164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1361 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1361  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  830    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.841061  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0427  hypothetical protein  40.96 
 
 		 499 aa  225  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.198884  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1440  hypothetical protein  39.89 
 
 		 409 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0895828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.37 
 
 		 629 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  39.44 
 
 		 648 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.04 
 
 		 646 aa  169  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.44 
 
 		 662 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2805  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.85 
 
 		 674 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  36 
 
 		 718 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.4 
 
 		 672 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.69 
 
 		 670 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.4 
 
 		 668 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  32.81 
 
 		 614 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0671  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.75 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.83 
 
 		 654 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.24 
 
 		 716 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.49 
 
 		 724 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.49 
 
 		 730 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.44 
 
 		 624 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 559 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  35.99 
 
 		 811 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 560 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6864  hypothetical protein  34.59 
 
 		 702 aa  146  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337654  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.19 
 
 		 636 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  35.27 
 
 		 656 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  35.95 
 
 		 572 aa  145  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.19 
 
 		 637 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.3 
 
 		 565 aa  144  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  35.47 
 
 		 631 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.06 
 
 		 526 aa  143  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.4 
 
 		 547 aa  143  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.34 
 
 		 500 aa  142  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.87 
 
 		 563 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41210  petidoglycan binding protein  34.94 
 
 		 530 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.052034  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.6 
 
 		 775 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.39 
 
 		 566 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  34.27 
 
 		 558 aa  138  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1800  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.85 
 
 		 549 aa  136  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.081998  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  35.06 
 
 		 563 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1328  hypothetical protein  36.6 
 
 		 539 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  37.89 
 
 		 523 aa  135  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  33.97 
 
 		 563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2331  hypothetical protein  37.05 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  33 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1861  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.47 
 
 		 539 aa  132  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  34.26 
 
 		 546 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  32.34 
 
 		 661 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6595  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.43 
 
 		 553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.775034 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  35.51 
 
 		 546 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  31.85 
 
 		 568 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.51 
 
 		 546 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.63 
 
 		 560 aa  131  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1223  hypothetical protein  35.51 
 
 		 318 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.09 
 
 		 595 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01179  putative periplasmic protein  32.24 
 
 		 410 aa  129  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.383601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.88 
 
 		 549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  35.12 
 
 		 615 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  35.12 
 
 		 615 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  35.12 
 
 		 615 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.12 
 
 		 615 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1780  hypothetical protein  34.85 
 
 		 576 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0104141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  35.12 
 
 		 611 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  35.12 
 
 		 615 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  35.12 
 
 		 615 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  35.12 
 
 		 615 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  35.12 
 
 		 615 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  34.85 
 
 		 575 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2377  hypothetical protein  32.65 
 
 		 483 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 544 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  35.34 
 
 		 536 aa  126  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.37 
 
 		 602 aa  126  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.47 
 
 		 549 aa  126  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  31.45 
 
 		 571 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.76 
 
 		 556 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.74 
 
 		 590 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.85 
 
 		 625 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1028  hypothetical protein  33.98 
 
 		 615 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0304813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1444  hypothetical protein  35.16 
 
 		 607 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.354174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  33.98 
 
 		 616 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.74 
 
 		 586 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1001  hypothetical protein  33.98 
 
 		 615 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.040014  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1093  hypothetical protein  33.98 
 
 		 606 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.565365  normal  0.428912 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2109  hypothetical protein  33.33 
 
 		 502 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2563  hypothetical protein  33.98 
 
 		 618 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593956  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1110  hypothetical protein  33.98 
 
 		 615 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.360324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1973  hypothetical protein  33.98 
 
 		 596 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.221768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2654  hypothetical protein  33.98 
 
 		 618 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.334629  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  32.71 
 
 		 598 aa  124  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1660  hypothetical protein  34.84 
 
 		 563 aa  124  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.55 
 
 		 535 aa  123  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.89 
 
 		 540 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3376  hypothetical protein  34.55 
 
 		 537 aa  123  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.925793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.05 
 
 		 560 aa  123  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.05 
 
 		 560 aa  123  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.84 
 
 		 599 aa  122  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1726  hypothetical protein  34.75 
 
 		 613 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.131487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.4 
 
 		 560 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0041  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.58 
 
 		 506 aa  121  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0945132  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  32.94 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.97 
 
 		 571 aa  119  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.385253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>