More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2535 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2535  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  508  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1696  hypothetical protein  62.81 
 
 
246 aa  309  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.578384  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15681  hypothetical protein  41.25 
 
 
243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1463  hypothetical protein  39.42 
 
 
242 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0774307  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15311  hypothetical protein  38.14 
 
 
243 aa  188  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15531  hypothetical protein  40.83 
 
 
243 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0513968  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1546  hypothetical protein  39.74 
 
 
229 aa  186  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.105778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3811  hypothetical protein  42.13 
 
 
231 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3853  hypothetical protein  42.13 
 
 
231 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3913  hypothetical protein  42.13 
 
 
231 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.356203 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3733  protein YhhW  41.7 
 
 
231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735442  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  42.13 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  42.13 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  42.13 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  42.13 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  42.13 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  42.13 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4755  pirin family protein  42.98 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  42.13 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  42.13 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3744  protein YhhW  42.55 
 
 
231 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3847  pirin domain-containing protein  40.43 
 
 
231 aa  183  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1852  Pirin-like  43.28 
 
 
233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  43.4 
 
 
229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4023  YhhW family protein  40.43 
 
 
231 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4103  hypothetical protein  40.43 
 
 
231 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0133  pirin domain-containing protein  40.43 
 
 
231 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.973345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  40 
 
 
231 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0205  pirin domain-containing protein  41.28 
 
 
231 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00137  pirin, N-terminal  39.83 
 
 
233 aa  175  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.071299  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  39.33 
 
 
236 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  39.33 
 
 
236 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4143  Pirin domain protein  39.15 
 
 
231 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0251  Pirin domain protein  40.85 
 
 
231 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0203  Pirin domain protein  38.72 
 
 
232 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4653  pirin domain-containing protein  39.83 
 
 
231 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2664  pirin domain-containing protein  42.56 
 
 
231 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0801192  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  40.42 
 
 
242 aa  168  9e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2012  Pirin domain protein  40.17 
 
 
232 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3538  pirin domain-containing protein  38.14 
 
 
232 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.100784 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3156  pirin domain-containing protein  38.91 
 
 
236 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2406  Pirin domain protein  40.17 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481818  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  39.41 
 
 
236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1365  Pirin domain protein  38.49 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2998  pirin domain-containing protein  38.49 
 
 
236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1220  pirin domain-containing protein  40 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.110776  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1291  pirin domain-containing protein  40 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  39.67 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0932  Pirin domain protein  38.49 
 
 
232 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  39.15 
 
 
241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5842  pirin domain-containing protein  39.15 
 
 
241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3013  pirin domain-containing protein  38.08 
 
 
236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  40.51 
 
 
232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1221  pirin domain-containing protein  41.06 
 
 
231 aa  162  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1390  hypothetical protein  42.92 
 
 
231 aa  162  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0092148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2564  pirin domain-containing protein  45.88 
 
 
247 aa  162  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.216137  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  41 
 
 
232 aa  161  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  40.68 
 
 
235 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1969  hypothetical protein  40.76 
 
 
241 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  38.98 
 
 
236 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7633  Pirin-like protein  38.98 
 
 
241 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2901  Pirin-like  41.08 
 
 
233 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278397  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0103  Pirin-like  36.55 
 
 
245 aa  159  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0629  Pirin domain protein  41.03 
 
 
232 aa  159  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.415085  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  39.17 
 
 
233 aa  158  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  40.08 
 
 
236 aa  158  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2208  putative pirin-like protein  37.29 
 
 
232 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677646  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  40.25 
 
 
232 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  39.92 
 
 
235 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5765  Pirin-like  37.71 
 
 
241 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1676  Pirin-like  41.67 
 
 
231 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.192961  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6612  pirin domain-containing protein  37.71 
 
 
241 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.404162 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6130  pirin domain-containing protein  37.71 
 
 
241 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4422  Pirin-like  41.39 
 
 
238 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1976  hypothetical protein  38.66 
 
 
241 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162515  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  39.66 
 
 
232 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5399  Pirin domain protein  37.24 
 
 
241 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102577  normal  0.0781504 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0585  cupin domain-containing protein  38.66 
 
 
241 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  39.42 
 
 
235 aa  156  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000958  pirin-related protein  39.9 
 
 
231 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2931  pirin domain-containing protein  39.17 
 
 
233 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0678  cupin domain-containing protein  38.66 
 
 
241 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  37.39 
 
 
240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4046  pirin domain-containing protein  42.29 
 
 
233 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600908  normal  0.055577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0758  pirin domain-containing protein  38.91 
 
 
241 aa  155  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.966518  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0402  Pirin-like  38.33 
 
 
234 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3182  Pirin domain protein  40 
 
 
237 aa  154  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2889  putative pirin-like protein  40.17 
 
 
233 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.586462  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  38.59 
 
 
232 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0725  pirin domain-containing protein  39.33 
 
 
233 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2559  pirin domain-containing protein  38.08 
 
 
356 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922785  normal  0.147332 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0060  hypothetical protein  42.5 
 
 
232 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225741  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5473  Pirin domain protein  38.49 
 
 
239 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1210  hypothetical protein  36.82 
 
 
241 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114398  normal  0.265926 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0430  Pirin domain protein  39.42 
 
 
234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5198  hypothetical protein  40.7 
 
 
232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.312315  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2575  Pirin-like  40.25 
 
 
233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1785  Pirin domain protein  39.75 
 
 
233 aa  152  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0431  Pirin domain protein  39.42 
 
 
234 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6056  pirin domain-containing protein  36.86 
 
 
241 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127944  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>