More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1696 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1696  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  499  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.578384  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2535  hypothetical protein  62.81 
 
 
251 aa  309  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1546  hypothetical protein  41.3 
 
 
229 aa  199  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.105778  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15311  hypothetical protein  39.92 
 
 
243 aa  195  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3913  hypothetical protein  46.35 
 
 
231 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.356203 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3853  hypothetical protein  46.35 
 
 
231 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4653  pirin domain-containing protein  45.69 
 
 
231 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3811  hypothetical protein  46.35 
 
 
231 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3733  protein YhhW  45.92 
 
 
231 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735442  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1463  hypothetical protein  38.96 
 
 
242 aa  191  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0774307  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15531  hypothetical protein  39.48 
 
 
243 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0513968  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3744  protein YhhW  44.59 
 
 
231 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0133  pirin domain-containing protein  47.72 
 
 
231 aa  188  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.973345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4103  hypothetical protein  47.72 
 
 
231 aa  188  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4023  YhhW family protein  47.72 
 
 
231 aa  188  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4143  Pirin domain protein  43.35 
 
 
231 aa  188  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  45.73 
 
 
235 aa  188  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.370219 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  44.83 
 
 
231 aa  187  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  44.83 
 
 
231 aa  187  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  44.83 
 
 
231 aa  187  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  44.83 
 
 
231 aa  187  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  44.83 
 
 
231 aa  187  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  44.83 
 
 
231 aa  187  9e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  44.83 
 
 
231 aa  187  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3847  pirin domain-containing protein  43.53 
 
 
231 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15681  hypothetical protein  38.33 
 
 
243 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0251  Pirin domain protein  44.59 
 
 
231 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  44.4 
 
 
231 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4755  pirin family protein  44.16 
 
 
231 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  42.92 
 
 
231 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  43.28 
 
 
239 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2406  Pirin domain protein  41.45 
 
 
232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481818  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0205  pirin domain-containing protein  45.15 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2012  Pirin domain protein  41.03 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1852  Pirin-like  41.45 
 
 
233 aa  182  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2551  Pirin domain protein  41.88 
 
 
236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3564  Pirin domain protein  41.88 
 
 
236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0203  Pirin domain protein  46.77 
 
 
232 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000958  pirin-related protein  41.56 
 
 
231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000774517  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0629  Pirin domain protein  42.31 
 
 
232 aa  177  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.415085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1390  hypothetical protein  46.63 
 
 
231 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0092148 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1221  pirin domain-containing protein  38.53 
 
 
231 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.897117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1220  pirin domain-containing protein  38.79 
 
 
231 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.110776  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1291  pirin domain-containing protein  38.79 
 
 
231 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2664  pirin domain-containing protein  40.17 
 
 
231 aa  175  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0801192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1676  Pirin-like  45.31 
 
 
231 aa  175  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.192961  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  44.87 
 
 
235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1785  Pirin domain protein  47.21 
 
 
233 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  41.45 
 
 
233 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  41.88 
 
 
232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3538  pirin domain-containing protein  40.85 
 
 
232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.100784 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1365  Pirin domain protein  39.32 
 
 
236 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  43.16 
 
 
236 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2901  Pirin-like  44.3 
 
 
233 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278397  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  40.17 
 
 
242 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1985  pirin domain-containing protein  47.21 
 
 
233 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.344267  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  40.08 
 
 
232 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2931  pirin domain-containing protein  41.88 
 
 
233 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  43.16 
 
 
236 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  42.86 
 
 
229 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0932  Pirin domain protein  38.46 
 
 
232 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2998  pirin domain-containing protein  38.89 
 
 
236 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4422  Pirin-like  42.11 
 
 
238 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3156  pirin domain-containing protein  38.03 
 
 
236 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2575  Pirin-like  41.88 
 
 
233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0431  Pirin domain protein  41.88 
 
 
234 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  43.46 
 
 
236 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3013  pirin domain-containing protein  38.46 
 
 
236 aa  165  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  43.46 
 
 
232 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  42.98 
 
 
232 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0430  Pirin domain protein  41.28 
 
 
234 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0356  Pirin domain protein  40.37 
 
 
238 aa  164  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00920786  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2559  pirin domain-containing protein  40.65 
 
 
356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922785  normal  0.147332 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  41.28 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1833  Pirin-like protein  43.39 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.441024  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  43.46 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1808  Pirin-like  42.19 
 
 
232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2579  Pirin-like protein  39.66 
 
 
232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3182  Pirin domain protein  38.36 
 
 
237 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0725  pirin domain-containing protein  39.57 
 
 
233 aa  161  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0103  Pirin-like  35.47 
 
 
245 aa  161  9e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2208  putative pirin-like protein  37.97 
 
 
232 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677646  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2564  pirin domain-containing protein  51.33 
 
 
247 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.216137  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0402  Pirin-like  40.43 
 
 
234 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4046  pirin domain-containing protein  40.17 
 
 
233 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600908  normal  0.055577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00137  pirin, N-terminal  37.77 
 
 
233 aa  159  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.071299  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1172  pirin domain-containing protein  37.5 
 
 
253 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2889  putative pirin-like protein  40.51 
 
 
233 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.586462  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2564  Pirin domain protein  42.79 
 
 
232 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1735  pirin domain-containing protein  38.63 
 
 
238 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1295  hypothetical protein  41.43 
 
 
235 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1168  Pirin domain protein  40.35 
 
 
233 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0688  pirin domain-containing protein  39.83 
 
 
236 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3151  pirin domain-containing protein  42.79 
 
 
232 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.725555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3304  pirin domain-containing protein  42.79 
 
 
232 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  39.06 
 
 
241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5842  pirin domain-containing protein  39.06 
 
 
241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2970  pirin domain-containing protein  42.79 
 
 
232 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.496541  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5011  Pirin domain protein  35.83 
 
 
239 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.118711  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1316  pirin domain-containing protein  41.99 
 
 
235 aa  155  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0724579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>