69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3072 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3072  thioesterase-like protein  100 
 
 		 145 aa  289  9e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2857  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.723517  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0476  thioesterase superfamily protein  42.36 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4823  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  29.08 
 
 		 297 aa  66.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  24.55 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  30 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1848  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149836  normal  0.418825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  27.52 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1781  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.32 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000346998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1742  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.32 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000282054  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2542  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.32 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000475401  hitchhiker  0.00000263931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.76 
 
 		 159 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1738  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.32 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000578703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  30.34 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0477  hypothetical protein  28.1 
 
 		 306 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  34.23 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  30.36 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1603  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.43 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000704517  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1215  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.93 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  27.34 
 
 		 496 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  24.32 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  24.79 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1846  thioesterase, putative  26.83 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0614  thioesterase-like  25 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  24.55 
 
 		 135 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 130 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 148 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  33.63 
 
 		 141 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2752  hypothetical protein  26.55 
 
 		 133 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1601  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 137 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 177 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  31.65 
 
 		 375 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.55 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000193862  normal  0.240329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2535  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.55 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000842763  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  27.21 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3318  thioesterase-like  25.81 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0744427  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2372  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.55 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.224754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4507  hypothetical protein  28.57 
 
 		 169 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5049  thioesterase-like protein  25.81 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5235  thioesterase-like protein  25.81 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  30.43 
 
 		 164 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.89 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  23.36 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1883  hypothetical protein  27.43 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.4 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  26.83 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  30.43 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  30.43 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  30.43 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  30.43 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  30.43 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  30.43 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2090  hypothetical protein  26.27 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000228869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  23.85 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5233  hypothetical protein  26.5 
 
 		 158 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>