More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1620 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1620  ABC transporter related  100 
 
 		 232 aa  476  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  64.35 
 
 		 233 aa  301  4.0000000000000003e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1514  ABC transporter related  43.36 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1628  ABC transporter related  42.48 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.134998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2548  ABC transporter related  38.43 
 
 		 232 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0517142  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2153  ABC transporter-like protein  41.18 
 
 		 226 aa  179  4e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.805866 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2644  ABC transporter related  39.74 
 
 		 232 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0794  ABC transporter related protein  40.53 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1403  ABC transporter ATP-binding protein  37.39 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.474757  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1408  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.71986  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1244  ABC transporter related  37 
 
 		 232 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0865579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1078  ABC transporter-related protein  36.4 
 
 		 232 aa  164  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3935  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.160984 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1279  ABC transporter related  36.84 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00396005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0167  ABC transporter, ATP-binding protein  36.68 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1244  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 		 232 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1918  ABC transporter related  34.93 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2003  ABC transporter  41.23 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2288  ABC transporter, ATP-binding protein  41.23 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1272  ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1374  ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1446  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 232 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203975 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1280  ABC transporter related  37.99 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0061608  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1480  ABC transporter related  33.33 
 
 		 233 aa  155  7e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1664  ABC transporter related  38.32 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0364  ABC transporter related protein  32.62 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0098  ABC transporter related protein  34.72 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337151  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0632  ABC transporter related  37.28 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0450  ABC transporter, ATP-binding protein  33.05 
 
 		 285 aa  144  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1107  ABC-type transport system, ATPase component  34.68 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000157602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2336  ABC transporter related protein  33.91 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  35.02 
 
 		 291 aa  138  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2351  ABC transporter related  35.68 
 
 		 230 aa  138  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1823  ABC transporter related  35.58 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2983  ABC transporter, ATPase subunit  32.09 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0186  ABC transporter related  38.5 
 
 		 288 aa  134  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0170  ABC transporter related  31.74 
 
 		 227 aa  135  8e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0731  ABC transporter related  31.19 
 
 		 299 aa  134  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0987759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2462  ABC transporter related protein  33.95 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0414  ABC transporter related protein  33.66 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.541507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2621  ABC transporter related  32.71 
 
 		 296 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0684081  normal  0.242602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  36.11 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2249  ABC transporter related  31.22 
 
 		 299 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 309 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3242  ABC transporter related  30.23 
 
 		 299 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3965  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372577  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2243  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  32.26 
 
 		 293 aa  129  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  31.33 
 
 		 313 aa  128  8.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  35.71 
 
 		 306 aa  128  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  35.19 
 
 		 302 aa  128  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1233  ABC transporter related  37.5 
 
 		 236 aa  128  9.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.954644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  31.76 
 
 		 313 aa  128  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4298  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000106879  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01220  ABC transporter ATP-binding protein  31.92 
 
 		 291 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.295829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2909  ABC transporter-related protein  33.18 
 
 		 290 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000366915  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1383  putative ABC transporter ATP-binding protein; RBL01943  32.44 
 
 		 288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0134891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4352  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 290 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000295734  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  33.49 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  37.02 
 
 		 309 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4332  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000223791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4076  ABC transporter related  31.16 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00294748  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 		 313 aa  126  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2605  ABC transporter related  30.29 
 
 		 299 aa  126  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  36.28 
 
 		 298 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  36.11 
 
 		 309 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4241  ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 		 290 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4125  ABC transporter ATP-binding protein  31.16 
 
 		 290 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00364186  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3975  ABC transporter, ATP-binding protein  31.16 
 
 		 290 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00176043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4444  ABC transporter ATP-binding protein  31.16 
 
 		 290 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000946464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  32.56 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1558  ABC transporter related  32.08 
 
 		 288 aa  125  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0446  ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 287 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0856868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2608  ABC transporter related  32.23 
 
 		 283 aa  125  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 300 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  35.94 
 
 		 308 aa  125  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0982  ABC transporter related  32.68 
 
 		 295 aa  124  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  35.35 
 
 		 311 aa  124  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  33.18 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6592  ABC transporter, ATP-binding protein  30.95 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.761698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3573  ABC transporter, ATP-binding protein  29.17 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  33.18 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.11 
 
 		 337 aa  124  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0824  ABC transporter ATP-binding protein  31.31 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160205  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1360  ABC transporter related  36.28 
 
 		 287 aa  123  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0287844  normal  0.36471 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1331  ABC transporter related  35.41 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1172  ABC transporter, ATP-binding protein  31.31 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.775033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  35.35 
 
 		 305 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3574  ABC transporter related  33.02 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034962  hitchhiker  0.00545228 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  33.94 
 
 		 297 aa  122  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0437  ABC transporter  33.01 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.595645  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  35.19 
 
 		 308 aa  121  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.1 
 
 		 302 aa  121  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  35.58 
 
 		 316 aa  121  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  30.51 
 
 		 309 aa  121  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  32.73 
 
 		 307 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  35.94 
 
 		 329 aa  121  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 308 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>