More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4928 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4928  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase and related FAD-dependent oxidoreductase-like protein  100 
 
 		 123 aa  247  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1684  monooxygenase, FAD-binding  49.57 
 
 		 373 aa  114  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.750023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4828  hypothetical protein  47.79 
 
 		 376 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.454319 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  45 
 
 		 399 aa  103  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  48.15 
 
 		 376 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  55 
 
 		 371 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  42.37 
 
 		 374 aa  100  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  47.22 
 
 		 376 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3199  hypothetical protein  44.44 
 
 		 374 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  40.83 
 
 		 379 aa  97.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  39.82 
 
 		 376 aa  98.2  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  46.85 
 
 		 361 aa  96.7  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  37.01 
 
 		 376 aa  94  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3428  monooxygenase, FAD-binding  42.86 
 
 		 372 aa  92  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  37.17 
 
 		 376 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  48.35 
 
 		 377 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2552  monooxygenase FAD-binding protein  39.64 
 
 		 376 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  43.75 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0733  hypothetical protein  41.58 
 
 		 369 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1002  hypothetical protein  41.58 
 
 		 369 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.132346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2611  putative FAD-dependent monooxygenase  47.44 
 
 		 382 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.172271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  42.53 
 
 		 388 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  43.42 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  43.21 
 
 		 391 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  43.21 
 
 		 391 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  44.44 
 
 		 390 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3417  monooxygenase, FAD-binding  36.36 
 
 		 379 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0807578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0019  monooxygenase FAD-binding protein  45.45 
 
 		 384 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  44.87 
 
 		 382 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241073 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  40 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  40 
 
 		 374 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  42.5 
 
 		 389 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  37.11 
 
 		 399 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  44.44 
 
 		 382 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  43.42 
 
 		 395 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  59.62 
 
 		 369 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  46.05 
 
 		 392 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  44.44 
 
 		 388 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2705  monooxygenase, FAD-binding protein  43.43 
 
 		 423 aa  57.8  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  52.63 
 
 		 395 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21010  putative FAD-dependent monooxygenase  36.73 
 
 		 388 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.12929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0307  FAD dependent oxidoreductase  39.74 
 
 		 378 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823237 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  37.23 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  39.39 
 
 		 384 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  28.87 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  41.03 
 
 		 425 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  55.77 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  65.96 
 
 		 377 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  38.46 
 
 		 400 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  43.66 
 
 		 404 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2343  monooxygenase FAD-binding protein  40.54 
 
 		 392 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3023  monooxygenase, FAD-binding  40.24 
 
 		 425 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.367896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  36.47 
 
 		 397 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  28.87 
 
 		 377 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  35.05 
 
 		 413 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01733  oxidoreductase  42.86 
 
 		 267 aa  54.3  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  39.76 
 
 		 385 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2015  monooxygenase  29.55 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.520739  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  27.84 
 
 		 377 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  38.75 
 
 		 389 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  41.94 
 
 		 407 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03392  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17670)  43.24 
 
 		 710 aa  53.9  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.39217 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  42.86 
 
 		 422 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  40.28 
 
 		 426 aa  53.5  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  28.87 
 
 		 377 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  42.42 
 
 		 384 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  43.42 
 
 		 395 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  32.5 
 
 		 376 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3614  monooxygenase FAD-binding  60.78 
 
 		 378 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392094  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3524  monooxygenase FAD-binding protein  38.75 
 
 		 401 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  39.53 
 
 		 401 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  42.86 
 
 		 404 aa  52.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  32.5 
 
 		 376 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  44.26 
 
 		 429 aa  52.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  40.54 
 
 		 405 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  40.62 
 
 		 408 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  46.43 
 
 		 403 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  37.23 
 
 		 412 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  42.86 
 
 		 404 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3613  monooxygenase, FAD-binding  37.97 
 
 		 390 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.210857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  39.19 
 
 		 390 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  53.85 
 
 		 386 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  40.79 
 
 		 397 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  42.11 
 
 		 398 aa  51.6  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  34.48 
 
 		 374 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05260  conserved hypothetical protein  32.95 
 
 		 446 aa  51.2  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7505  monooxygenase FAD-binding  44.74 
 
 		 407 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  37.18 
 
 		 400 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  42 
 
 		 377 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  40 
 
 		 404 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2159  monooxygenase FAD-binding  41.77 
 
 		 402 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.429326  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  40.54 
 
 		 387 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03227  conserved hypothetical protein  37.89 
 
 		 504 aa  50.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  39.02 
 
 		 410 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7425  3-(3-hydroxyphenyl)propionate hydroxylase  35.29 
 
 		 503 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6172  hypothetical protein  52.73 
 
 		 417 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2184  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  37.65 
 
 		 389 aa  50.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  48.39 
 
 		 400 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  57.14 
 
 		 385 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  57.14 
 
 		 385 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>