More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1966 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_12141  DNA polymerase I  67.31 
 
 		 985 aa  1378    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.503839 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0748  DNA polymerase I  65.69 
 
 		 986 aa  1321    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  49.5 
 
 		 977 aa  893    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0693  DNA polymerase I  84.07 
 
 		 998 aa  1683    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.433628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1966  DNA polymerase I  100 
 
 		 986 aa  1990    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.378529 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1236  DNA polymerase I  58.98 
 
 		 976 aa  1203    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  56.87 
 
 		 953 aa  1001    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13291  DNA polymerase I  58.94 
 
 		 976 aa  1205    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  51.97 
 
 		 972 aa  931    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  51.22 
 
 		 982 aa  904    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13041  DNA polymerase I  60.08 
 
 		 976 aa  1211    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  49.45 
 
 		 982 aa  887    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0546  DNA polymerase I  44.68 
 
 		 1045 aa  837    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13151  DNA polymerase I  59.25 
 
 		 976 aa  1206    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  49.6 
 
 		 966 aa  893    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08691  DNA polymerase I  78.38 
 
 		 986 aa  1531    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15881  DNA polymerase I  65.38 
 
 		 986 aa  1326    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.65374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  51.97 
 
 		 972 aa  931    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 891 aa  609  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  40.22 
 
 		 926 aa  591  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  39.72 
 
 		 892 aa  590  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 903 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 939 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  37.3 
 
 		 949 aa  585  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 916 aa  582  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  38.54 
 
 		 934 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  39.35 
 
 		 906 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  41.24 
 
 		 908 aa  573  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  37.18 
 
 		 956 aa  571  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.51 
 
 		 951 aa  570  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  37.98 
 
 		 934 aa  570  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  37.91 
 
 		 943 aa  567  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  39.01 
 
 		 928 aa  568  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  38.1 
 
 		 936 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  39.12 
 
 		 945 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 911 aa  565  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  38.01 
 
 		 934 aa  566  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  39.24 
 
 		 906 aa  561  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  37.76 
 
 		 941 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  36.79 
 
 		 892 aa  561  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  38.62 
 
 		 892 aa  559  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  38.46 
 
 		 930 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  38.31 
 
 		 950 aa  562  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  39.88 
 
 		 928 aa  562  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  38.06 
 
 		 924 aa  560  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  38.68 
 
 		 926 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  37.99 
 
 		 915 aa  557  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 931 aa  557  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  38.68 
 
 		 926 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  38.68 
 
 		 926 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  37.6 
 
 		 942 aa  557  1e-157  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  38.36 
 
 		 923 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  38.36 
 
 		 923 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  38.36 
 
 		 923 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 930 aa  557  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 912 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  38.68 
 
 		 926 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  37.31 
 
 		 944 aa  553  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  37.45 
 
 		 891 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  38.26 
 
 		 936 aa  553  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  36.07 
 
 		 939 aa  553  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  38.73 
 
 		 926 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  36.45 
 
 		 963 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  37.31 
 
 		 928 aa  553  1e-156  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.45 
 
 		 893 aa  554  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  36.69 
 
 		 938 aa  553  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  36.37 
 
 		 902 aa  550  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  37.56 
 
 		 940 aa  549  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  38.42 
 
 		 928 aa  551  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  39.19 
 
 		 917 aa  551  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 934 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 917 aa  550  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  39.53 
 
 		 899 aa  547  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 908 aa  547  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  35.29 
 
 		 932 aa  548  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  37.81 
 
 		 937 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  37.91 
 
 		 937 aa  548  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  38.59 
 
 		 888 aa  547  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  39.53 
 
 		 899 aa  547  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  37.81 
 
 		 933 aa  546  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  36.47 
 
 		 930 aa  548  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  36.27 
 
 		 902 aa  547  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  37.71 
 
 		 932 aa  545  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  39 
 
 		 917 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  36.98 
 
 		 903 aa  543  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  39.4 
 
 		 935 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  37.59 
 
 		 929 aa  544  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  39.48 
 
 		 915 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  38.43 
 
 		 936 aa  544  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  37.71 
 
 		 932 aa  543  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  37.71 
 
 		 932 aa  543  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  39.1 
 
 		 917 aa  546  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  38.72 
 
 		 913 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  37.37 
 
 		 943 aa  543  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  39.68 
 
 		 915 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  37.24 
 
 		 896 aa  541  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  39.48 
 
 		 915 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  37.57 
 
 		 972 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  37.88 
 
 		 957 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  39.29 
 
 		 917 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>