More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1877 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1877  nucleotide sugar epimerase  100 
 
 		 301 aa  619  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0776  nucleotide sugar epimerase  81.73 
 
 		 306 aa  508  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17471  putative mRNA binding protein  77.74 
 
 		 341 aa  501  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0205  putative mRNA binding protein  59.4 
 
 		 307 aa  391  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08371  putative mRNA binding protein  58.72 
 
 		 307 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499278  normal  0.0509544 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09641  putative mRNA binding protein  57.05 
 
 		 323 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.513424  hitchhiker  0.0042312 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07841  putative mRNA binding protein  49.17 
 
 		 306 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1826  mRNA-binding protein  52.48 
 
 		 313 aa  330  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.334449 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08611  putative mRNA binding protein  47.84 
 
 		 306 aa  328  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08581  putative mRNA binding protein  47.51 
 
 		 306 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0805  putative mRNA binding protein  47.51 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.788288  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2691  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.01 
 
 		 310 aa  305  5.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2101  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  47.39 
 
 		 313 aa  295  5e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2758  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.85 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.52 
 
 		 309 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.81324 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4630  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.85 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.01826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.19 
 
 		 309 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30466  predicted protein  40.13 
 
 		 361 aa  219  3.9999999999999997e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43121  predicted protein  32.66 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154535 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43341  predicted protein  32.66 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0269246 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43169  predicted protein  29.07 
 
 		 404 aa  112  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0856686  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 		 328 aa  89.4  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.30935  normal  0.512704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.05 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1526  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.672845  hitchhiker  0.00016367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2035  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499801  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.46 
 
 		 342 aa  79  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1575  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.684899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0390546  normal  0.187548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0263  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.18 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.25 
 
 		 349 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.65 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3192  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.69 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2770  isoflavone reductase  25.56 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6286  Isoflavone_redu, isoflavone reductase  28.87 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4240  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.88 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.596937  normal  0.966404 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1427  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.74 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4508  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3063  hypothetical protein  26.87 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3050  isoflavone reductase  39.18 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2810  isoflavone reductase  37.11 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00175876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0308  UDP-glucose 4-epimerase  22.88 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3080  hypothetical protein  25.66 
 
 		 340 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2836  hypothetical protein  36.08 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00215985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3051  hypothetical protein  36.08 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5542  hypothetical protein  26.51 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.18 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2967  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.47 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.4 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  26.35 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0072  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.12 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2545  putative mRNA-binding protein  24.22 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0962067  hitchhiker  0.000986877 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0257  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.13 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0783672  hitchhiker  0.0000370596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0490  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2200  isoflavone reductase  37.11 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.799899  hitchhiker  0.000000000145539 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5301  hypothetical protein  26.51 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5697  hypothetical protein  26.51 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.29 
 
 		 335 aa  67  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.293726  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2833  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117402  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0330143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0338  UDP-glucose 4-epimerase  23.13 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.86 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.97 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.24 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5143  hypothetical protein  26.6 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.673361  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0323  UDP-glucose 4-epimerase  23.45 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.428855  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8736  hypothetical protein  26.58 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1785  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.79 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0852  epimerase/dehydratase family protein, putative  24.61 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4211  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.22 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0398599  normal  0.110586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8770  NAD dependent epimerase/dehydratase family  32.64 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5466  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  0.364855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2854  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.58 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1303  methyltransferase FkbM  24.92 
 
 		 619 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.99 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.17 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.73 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>