More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1638 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1638  lipoyl synthase  100 
 
 
299 aa  608  1e-173  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1398  lipoyl synthase  85.28 
 
 
299 aa  534  1e-151  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09741  lipoyl synthase  77.85 
 
 
306 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10901  lipoyl synthase  68.79 
 
 
306 aa  447  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.460798  normal  0.241228 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14841  lipoyl synthase  69.26 
 
 
307 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.446278 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0652  lipoyl synthase  68.92 
 
 
307 aa  444  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.143866  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1507  lipoyl synthase  68.28 
 
 
311 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.610333  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1107  lipoyl synthase  64.81 
 
 
302 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  61.54 
 
 
300 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  61.54 
 
 
300 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3006  lipoyl synthase  63.76 
 
 
305 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11871  lipoyl synthase  59.25 
 
 
299 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.424611  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12031  lipoyl synthase  58.89 
 
 
299 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2199  lipoic acid synthetase  62.59 
 
 
304 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.842595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  61.54 
 
 
307 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3493  lipoyl synthase  61.15 
 
 
307 aa  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1107  lipoyl synthase  59.23 
 
 
299 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.772098  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12021  lipoyl synthase  58.54 
 
 
299 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  51.75 
 
 
320 aa  287  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  52.61 
 
 
324 aa  286  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  49.83 
 
 
318 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  48.78 
 
 
298 aa  279  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  47.4 
 
 
325 aa  278  7e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  48.95 
 
 
315 aa  277  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  48.1 
 
 
298 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  49.65 
 
 
308 aa  277  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  47.57 
 
 
298 aa  276  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  48.95 
 
 
315 aa  277  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  50 
 
 
337 aa  275  5e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  47.22 
 
 
298 aa  275  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  47.93 
 
 
336 aa  275  6e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  47.22 
 
 
298 aa  275  9e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  45.67 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  51.4 
 
 
322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  51.72 
 
 
281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  46.88 
 
 
298 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  46.88 
 
 
298 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  46.88 
 
 
298 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  46.88 
 
 
298 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  47.9 
 
 
355 aa  274  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  46.88 
 
 
298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  46.88 
 
 
298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  48.96 
 
 
288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  46.88 
 
 
298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  49.48 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  48.94 
 
 
309 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  46.18 
 
 
298 aa  273  3e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  47.57 
 
 
338 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  48.97 
 
 
327 aa  271  7e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  47.57 
 
 
338 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  47.22 
 
 
338 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  47.77 
 
 
321 aa  271  9e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  47.89 
 
 
282 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  48.97 
 
 
373 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  48.97 
 
 
373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  45.64 
 
 
320 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  47.08 
 
 
321 aa  269  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  46.34 
 
 
305 aa  269  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  46.88 
 
 
338 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  46.34 
 
 
305 aa  269  5e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  48.1 
 
 
321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  48.1 
 
 
321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  48.1 
 
 
321 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3030  lipoyl synthase  47.39 
 
 
322 aa  268  5.9999999999999995e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.464318  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  47.04 
 
 
320 aa  268  7e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  50 
 
 
303 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  50 
 
 
303 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  47.1 
 
 
340 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  45.49 
 
 
319 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  48.6 
 
 
321 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1639  lipoyl synthase  45.89 
 
 
337 aa  266  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00216295  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  47.04 
 
 
321 aa  266  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  46.76 
 
 
335 aa  265  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  46.69 
 
 
321 aa  265  5.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  44.6 
 
 
314 aa  265  5.999999999999999e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  45.45 
 
 
292 aa  265  5.999999999999999e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  46.62 
 
 
323 aa  265  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2595  lipoyl synthase  47.74 
 
 
321 aa  265  8e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0686543  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  46.71 
 
 
321 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  48.1 
 
 
321 aa  265  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  46.28 
 
 
327 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  48.8 
 
 
317 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  45.73 
 
 
290 aa  263  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  48.8 
 
 
317 aa  263  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  47.92 
 
 
324 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  45.97 
 
 
335 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  45.97 
 
 
335 aa  262  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  47.75 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  46.37 
 
 
321 aa  262  6e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  47.57 
 
 
321 aa  261  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  46.34 
 
 
321 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  45.86 
 
 
317 aa  261  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  45.61 
 
 
300 aa  261  1e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3715  lipoyl synthase  46.34 
 
 
321 aa  261  1e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00165797  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0692  lipoyl synthase  48.26 
 
 
321 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  46.34 
 
 
321 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  47.55 
 
 
325 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  47.57 
 
 
298 aa  260  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  50.18 
 
 
276 aa  260  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  48.25 
 
 
287 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>