58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3513 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3513  response regulator receiver protein  100 
 
 		 387 aa  751    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168461 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0071  response regulator receiver protein  23.64 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623542 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  27.33 
 
 		 439 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  28.86 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  28.86 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  28.86 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  26.06 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  28.86 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  28.86 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  28.86 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  28.86 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  28.52 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  27.74 
 
 		 412 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  24.65 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1654  putative pilus assembly protein, CpaE-like protein  27.24 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.735693 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  27.4 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  27.4 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  27.4 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  26.82 
 
 		 447 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  26.82 
 
 		 447 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  24.31 
 
 		 373 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1444  response regulator receiver protein  26.69 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4446  response regulator receiver protein  29.18 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  26.58 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2161  pilus assembly protein CpaE  25.83 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  0.0348695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2797  putative pilus assembly protein, CpaE-like  27.05 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.895149  normal  0.384116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2071  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.67 
 
 		 508 aa  66.2  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.19773  normal  0.734788 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  27.17 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  24.66 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  26.21 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  27.64 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  24.92 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  23.91 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  25.09 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0847  hypothetical protein  28.07 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  24.27 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  19.86 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2703  pilus assembly protein CpaE, putative  23.79 
 
 		 409 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.711069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.05 
 
 		 382 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2325  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  23.79 
 
 		 409 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.571647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  24.84 
 
 		 389 aa  53.1  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.97 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  26.71 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  24.31 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0647  pilus assembly protein CpaE  25.21 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  26.46 
 
 		 396 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2322  response regulator receiver domain protein (CheY-like)  25.62 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283577 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  25.07 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.13 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  21.12 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  20.68 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  23.05 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4870  hypothetical protein  26.2 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55900  hypothetical protein  26.04 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  24 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  25.74 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  24.29 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>