More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0356 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0356  Pirin domain protein  100 
 
 		 238 aa  494  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00920786  normal  0.313819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2096  pirin-related protein  60 
 
 		 268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.295198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5011  Pirin domain protein  57.63 
 
 		 239 aa  291  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.118711  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1735  pirin domain-containing protein  54.62 
 
 		 238 aa  285  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2303  pirin domain-containing protein  54.31 
 
 		 237 aa  264  1e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000285966  normal  0.0109374 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0621  pirin domain-containing protein  55.17 
 
 		 235 aa  261  6e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000898789  normal  0.199637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0380  Pirin domain protein  50.21 
 
 		 236 aa  256  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.489995 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1402  Pirin family proteins  53.45 
 
 		 236 aa  254  6e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000212208  normal  0.0720528 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1544  Pirin-like  53.02 
 
 		 236 aa  254  6e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.10868  normal  0.29614 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09076  possible Pirin family protein  47.64 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1827  Pirin domain protein  49.14 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0905594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0340  hypothetical protein  47.41 
 
 		 242 aa  231  6e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1502  Pirin domain protein  43.04 
 
 		 233 aa  195  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.231424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2406  Pirin domain protein  42.61 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.481818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2012  Pirin domain protein  42.17 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2208  putative pirin-like protein  42.17 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677646  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3095  Pirin domain protein  42.86 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000217046  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3945  Pirin domain protein  40.87 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0203  Pirin domain protein  41.74 
 
 		 232 aa  185  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47850  Pirin-like protein  41.88 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0553  Pirin, N-terminal  41.74 
 
 		 235 aa  183  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.370219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3182  Pirin domain protein  39.83 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4103  hypothetical protein  39.57 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0251  Pirin domain protein  40 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.320122  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4653  pirin domain-containing protein  40.43 
 
 		 231 aa  179  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0891  hypothetical protein  39.82 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1852  Pirin-like  39.04 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0133  pirin domain-containing protein  39.57 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.973345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4023  YhhW family protein  39.57 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0276  Pirin domain protein  40 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4143  Pirin domain protein  40 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3123  Pirin domain protein  41.67 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235206  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03290  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.32251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03243  hypothetical protein  40 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3913  hypothetical protein  39.57 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.356203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3917  pirin family protein  40 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3886  pirin family protein  40 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.688116  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3722  pirin family protein  40 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3638  pirin family protein  40 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.502653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0274  pirin domain-containing protein  40 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3811  hypothetical protein  39.57 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3853  hypothetical protein  39.57 
 
 		 231 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43440  Pirin-like, pirA  40.69 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.277134  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3733  protein YhhW  39.57 
 
 		 231 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4755  pirin family protein  40 
 
 		 231 aa  178  9e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1546  hypothetical protein  42.22 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.105778  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2931  pirin domain-containing protein  40 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6056  pirin domain-containing protein  41.18 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.127944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5473  Pirin domain protein  41.81 
 
 		 239 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3903  pirin domain-containing protein  41.7 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3744  protein YhhW  39.57 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2162  pirin domain-containing protein  38.67 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.222255  hitchhiker  0.000000297327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1808  Pirin-like  42.36 
 
 		 232 aa  174  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0758  pirin domain-containing protein  41.05 
 
 		 241 aa  174  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.966518  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3847  pirin domain-containing protein  38.7 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3389  hypothetical protein  39.91 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0902  Pirin, N-terminal  42.15 
 
 		 232 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1786  hypothetical protein  41.3 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1955  Pirin-like  40 
 
 		 240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1963  Pirin domain protein  41.36 
 
 		 236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.210241  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0288  Pirin domain protein  41.52 
 
 		 229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2559  pirin domain-containing protein  40.81 
 
 		 356 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.922785  normal  0.147332 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3608  Pirin, N-terminal  40.43 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.694898  normal  0.724404 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1969  hypothetical protein  40.76 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1097  cupin domain-containing protein  38.94 
 
 		 236 aa  172  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6078  pirin domain-containing protein  40.85 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1123  Pirin domain protein  39.46 
 
 		 236 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4046  pirin domain-containing protein  39.57 
 
 		 233 aa  171  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600908  normal  0.055577 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1092  cupin domain-containing protein  38.94 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5842  pirin domain-containing protein  40.43 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2901  Pirin-like  40.43 
 
 		 233 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.278397  normal  0.818656 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2889  putative pirin-like protein  39.83 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.586462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1785  Pirin domain protein  40 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0688  pirin domain-containing protein  40 
 
 		 236 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1976  hypothetical protein  40.34 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.162515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2579  Pirin-like protein  39.74 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0585  cupin domain-containing protein  40.34 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7633  Pirin-like protein  39.08 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0678  cupin domain-containing protein  40.34 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1250  hypothetical protein  38.5 
 
 		 232 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6612  pirin domain-containing protein  39.08 
 
 		 241 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.404162 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5765  Pirin-like  39.08 
 
 		 241 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1985  pirin domain-containing protein  40 
 
 		 233 aa  168  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.344267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6130  pirin domain-containing protein  39.08 
 
 		 241 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2575  Pirin-like  39.46 
 
 		 233 aa  168  8e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4378  Pirin domain protein  37.83 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.3337 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5399  Pirin domain protein  39.57 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102577  normal  0.0781504 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2268  hypothetical protein  37.61 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00137  pirin, N-terminal  38.05 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.071299  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1210  hypothetical protein  41.53 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114398  normal  0.265926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1696  hypothetical protein  40.37 
 
 		 246 aa  164  9e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.578384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1833  Pirin-like protein  37.83 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.441024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0725  pirin domain-containing protein  38.26 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4908  hypothetical protein  39.46 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5283  hypothetical protein  39.46 
 
 		 232 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4753  pirin  39.46 
 
 		 232 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0060  hypothetical protein  39.38 
 
 		 232 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.225741  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4868  pirin domain-containing protein  40 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4772  pirin  39.46 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48650  hypothetical protein  40.09 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00951515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>