Fe-4S binding domain protein  29.91 
 
 
357 aa  52  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00146315  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0759  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  30.51 
 
 
356 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.939096  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2132  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.91 
 
 
357 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  19.89 
 
 
314 aa  51.6  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0361  Fis family transcriptional regulator  44.44 
 
 
681 aa  52  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0810  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.62 
 
 
356 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.232624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2681  iron-sulfur cluster-binding protein  30.82 
 
 
518 aa  51.2  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0806  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.36 
 
 
358 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0103679  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1300  putative phytochrome sensor protein  25.12 
 
 
518 aa  50.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1441  putative phytochrome sensor protein  24.77 
 
 
514 aa  50.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.21 
 
 
334 aa  50.8  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0764  transcriptional regulator NifA  26.44 
 
 
511 aa  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2373  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  25.36 
 
 
544 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0570817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0599  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.7 
 
 
325 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.856458  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0294  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.3 
 
 
404 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1565  NapH/MauN family ferredoxin-type protein  25.77 
 
 
327 aa  49.7  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0341638  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0428  hypothetical protein  29.29 
 
 
440 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1038  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25.66 
 
 
468 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3912  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.93 
 
 
404 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2084  hypothetical protein  29.29 
 
 
440 aa  49.3  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3227  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25.22 
 
 
468 aa  48.5  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0626  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28 
 
 
460 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0416  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.03 
 
 
404 aa  48.5  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0311  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.03 
 
 
404 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3193  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  26.83 
 
 
728 aa  48.5  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0315  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.03 
 
 
404 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0314  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.03 
 
 
404 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2044  putative sigma54 specific transcriptional regulator  29.88 
 
 
519 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.526812 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
444 aa  47.8  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6007  nitrous oxide reductase regulatory protein NosR  28.7 
 
 
764 aa  48.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>